TkA02G598390 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G598390

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 154280527-154282767 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1646 bp · TkA02G598390|TK1151|cDNA

TAGAAAGCGGTTTTCGTTCAATATCACAATCTCCACCGTTGCATTGGCTCTCATAAAAACCCTAATTTGTCCATGAGAAACTTTTACCCTAACCACATCCCAGCGCCCCCATCACCACCTCCTCTGAATCTTTGATCGAGTTTATACTAAATCCCTGATATTCCCTGATATCTCGAAGTATTTGTTAATCAGTTACCATATTCACCCGTTCCCTCAAAGGCAATTGGAATTTTAAATCAAGAGTTCAAATCTTCAAAACC...

CDS

下载 CDS FASTA

315 bp · TkA02G598390|TK1151|CDS

ATGCCAGATCATCAATCAGAAGTTAGATATGCAGAAAGCGTGCATAAGAAGATATCTGAAAATAAATTACAGAATCAAATTGTTGAGATGACAAAAAAGAGAGACGAGGTATTGGATCTGGTTAAAGAACTAAAGAGTTGTTCAACTGAACAGCAGTTGATGAACACGAAAGCTGAAGTTGAGGAGTTGACAATGAAGCTATCCACTCTAGAAGCCAAAATACACAATGAGGGGGTGAAAAGGGAAATAGAGAAGGCGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

104 aa · TkA02G598390|TK1151|PROTEIN

MPDHQSEVRYAESVHKKISENKLQNQIVEMTKKRDEVLDLVKELKSCSTEQQLMNTKAEVEELTMKLSTLEAKIHNEGVKREIEKAKLRMRLNGAQTRLDGMRA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G598390`
TK1151 ID	TkA02G598390
OH-1004 ID	LXL04_029375
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	60.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 85.577 / OH-1004 7.441 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G598390`
位置	Chr02:154280527-154282767 (+)
描述	Similar to KIN7O: Kinesin-like protein KIN-7O
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_029375` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程 GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程 GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程 GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore 生物过程 GO:0033044 regulation of chromosome organization 生物过程 GO:0042327 positive regulation of phosphorylation 生物过程 GO:0140694 membraneless organelle assembly 生物过程 GO:1901987 regulation of cell cycle phase transition 生物过程 GO:0000776 kinetochore 细胞组分 GO:0000779 condensed chromosome, centromeric region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ath:AT1G59540 ath:AT3G10180 dosa:Os09g0421200 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.524

排名 1 · TkA02G598390 · TK1151

细胞核0.405

排名 2 · TkA02G598390 · TK1151

线粒体0.055

排名 3 · TkA02G598390 · TK1151

细胞膜0.044

排名 4 · TkA02G598390 · TK1151

高尔基体0.029

排名 5 · TkA02G598390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16046FAM762-81 aa

PF19111DUF57989-77 aa

PF19776DUF626212-69 aa

PF11559ADIP17-93 aa

PF07765KIP117-58 aa

PF04977DivIC21-46 aa

PF28716PPi_PEPCK_C23-37 aa

PF04508Pox_A_type_inc29-47 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G598390	`PF16046`	FAM76	2	81	1.0	9.5
TkA02G598390	`PF19111`	DUF5798	9	77	0.3	12.0
TkA02G598390	`PF19776`	DUF6262	12	69	0.29	12.1
TkA02G598390	`PF11559`	ADIP	17	93	0.1	13.4
TkA02G598390	`PF07765`	KIP1	17	58	4.3	8.2
TkA02G598390	`PF04977`	DivIC	21	46	1.2	9.7
TkA02G598390	`PF28716`	PPi_PEPCK_C	23	37	0.89	11.3
TkA02G598390	`PF04508`	Pox_A_type_inc	29	47	0.12	12.9
TkA02G598390	`PF07926`	TPR_MLP1_2	40	102	0.13	13.0
TkA02G598390	`PF07765`	KIP1	48	73	4.3	8.2
TkA02G598390	`PF04977`	DivIC	51	85	1.2	9.7
TkA02G598390	`PF28716`	PPi_PEPCK_C	57	101	0.89	11.3
TkA02G598390	`PF04508`	Pox_A_type_inc	61	63	0.12	12.9
TkA02G598390	`PF19776`	DUF6262	76	89	0.29	12.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情