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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G352550
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 86858645-86861112 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1919 bp · TkA03G352550|TK1151|cDNA

CCCACCCCAGCCAAAAGGAATCGCCAGCAGTCCAGCTGTTGGTGGCCTTCCTCTATATATTATTACCACTTCAAACCCTTGCCGTATCACACAAACAGATTACTATACTCCCTCTTTCTCTCACCCTACTACCTGCTACTCTTTTGTCCACTTTCTTCTTTTCTTCATCTGGGAGCTGAAATCCCGACGAATTCTGTTATGATGGGTGTGACCAATAGGTGCTCACATACTTCCCATATCACCGAGATCATCATCACCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

978 bp · TkA03G352550|TK1151|CDS

ATGGCAGCTCGGAGCTTTCTCTACGGCGGCAATTCTGGTGGTGGAGCCGGCGGTTTTAACTCTGTTCTGCTAACAAACAAGAGGGCGATTTCTTCTTCTTCTTCTAAACCTCTTGATTCCTTCTTCGTTTCTGGATCATCTCATTCTTTTGCAGGTTCTAGATCAATGGTTAGCTTTGAGGACGGAGGAAACGGATCAGGAAGGAGCTTTTTTCAGCCGTTCGATCAGGAAGACAATGGCGATGATGAATACGACGACTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

325 aa · TkA03G352550|TK1151|PROTEIN

MAARSFLYGGNSGGGAGGFNSVLLTNKRAISSSSSKPLDSFFVSGSSHSFAGSRSMVSFEDGGNGSGRSFFQPFDQEDNGDDEYDDYLQQPEKKRRLKSDQVQFLEKSFETDNKLEPDRKIQLAKDLGLQPRQIAIWFQNRRARWKTKQLEKDYDVLQESFNELKSKYDNLLQEKEKLKSEVHDLSDKLLLQEMEKGTSDSSSTKSPSEPLQQEQAADCLNDEDHISKTSIVDVNSDLTGSSSPRYADLLERGNSSYLFE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G352550
TK1151 IDTkA03G352550
OH-1004 IDLXL04_008618
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G352550
位置Chr03:86858645-86861112 (-)
描述Similar to HAT5: Homeobox-leucine zipper protein HAT5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01470 可能参与叶发育的转录激活子。
Ectopic expression of the Arabidopsis transcriptional activator Athb-1 alters leaf cell fate in tobacco.1995 · DOI: 10.1105/tpc.7.11.1773
At1g69780 可能作为蔗糖信号通路作用的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XD08 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os03g0170600 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XDD6 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008618 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048826 cotyledon morphogenesis 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69780
ath:AT3G01470
dosa:Os02g0729700
dosa:Os08g0481400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.976
排名 1 · TkA03G352550 · TK1151
细胞质0.088
排名 2 · TkA03G352550 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA03G352550 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA03G352550 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA03G352550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20492ERM_helical92-120 aa
PF00046Homeodomain93-146 aa
PF25450Rab11-FIP398-107 aa
PF25785TPR99-112 aa
PF01496V_ATPase_I101-216 aa
PF21074GDH_C105-178 aa
PF05920Homeobox_KN117-144 aa
PF20492ERM_helical139-201 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G352550PF20492ERM_helical921206.17.6
TkA03G352550PF00046Homeodomain931465.8e-1762.0
TkA03G352550PF25450Rab11-FIP3981070.003418.4
TkA03G352550PF25785TPR991122.49.2
TkA03G352550PF01496V_ATPase_I1012161.57.3
TkA03G352550PF21074GDH_C1051780.01515.2
TkA03G352550PF05920Homeobox_KN1171440.0001422.4
TkA03G352550PF20492ERM_helical1392016.17.6
TkA03G352550PF29075NOCA1_mid1412120.009216.6
TkA03G352550PF06428Sec2p1431890.00418.0
TkA03G352550PF00170bZIP_11431830.1413.0
TkA03G352550PF25785TPR1432082.49.2
TkA03G352550PF25450Rab11-FIP31441900.003418.4
TkA03G352550PF06156YabA1472060.005318.0
TkA03G352550PF07851TMEM120A-B1472482.08.3
TkA03G352550PF02183HALZ1481895.4e-1452.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q02283拟南芥sp|Q02283|HAT5_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT562.400%Swiss-Prot低置信
Q8LC03拟南芥sp|Q8LC03|ATB13_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-1373.800%Swiss-Prot低置信
A2XD08水稻sp|A2XD08|HOX21_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX2162.200%Swiss-Prot低置信
Q8S7W9水稻sp|Q8S7W9|HOX21_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX2162.200%Swiss-Prot低置信
A2XDD6水稻sp|A2XDD6|HOX13_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1358.600%Swiss-Prot低置信

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