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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G054310
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 14087492-14089972 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1830 bp · TkA03G054310|TK1151|cDNA

ATGCAAGAGCCGGAGGTTGAAAGCGGACATGACAAAGAGCACACGGTTACTCCAAATGAAAATACATCAACTCAAAATCAAACTGAAAGTGAGAGAGAAAGAAACAACGAAACTGTCGAAGATGAAGTGCAGTTGAAGCGAAAACGACAAAAAACATCAAAAGTATGGAATGATATGACTGTAATTACACTTAGTAATGGTACGAAAAAAGCCCAATGTAATCATTGCAAGACAAAGTTGGCTTATGTCGATTCGGGGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · TkA03G054310|TK1151|CDS

ATGCAAGAGCCGGAGGTTGAAAGCGGACATGACAAAGAGCACACGGTTACTCCAAATGAAAATACATCAACTCAAAATCAAACTGAAAGTGAGAGAGAAAGAAACAACGAAACTGTCGAAGATGAAGTGCAGTTGAAGCGAAAACGACAAAAAACATCAAAAGTATGGAATGATATGACTGTAATTACACTTAGTAATGGTACGAAAAAAGCCCAATGTAATCATTGCAAGACAAAGTTGGCTTATGTCGATTCGGGGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

609 aa · TkA03G054310|TK1151|PROTEIN

MQEPEVESGHDKEHTVTPNENTSTQNQTESERERNNETVEDEVQLKRKRQKTSKVWNDMTVITLSNGTKKAQCNHCKTKLAYVDSGATSSFKRHLSSCIPHKEWQKNQKLLNFQPVDSDVESVEPLITLNGKYDANKMREATANWILSTEQPFTTVEDDMFVKMMRTGNPLYEKVSRVTTKEDCFNVYNHEKKKLKALTKAASKICLTTDCWKSTHQKIEYMVITAHFIDQNWRLQKRVLSFVHVPPPRTGIDIADGIYK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G054310
TK1151 IDTkA03G054310
OH-1004 IDLXL04_008846
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)87.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.507 / OH-1004 92.647
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G054310
位置Chr03:14087492-14089972 (+)
描述Similar to Os03g0733400: Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g42170 类转座酶蛋白，对植物生长发育至关重要。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0518400 类转座酶蛋白，对植物生长发育至关重要。 暂无已核实直接文献
Os05g0239150 类转座酶蛋白，对植物生长发育至关重要。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008846 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0032196 transposition 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0046983 protein dimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G42170
dosa:Os03g0733400
dosa:Os05g0239150
dosa:Os05g0583200
osa:4339741
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.934
排名 1 · TkA03G054310 · TK1151
细胞质0.131
排名 2 · TkA03G054310 · TK1151
线粒体0.029
排名 3 · TkA03G054310 · TK1151
细胞膜0.015
排名 4 · TkA03G054310 · TK1151
细胞外0.009
排名 5 · TkA03G054310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10238Eapp_C19-92 aa
PF22135Cwp8_D319-49 aa
PF25999SYNRG_C39-86 aa
PF02892zf-BED67-98 aa
PF27041ZBED1_RNase-like102-120 aa
PF26742DUF8247202-269 aa
PF27041ZBED1_RNase-like208-304 aa
PF14372hAT-like_RNase-H213-226 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G054310PF10238Eapp_C19920.02515.8
TkA03G054310PF22135Cwp8_D319490.1713.0
TkA03G054310PF25999SYNRG_C39860.02915.1
TkA03G054310PF02892zf-BED67980.0003221.4
TkA03G054310PF27041ZBED1_RNase-like1021203.8e-31107.8
TkA03G054310PF26742DUF82472022695.2e-0730.3
TkA03G054310PF27041ZBED1_RNase-like2083043.8e-31107.8
TkA03G054310PF14372hAT-like_RNase-H2132267.1e-31107.0
TkA03G054310PF30527DnaJ_cyano_C2343000.1512.6
TkA03G054310PF25999SYNRG_C3354110.02915.1
TkA03G054310PF02892zf-BED3363460.0003221.4
TkA03G054310PF14372hAT-like_RNase-H3504407.1e-31107.0
TkA03G054310PF27041ZBED1_RNase-like3513823.8e-31107.8
TkA03G054310PF25958DUF79953884630.1113.4
TkA03G054310PF26742DUF82473984405.2e-0730.3
TkA03G054310PF30527DnaJ_cyano_C4274510.1512.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2N5拟南芥sp|Q9M2N5|DSLE_ARATH Zinc finger BED domain-containing protein DAYSLEEPER26.500%Swiss-Prot低置信
Q0JMB2水稻sp|Q0JMB2|RSLE4_ORYSJ Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 427.500%Swiss-Prot低置信
B9FJG3水稻sp|B9FJG3|RSLE1_ORYSJ Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 137.100%Swiss-Prot低置信

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