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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G580800
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 149839353-149840114 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

726 bp · TkA02G580800|TK1151|cDNA

ATGGCGACATCCGACGACGGTGCTGCTGCCGGAGAAGTTAGCAAGATCAAGGGATCCTGGAGCCCCCAAGAGGACGCCACCCTCATCAAACTGGTCGAACAACATGGTCCGCGCAACTGGTCCCTCATCAGTTCCCGAATTCCAGGCCGATCTGGAAAATCCTGCCGTCTACGGTGGTGCAACCAGCTCAGCCCAGACGTCGAGCACCGTCCCTTTACTCGTGAAGAGGATGACGTCATCGTCCGAGCACATGCCATCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

726 bp · TkA02G580800|TK1151|CDS

ATGGCGACATCCGACGACGGTGCTGCTGCCGGAGAAGTTAGCAAGATCAAGGGATCCTGGAGCCCCCAAGAGGACGCCACCCTCATCAAACTGGTCGAACAACATGGTCCGCGCAACTGGTCCCTCATCAGTTCCCGAATTCCAGGCCGATCTGGAAAATCCTGCCGTCTACGGTGGTGCAACCAGCTCAGCCCAGACGTCGAGCACCGTCCCTTTACTCGTGAAGAGGATGACGTCATCGTCCGAGCACATGCCATCCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

241 aa · TkA02G580800|TK1151|PROTEIN

MATSDDGAAAGEVSKIKGSWSPQEDATLIKLVEQHGPRNWSLISSRIPGRSGKSCRLRWCNQLSPDVEHRPFTREEDDVIVRAHAIHGNKWSTISRLLPGRTDNAIKNHWNSTLRRRGVSGSGSERHVTDGSSESTQSDPVLKKQCSRNSDRSSCDGPPTVLTLLPPGEIKAVEQVTEKNEEVDDDVEEKSTVEMDNTCLVTIMKRMIAEEVRIYINELRAKEGLNLISGPHSQHLPQNRD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G580800
TK1151 IDTkA02G580800
OH-1004 IDLXL04_012218
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G580800
位置Chr02:149839353-149840114 (+)
描述Similar to MYB73: Transcription factor MYB73
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37260 在盐胁迫反应中发挥作用的转录因子。
Loss of the R2R3 MYB, AtMyb73, causes hyper-induction of the SOS1 and SOS3 genes in response to high salinity in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1016/j.jplph.2013.05.011
At5g67300 转录因子。
Overexpression of AtMYB44 enhances stomatal closure to confer abiotic stress tolerance in transgenic Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.110981
Two novel MYB homologues with changed expression in late embryogenesis-defective Arabidopsis mutants.1998 · DOI: 10.1023/a:1006011002499
At3g50060 参与生长素反应的转录因子。
The Arabidopsis transcription factor MYB77 modulates auxin signal transduction.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050963
At2g39880 对雄配子体（花粉）发育是必需的。 暂无已核实直接文献
At3g09230 转录因子MYB1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012218 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010929 positive regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G39880
ath:AT3G09230
ath:AT3G50060
ath:AT4G37260
ath:AT5G67300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.952
排名 1 · TkA02G580800 · TK1151
细胞质0.102
排名 2 · TkA02G580800 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA02G580800 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA02G580800 · TK1151
线粒体0.011
排名 5 · TkA02G580800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding17-63 aa
PF15963Myb_DNA-bind_717-58 aa
PF09111SLIDE17-47 aa
PF13921Myb_DNA-bind_620-77 aa
PF08914Myb_Rap121-65 aa
PF20222DUF658139-61 aa
PF09111SLIDE65-90 aa
PF00249Myb_DNA-binding70-113 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G580800PF00249Myb_DNA-binding17638.2e-39132.2
TkA02G580800PF15963Myb_DNA-bind_717580.001419.1
TkA02G580800PF09111SLIDE17470.1412.9
TkA02G580800PF13921Myb_DNA-bind_620773.9e-2691.7
TkA02G580800PF08914Myb_Rap121650.007517.4
TkA02G580800PF20222DUF658139610.0115.5
TkA02G580800PF09111SLIDE65900.1412.9
TkA02G580800PF00249Myb_DNA-binding701138.2e-39132.2
TkA02G580800PF13921Myb_DNA-bind_6721163.9e-2691.7
TkA02G580800PF08914Myb_Rap1721170.007517.4
TkA02G580800PF20222DUF6581791180.0115.5
TkA02G580800PF15963Myb_DNA-bind_7821150.001419.1
TkA02G580800PF09111SLIDE1741900.1412.9
TkA02G580800PF15963Myb_DNA-bind_71791960.001419.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O23160拟南芥sp|O23160|MYB73_ARATH Transcription factor MYB7376.700%Swiss-Prot低置信
Q9FDW1拟南芥sp|Q9FDW1|MYB44_ARATH Transcription factor MYB4466.900%Swiss-Prot低置信
Q9SN12拟南芥sp|Q9SN12|MYB77_ARATH Transcription factor MYB7770.900%Swiss-Prot低置信
O04192拟南芥sp|O04192|MYB25_ARATH Transcription factor MYB2564.500%Swiss-Prot低置信
Q42575拟南芥sp|Q42575|MYB1_ARATH Transcription factor MYB164.500%Swiss-Prot低置信

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