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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G157430
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 39940143-39943508 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1188 bp · TkA03G157430|TK1151|cDNA

TTTCTCGTAGTTGATGATCCACAAGAAAGTCGCAAAGCTATAAATGCTTGTTCGCTGGTGGTTTTCCATTGGGTTTCTTCTTTTCTCTTAACGACGAAAGTTAAAGATTTCTTCACCCCTGCAGTTCCTGTGATTATTGGGAATGTCTTCTCTGCAATTTTCACCTTCTTCTTCGCATTAGTTGGGACTTTATTAGGGGCGATGACTGGGGCCTTAATAGGTCAAGAAACCGAGAGTGGATTTGTTAGAGGAGCTGCAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

735 bp · TkA03G157430|TK1151|CDS

TTTCTCGTAGTTGATGATCCACAAGAAAGTCGCAAAGCTATAAATGCTTGTTCGCTGGTGGTTTTCCATTGGGTTTCTTCTTTTCTCTTAACGACGAAAGTTAAAGATTTCTTCACCCCTGCAGTTCCTGTGATTATTGGGAATGTCTTCTCTGCAATTTTCACCTTCTTCTTCGCATTAGTTGGGACTTTATTAGGGGCGATGACTGGGGCCTTAATAGGTCAAGAAACCGAGAGTGGATTTGTTAGAGGAGCTGCAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

244 aa · TkA03G157430|TK1151|PROTEIN

FLVVDDPQESRKAINACSLVVFHWVSSFLLTTKVKDFFTPAVPVIIGNVFSAIFTFFFALVGTLLGAMTGALIGQETESGFVRGAAVGAISGAVFSIEVFESSLVLWKSDESGIGCLLYLIDVIVSLLSGRLVRDRIGPAMLSAVQSQMGAIETGFDDLHSIFDIGGSKGLPEYSVDKIPKIEITSDNDVDDTGERVSCSVCLQDFQLGETVRSLPQCHHMFHLPCIDKWLVRHGSCPLCRRDI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G157430
TK1151 IDTkA03G157430
OH-1004 IDLXL04_013838
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)83.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.115 / OH-1004 71.192
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G157430
位置Chr03:39940143-39943508 (-)
描述Similar to NIP2: NEP1-interacting protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17730 内在类囊体膜蛋白，将 RPOT2 固定在类囊体膜的基质侧。 暂无已核实直接文献
At4g35840 内在类囊体膜蛋白，将 RPOT2 固定在类囊体膜的基质侧。 暂无已核实直接文献
At5g66070 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At1g74410 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At2g18670 RING-H2 指状蛋白 ATL56。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013838 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006513 protein monoubiquitination 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0051865 protein autoubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0042170 plastid membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G74410
ath:AT2G17450
ath:AT2G17730
ath:AT4G35840
ath:AT5G66070
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.364
排名 1 · TkA03G157430 · TK1151
高尔基体0.225
排名 2 · TkA03G157430 · TK1151
细胞质0.179
排名 3 · TkA03G157430 · TK1151
溶酶体／液泡0.160
排名 4 · TkA03G157430 · TK1151
细胞核0.153
排名 5 · TkA03G157430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13639zf-RING_211-24 aa
PF23413zf_RING_Vps8_fungal12-22 aa
PF17647DUF551843-110 aa
PF06897DUF126947-80 aa
PF31172Gly-zipper_C13G5-252-95 aa
PF21724DUF686152-100 aa
PF29034SDH656-111 aa
PF13436Gly-zipper_OmpA59-95 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G157430PF13639zf-RING_211241.6e-1351.4
TkA03G157430PF23413zf_RING_Vps8_fungal12220.6910.0
TkA03G157430PF17647DUF5518431100.05214.4
TkA03G157430PF06897DUF126947801.59.9
TkA03G157430PF31172Gly-zipper_C13G5-252950.01316.2
TkA03G157430PF21724DUF6861521000.211.8
TkA03G157430PF29034SDH6561110.2512.2
TkA03G157430PF13436Gly-zipper_OmpA59954.8e-0523.8
TkA03G157430PF13488Gly-zipper_Omp59780.0001322.4
TkA03G157430PF06897DUF126959981.59.9
TkA03G157430PF13441Gly-zipper_YMGG60948.1e-0626.5
TkA03G157430PF27527Y2009_N60740.08713.3
TkA03G157430PF10247Romo160746.38.0
TkA03G157430PF13488Gly-zipper_Omp61940.0001322.4
TkA03G157430PF05433Rick_17kDa_Anti62940.006417.0
TkA03G157430PF10247Romo178966.38.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GT74拟南芥sp|Q8GT74|NIP2_ARATH NEP1-interacting protein 272.700%Swiss-Prot高置信
Q8GT75拟南芥sp|Q8GT75|NIP1_ARATH NEP1-interacting protein 172.400%Swiss-Prot高置信
Q9FKX5拟南芥sp|Q9FKX5|NIPL1_ARATH NEP1-interacting protein-like 175.500%Swiss-Prot高置信
Q8LBA0拟南芥sp|Q8LBA0|NIPL2_ARATH NEP1-interacting protein-like 234.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZV51拟南芥sp|Q9ZV51|ATL56_ARATH RING-H2 finger protein ATL5635.100%Swiss-Prot低置信

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