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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G206110
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 51716015-51722640 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2836 bp · TkA03G206110|TK1151|cDNA

TGAAACGACAACTTTTCGGAAACCAGATGGACCAATGTGAAAGTTTCAGCTGTAGCAGTGATTCAGGAGTAGCTGTGTCACACGTAGTCGTCCCCCATTTCTCTTCCTCTAAATCGGTAATCGAATGCAAATAGTCTACTTCGAATATTGATATTGACAGGCGATTGTACTCGGTATCTTGCATTTCTGTTAGAAATTGAAGTAAAAAACAATGTGGAAACTGAAGATCGCGGAGGGAGGGAGTCCATGGTTACGTTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2277 bp · TkA03G206110|TK1151|CDS

ATGTGGAAACTGAAGATCGCGGAGGGAGGGAGTCCATGGTTACGTTCGTTAAACGATCACGTCGGCCGACAATTTTGGGAGTTTGATCCCACGCTAGGGTCCCTTGAGGAACTCGCCGATATCGAGAAAGTTCGACAGACGTTCCATGAAAATCGGTTCGAGAAAAAACACAGCTCAGATCTACTTATGCGCAGTCAGTTTGCAAAAGAGAAGTCACTCACTGTATTCCCACCAAGAGTGAATATAAAAGATGCAGAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

758 aa · TkA03G206110|TK1151|PROTEIN

MWKLKIAEGGSPWLRSLNDHVGRQFWEFDPTLGSLEELADIEKVRQTFHENRFEKKHSSDLLMRSQFAKEKSLTVFPPRVNIKDAEDITEEKVTNVLRRAIAFHSTLQADDGHWPGDYGGPMFLLPGLVITLTITGALNAVLSKEHKREICRYLYNHQNRDGGWGLHIEGHSTMFGSALNYVTLRLLGEGANDGEGAMEKGRKWILDHGGATSITSWGKFWLSVLGVFEWSGNNPLPPEMWVLPYFLPVHPGRMWCHCRM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G206110
TK1151 IDTkA03G206110
OH-1004 IDLXL04_007686
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)96.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G206110
位置Chr03:51716015-51722640 (+)
描述Similar to OSCPNX1: Cycloartenol Synthase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g07050 将氧化角鲨烯转化为环木菠萝烯醇和 1% 帕克酚。
Allelic mutant series reveal distinct functions for Arabidopsis cycloartenol synthase 1 in cell viability and plastid biogenesis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0712190105
Isolation of an Arabidopsis thaliana gene encoding cycloartenol synthase by functional expression in a yeast mutant lacking lanosterol synthase by the use of a chromatographic screen.1993 · DOI: 10.1073/pnas.90.24.11628

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007686 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0010686 tetracyclic triterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016104 triterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016126 sterol biosynthetic process 生物过程
GO:0019745 pentacyclic triterpenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005811 lipid droplet 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0016871 cycloartenol synthase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G07050
rcu:8262543
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.321
排名 1 · TkA03G206110 · TK1151
内质网0.235
排名 2 · TkA03G206110 · TK1151
细胞质0.168
排名 3 · TkA03G206110 · TK1151
过氧化物酶体0.102
排名 4 · TkA03G206110 · TK1151
细胞膜0.076
排名 5 · TkA03G206110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13243SQHop_cyclase_C89-170 aa
PF09492Pec_lyase90-118 aa
PF13249SQHop_cyclase_N99-399 aa
PF00432Prenyltrans128-188 aa
PF07678TED_complement146-164 aa
PF09492Pec_lyase148-164 aa
PF13243SQHop_cyclase_C413-750 aa
PF00432Prenyltrans416-457 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G206110PF13243SQHop_cyclase_C891706.1e-54183.9
TkA03G206110PF09492Pec_lyase901180.00516.9
TkA03G206110PF13249SQHop_cyclase_N993997.1e-42144.3
TkA03G206110PF00432Prenyltrans1281883.3e-0730.7
TkA03G206110PF07678TED_complement1461640.001718.2
TkA03G206110PF09492Pec_lyase1481640.00516.9
TkA03G206110PF13243SQHop_cyclase_C4137506.1e-54183.9
TkA03G206110PF00432Prenyltrans4164573.3e-0730.7
TkA03G206110PF13249SQHop_cyclase_N5055337.1e-42144.3
TkA03G206110PF00432Prenyltrans5087133.3e-0730.7
TkA03G206110PF07678TED_complement5085380.001718.2
TkA03G206110PF09492Pec_lyase5656070.00516.9
TkA03G206110PF13249SQHop_cyclase_N5866087.1e-42144.3
TkA03G206110PF07678TED_complement6017140.001718.2
TkA03G206110PF13249SQHop_cyclase_N6376567.1e-42144.3
TkA03G206110PF09492Pec_lyase6376630.00516.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P38605拟南芥sp|P38605|CAS1_ARATH Cycloartenol synthase79.200%Swiss-Prot高置信

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