TkA02G555750 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G555750

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 143440896-143442978 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1509 bp · TkA02G555750|TK1151|cDNA

TTCCCTCCCAGATATTTTGCAAAAACTGCATCTCCATCTCTCCTACTCACTCCCTTCCACTGTCTGTGTTATGATTCAGTATATTCCTTCATCTTCCTATTCCCATCAGATTAAACCCCATAAAACCCCTAAAATTAATCCATCATGGACTTCACAATTTCATCAAACACTTAATACAACATCATTATGCTCCTACAGATCCAATATTTGCTATTACGCATCTACGACATGCCAACTGCAAAGAGAAGATTCACAATTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1497 bp · TkA02G555750|TK1151|CDS

ATGATTCAGTATATTCCTTCATCTTCCTATTCCCATCAGATTAAACCCCATAAAACCCCTAAAATTAATCCATCATGGACTTCACAATTTCATCAAACACTTAATACAACATCATTATGCTCCTACAGATCCAATATTTGCTATTACGCATCTACGACATGCCAACTGCAAAGAGAAGATTCACAATTCAAAAGGATTTCAAAAAAACAGAGTAAAGGGGATGATCCCAGTTTTCCGATTGCAGTTTCTGGCAGGAAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

499 aa · TkA02G555750|TK1151|PROTEIN

MIQYIPSSSYSHQIKPHKTPKINPSWTSQFHQTLNTTSLCSYRSNICYYASTTCQLQREDSQFKRISKKQSKGDDPSFPIAVSGRKKGSVAGAVALIIGTSIGSGILALPQKTSPAGLIPSSISLTLCWGFLLIEALLLVEINVRLLKKKKNAVNSENELEVISIRTMAQETLGELGGTIATLTYVFLGYTSMIAYASKSGEILNHQFKIPESISGVFFTMLFATLISIGGTRTTDQVNQVLTVSMIGLLVAIEVVAIFF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G555750`
TK1151 ID	TkA02G555750
OH-1004 ID	LXL04_003574
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	32.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 76.152 / OH-1004 81.043 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G555750`
位置	Chr02:143440896-143442978 (+)
描述	Similar to tyrP: Tyrosine-specific transport protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_003574` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0003333 amino acid transmembrane transport 生物过程 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0015173 aromatic amino acid transmembrane transporter activity 分子功能 GO:0015293 symporter activity 分子功能 GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	ecj:JW1895 eco:b1907 ecoc:C3026_10825 hin:HI_0287 hin:HI_0477 hin:HI_0528 sfl:SF1953 sfx:S2046 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.978

排名 1 · TkA02G555750 · TK1151

线粒体0.021

排名 2 · TkA02G555750 · TK1151

细胞核0.016

排名 3 · TkA02G555750 · TK1151

细胞膜0.015

排名 4 · TkA02G555750 · TK1151

细胞质0.014

排名 5 · TkA02G555750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03222Trp_Tyr_perm87-472 aa

PF01490Aa_trans87-291 aa

PF08592Anthrone_oxy95-159 aa

PF02990EMP70175-277 aa

PF08592Anthrone_oxy220-258 aa

PF08592Anthrone_oxy376-418 aa

PF01490Aa_trans413-465 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G555750	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	87	472	7e-47	161.1
TkA02G555750	`PF01490`	Aa_trans	87	291	1.2e-07	31.5
TkA02G555750	`PF08592`	Anthrone_oxy	95	159	0.83	10.6
TkA02G555750	`PF02990`	EMP70	175	277	0.0077	15.6
TkA02G555750	`PF08592`	Anthrone_oxy	220	258	0.83	10.6
TkA02G555750	`PF08592`	Anthrone_oxy	376	418	0.83	10.6
TkA02G555750	`PF01490`	Aa_trans	413	465	1.2e-07	31.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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