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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G123550
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 31600295-31601755 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1134 bp · TkA03G123550|TK1151|cDNA

GTTTCTCACGGGAAGTCTTGTTTATTCAACGAAGGGGGTCAATTTGAGATCGGGAAGATAGCGACCGTTCAAAAGGCGAGCCCTATCAATAATTCAGTGTTCGTCCGTCTTTGCCTCTTTGCCCTACTCTCTTCTTCCCGCTCGACCGTTCAAGAACAGGAGCCCTATCGCGACACTTCTCTGCTGCTCCGGTGCTCTGCTGCTCCGCTTCTCTGCTGCTCGTCTGCTTCTCTGTTGCTCCGCTTCTCTGCTCGTGATCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1134 bp · TkA03G123550|TK1151|CDS

GTTTCTCACGGGAAGTCTTGTTTATTCAACGAAGGGGGTCAATTTGAGATCGGGAAGATAGCGACCGTTCAAAAGGCGAGCCCTATCAATAATTCAGTGTTCGTCCGTCTTTGCCTCTTTGCCCTACTCTCTTCTTCCCGCTCGACCGTTCAAGAACAGGAGCCCTATCGCGACACTTCTCTGCTGCTCCGGTGCTCTGCTGCTCCGCTTCTCTGCTGCTCGTCTGCTTCTCTGTTGCTCCGCTTCTCTGCTCGTGATCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

377 aa · TkA03G123550|TK1151|PROTEIN

VSHGKSCLFNEGGQFEIGKIATVQKASPINNSVFVRLCLFALLSSSRSTVQEQEPYRDTSLLLRCSAAPLLCCSSASLLLRFSARDRLTVRLRKKTLFWLDSALKFLVDMDFKVGQPIEIIAEGSGFSSSYYTGTVVQLYNDYHGRVAVRYDKVKDYNGNPLVDDLPKEDLRPVAPKVDVKLETNDIVNAWDGEGWRNGKLIQIAGNLYTVDLGSESDPKIDVFRKKHLRINQRWQMNVDFLVGSRVEIVGFEAGMTNSY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G123550
TK1151 IDTkA03G123550
OH-1004 IDLXL04_039589
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)86.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 84.615 / OH-1004 27.589
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G123550
位置Chr03:31600295-31601755 (+)
描述Similar to AGDP1: Protein AGENET DOMAIN (AGD)-CONTAINING P1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039589 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程
GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分
GO:0000792 heterochromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0042393 histone binding 分子功能
GO:0140566 histone reader activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.467
排名 1 · TkA03G123550 · TK1151
细胞核0.447
排名 2 · TkA03G123550 · TK1151
细胞膜0.086
排名 3 · TkA03G123550 · TK1151
内质网0.079
排名 4 · TkA03G123550 · TK1151
线粒体0.069
排名 5 · TkA03G123550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00018SH3_1109-123 aa
PF05641Agenet115-176 aa
PF18115Tudor_3126-152 aa
PF21743PTM_DIR17_Tudor127-152 aa
PF23327Chromo_MORC2_6th129-154 aa
PF05641Agenet194-230 aa
PF24252CdrL_M238-248 aa
PF05641Agenet244-301 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G123550PF00018SH3_11091230.212.0
TkA03G123550PF05641Agenet1151768.8e-2071.7
TkA03G123550PF18115Tudor_31261520.003817.8
TkA03G123550PF21743PTM_DIR17_Tudor1271521.79.2
TkA03G123550PF23327Chromo_MORC2_6th1291547.9e-0523.0
TkA03G123550PF05641Agenet1942308.8e-2071.7
TkA03G123550PF24252CdrL_M2382480.2612.3
TkA03G123550PF05641Agenet2443018.8e-2071.7
TkA03G123550PF23327Chromo_MORC2_6th2532807.9e-0523.0
TkA03G123550PF18115Tudor_32552790.003817.8
TkA03G123550PF21743PTM_DIR17_Tudor2582791.79.2
TkA03G123550PF24252CdrL_M2933100.2612.3
TkA03G123550PF11302DUF31043073320.1712.4
TkA03G123550PF00018SH3_13073280.212.0
TkA03G123550PF23327Chromo_MORC2_6th3103347.9e-0523.0
TkA03G123550PF05641Agenet3113398.8e-2071.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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