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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G612570
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 158002694-158005292 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1003 bp · TkA02G612570|TK1151|cDNA

AAACTAACTCTGCCGTTCTAAAAAAAAAAAAAAATTATTATACTTTTGTGATTATCTAGAAGAATTAACAGCAGTAAAAAGACGAAAAAGGCCTTGTCTCGAATCTATCCGTTTGGGGTGGTGTCACGTGATCTGCCTCACCGGTCTCGCCGGGACTACGGATATGTACCCTATCACCATCACCTCCATCAACCATCCTCGTGTCATCTCTCCCATCATTGCATTTAAAGGTTTCACGATTTCGTACTTGTAAATCTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

600 bp · TkA02G612570|TK1151|CDS

ATGTCTCAGTGCTTAGAGGGGGTCAAGCATTTACTTGCTTCCCTGCTCCATTGCTGTGATCTTGAAGCATACAAACAATTAACAGCACTTGAAGATCCCGAAATTCTAGCCAGAGAGACAGTTTTTAGTGTAAGTGAAATAGAAGCACTTTATGAGTTATTTAAGAAGATTAGCAGTGCTGTGATTGATGACGGATTAATTAATAAGGAAGAGTTCCAGTTGGCATTATTTAAAACAAATAAAAGGAAAGCCTTTTTGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

199 aa · TkA02G612570|TK1151|PROTEIN

MSQCLEGVKHLLASLLHCCDLEAYKQLTALEDPEILARETVFSVSEIEALYELFKKISSAVIDDGLINKEEFQLALFKTNKRKAFLLIGCLTCLTQSIMEFLVSKSLLVHYQYSIQMPPLMIRSSQQGFIERQEVKQMVVATLAESGMNLSDDVIESIIDKTFEEADTKHDGKIDKEEWRSLVLRHPSLLKNMTLQYLK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G612570
TK1151 IDTkA02G612570
OH-1004 IDLXL04_031053
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)66.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 38.786
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G612570
位置Chr02:158002694-158005292 (+)
描述Similar to FPS1: Farnesyl pyrophosphate synthase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55990 充当钙传感器。
Arabidopsis protein kinase PKS5 inhibits the plasma membrane H+ -ATPase by preventing interaction with 14-3-3 protein.2007 · DOI: 10.1105/tpc.105.035626
S-acylation-dependent association of the calcium sensor CBL2 with the vacuolar membrane is essential for proper abscisic acid responses.2012 · DOI: 10.1038/cr.2012.71
At4g26570 充当钙传感器。
A protein kinase, calcineurin B-like protein-interacting protein Kinase9, interacts with calcium sensor calcineurin B-like Protein3 and regulates potassium homeostasis under low-potassium stress in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.112.206896

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0626800 充当钙传感器。 暂无已核实直接文献
Os12g0597000 充当钙传感器。
A gibberellin-regulated calcineurin B in rice localizes to the tonoplast and is implicated in vacuole function.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.062703
Os12g0162400 充当钙传感器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031053 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006695 cholesterol biosynthetic process 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0033384 geranyl diphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0045337 farnesyl diphosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0004161 dimethylallyltranstransferase activity 分子功能
GO:0004337 (2E,6E)-farnesyl diphosphate synthase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.362
排名 1 · TkA02G612570 · TK1151
内质网0.255
排名 2 · TkA02G612570 · TK1151
细胞核0.215
排名 3 · TkA02G612570 · TK1151
细胞膜0.150
排名 4 · TkA02G612570 · TK1151
线粒体0.148
排名 5 · TkA02G612570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10591SPARC_Ca_bdg13-31 aa
PF13499EF-hand_720-73 aa
PF30624EF_SSP12041-56 aa
PF23564EF-hand_FSTL148-48 aa
PF02457DAC48-60 aa
PF13405EF-hand_663-76 aa
PF13202EF-hand_564-73 aa
PF00036EF-hand_164-77 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G612570PF10591SPARC_Ca_bdg13310.01516.3
TkA02G612570PF13499EF-hand_720738.2e-0936.4
TkA02G612570PF30624EF_SSP12041560.1813.2
TkA02G612570PF23564EF-hand_FSTL148480.004718.0
TkA02G612570PF02457DAC48600.2411.7
TkA02G612570PF13405EF-hand_663761.6e-0731.1
TkA02G612570PF13202EF-hand_564733.4e-1142.8
TkA02G612570PF00036EF-hand_164778.3e-1141.4
TkA02G612570PF13833EF-hand_864720.001918.6
TkA02G612570PF29347CCM1_C64740.1712.4
TkA02G612570PF13499EF-hand_71241788.2e-0936.4
TkA02G612570PF13405EF-hand_61271391.6e-0731.1
TkA02G612570PF30624EF_SSP1201271790.1813.2
TkA02G612570PF13202EF-hand_51281393.4e-1142.8
TkA02G612570PF00036EF-hand_11281398.3e-1141.4
TkA02G612570PF23564EF-hand_FSTL11321880.004718.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LAS7拟南芥sp|Q8LAS7|CNBL2_ARATH Calcineurin B-like protein 267.500%Swiss-Prot高置信
Q8LEM7拟南芥sp|Q8LEM7|CNBL3_ARATH Calcineurin B-like protein 366.000%Swiss-Prot高置信
Q75LU8水稻sp|Q75LU8|CNBL3_ORYSJ Calcineurin B-like protein 368.500%Swiss-Prot高置信
Q3HRP5水稻sp|Q3HRP5|CNBL2_ORYSJ Calcineurin B-like protein 265.700%Swiss-Prot高置信
Q3HRP1水稻sp|Q3HRP1|CNBL6_ORYSJ Calcineurin B-like protein 662.100%Swiss-Prot高置信

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