RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G023490
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 6064090-6064926 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

507 bp · TkA03G023490|TK1151|cDNA

ATGGCCATTCAAGACTCCTTCAAACCTCATCCAACCGATATCTACTTACTCACACTACCAAAATCCGGCACAACGTGGGTCAAGGCCGTCATGTTTGCTACCGTGAACCGCAGAACCCGACCGAAAGATGTTATAGTGTCTTGGTATTACTTTTCAAACAAGTTCACTCAAAAGAATCTAGCCCCGATGACTATTGATGAGATGATTGAGGAGGTTATGAAGAAGGATACTTTGAATCAAGTAAAGCGGATTGCGCAGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

507 bp · TkA03G023490|TK1151|CDS

ATGGCCATTCAAGACTCCTTCAAACCTCATCCAACCGATATCTACTTACTCACACTACCAAAATCCGGCACAACGTGGGTCAAGGCCGTCATGTTTGCTACCGTGAACCGCAGAACCCGACCGAAAGATGTTATAGTGTCTTGGTATTACTTTTCAAACAAGTTCACTCAAAAGAATCTAGCCCCGATGACTATTGATGAGATGATTGAGGAGGTTATGAAGAAGGATACTTTGAATCAAGTAAAGCGGATTGCGCAGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

168 aa · TkA03G023490|TK1151|PROTEIN

MAIQDSFKPHPTDIYLLTLPKSGTTWVKAVMFATVNRRTRPKDVIVSWYYFSNKFTQKNLAPMTIDEMIEEVMKKDTLNQVKRIAQFLGCPFSKEEETEGCVEEIMRLCSLEVLKEVNKDGEYSEGVPNAVFFREGKVGGWRDDLTDEMSKTLDDITNEKFQDLGILF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G023490
TK1151 IDTkA03G023490
OH-1004 IDLXL04_006268
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)56.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 79.143
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G023490
位置Chr03:6064090-6064926 (-)
描述Similar to SOT13: Cytosolic sulfotransferase 13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g03750 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。 暂无已核实直接文献
At3g45070 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 作为磺酸盐供体，特异性催化黄酮和黄酮醇的硫酸盐缀合。
Biochemical and molecular characterization of flavonoid 7-sulfotransferase from Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2006.10.004
At1g28170 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。 暂无已核实直接文献
At3g45080 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。 暂无已核实直接文献
At5g43690 磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006268 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009806 lignan metabolic process 生物过程
GO:0009812 flavonoid metabolic process 生物过程
GO:0016131 brassinosteroid metabolic process 生物过程
GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0032260 response to jasmonic acid stimulus involved in jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0051923 sulfation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G74100
ath:AT2G03760
ath:AT2G03770
ath:AT3G45070
ath:AT5G07010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.552
排名 1 · TkA03G023490 · TK1151
内质网0.183
排名 2 · TkA03G023490 · TK1151
过氧化物酶体0.143
排名 3 · TkA03G023490 · TK1151
细胞核0.102
排名 4 · TkA03G023490 · TK1151
线粒体0.040
排名 5 · TkA03G023490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00685Sulfotransfer_111-38 aa
PF13469Sulfotransfer_314-31 aa
PF25880WHD_CHMP7_1st39-78 aa
PF26946ACT_1139-79 aa
PF00685Sulfotransfer_141-72 aa
PF00685Sulfotransfer_171-165 aa
PF13469Sulfotransfer_373-93 aa
PF25880WHD_CHMP7_1st108-123 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G023490PF00685Sulfotransfer_111382.4e-2693.4
TkA03G023490PF13469Sulfotransfer_314310.2912.1
TkA03G023490PF25880WHD_CHMP7_1st39780.02814.8
TkA03G023490PF26946ACT_1139790.2612.3
TkA03G023490PF00685Sulfotransfer_141722.4e-2693.4
TkA03G023490PF00685Sulfotransfer_1711652.4e-2693.4
TkA03G023490PF13469Sulfotransfer_373930.2912.1
TkA03G023490PF25880WHD_CHMP7_1st1081230.02814.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RV79拟南芥sp|Q8RV79|SOT11_ARATH Cytosolic sulfotransferase 1145.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M1V2拟南芥sp|Q9M1V2|SOT5_ARATH Cytosolic sulfotransferase 549.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FZ91拟南芥sp|Q9FZ91|SOT7_ARATH Cytosolic sulfotransferase 727.900%Swiss-Prot低置信
Q9M1V1拟南芥sp|Q9M1V1|SOT6_ARATH Cytosolic sulfotransferase 649.500%Swiss-Prot中等置信
Q9FG94拟南芥sp|Q9FG94|SOT1_ARATH Cytosolic sulfotransferase 126.200%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看