TkA03G043670 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G043670

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 11497124-11498536 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

673 bp · TkA03G043670|TK1151|cDNA

CAACCGCATGTAAATTTAGCATCAAACATTCCCCATCCATTTTCATTTAAATTTCTTCGTCTTTCCTCATCTTCCTGCAATCTCAATTTGATTTCTCTCCTGATTTGATCTACTGCAGAAATGGGCCGAGGTGTAAGCTGTGGCGGAGGACAGAGTTCTTTAGGTTACTTATTGGGTGGTACTGGTCCAGAAGCAGAAACCGACGGGAATGCTCCACCGCCACCAGAGAACCCCACCGATAATGCAACCACCGAGCCTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

375 bp · TkA03G043670|TK1151|CDS

ATGGGCCGAGGTGTAAGCTGTGGCGGAGGACAGAGTTCTTTAGGTTACTTATTGGGTGGTACTGGTCCAGAAGCAGAAACCGACGGGAATGCTCCACCGCCACCAGAGAACCCCACCGATAATGCAACCACCGAGCCTACTAAGGATTCTCCAGAACCTTCCGCCGAGGAGGCTTCTGAGCAGCCACCTGAAGCTTTAAACGTAAACAAAGAAAATCAGCCTGCTGAACCTACCGACGGTACAACAAACAATTACCACAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

124 aa · TkA03G043670|TK1151|PROTEIN

MGRGVSCGGGQSSLGYLLGGTGPEAETDGNAPPPPENPTDNATTEPTKDSPEPSAEEASEQPPEALNVNKENQPAEPTDGTTNNYHRADGQNCGNFITNRPSTRVHAAPGGNSSLGYLFGDEKK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G043670`
TK1151 ID	TkA03G043670
OH-1004 ID	LXL04_006506
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G043670

位置 Chr03:11497124-11498536 (-)

描述 Similar to SP1L1: Protein SPIRAL1-like 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g26355`	与SPR1冗余作用，维持对各向异性细胞生长至关重要的皮质微管组织。	暂无已核实直接文献
`At5g15600`	与SPR1冗余作用，维持对各向异性细胞生长至关重要的皮质微管组织。	暂无已核实直接文献
`At1g69230`	与SPR1冗余作用，维持对各向异性细胞生长至关重要的皮质微管组织。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0417800`	在维持皮质微管组织中起作用，这对于各向异性细胞生长至关重要。	暂无已核实直接文献
`Os11g0629400`	在维持皮质微管组织中起作用，这对于各向异性细胞生长至关重要。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006506 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程

GO:0051211 anisotropic cell growth 生物过程

GO:0071472 cellular response to salt stress 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005876 spindle microtubule 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009524 phragmoplast 细胞组分

GO:0009574 preprophase band 细胞组分

GO:0010005 cortical microtubule, transverse to long axis 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G26355

ath:AT1G69230

ath:AT2G03680

ath:AT5G15600

dosa:Os03g0417800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.754

排名 1 · TkA03G043670 · TK1151

细胞核0.249

排名 2 · TkA03G043670 · TK1151

细胞膜0.125

排名 3 · TkA03G043670 · TK1151

线粒体0.063

排名 4 · TkA03G043670 · TK1151

高尔基体0.050

排名 5 · TkA03G043670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`B3H4F1`	拟南芥	sp\|B3H4F1\|SP1L1_ARATH Protein SPIRAL1-like 1	48.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LF22`	拟南芥	sp\|Q9LF22\|SP1L4_ARATH Protein SPIRAL1-like 4	56.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LE54`	拟南芥	sp\|Q9LE54\|SP1L2_ARATH Protein SPIRAL1-like 2	45.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q7Y1L9`	水稻	sp\|Q7Y1L9\|SP1L1_ORYSJ Protein SPIRAL1-like 1	62.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q2R0W8`	水稻	sp\|Q2R0W8\|SP1L2_ORYSJ Protein SPIRAL1-like 2	54.500%	Swiss-Prot	高置信

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