TkA02G469630 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G469630

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 119797598-119800169 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

741 bp · TkA02G469630|TK1151|cDNA

ATAAGTAGTCACACTCTACCTTCTTCATCAATCATCGTTCACTTCTTTACGGATTTTTTCTTCACCTAACATCTAAAATCCGCTCTGCAACACACCACAAATCCCCAAAACCTCTCAACCTCCGGCCTCCATCATGAACACCAAAACCAGCTTAGAATCAGAGGTCGTCACCATTGATGTTCTAAAAGCAAACGATCTTCTCCACAATAGCGGCTACCGTTACCTTGACGTCAGGACCGAGGAAGAATTCAAGAAAGGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

414 bp · TkA02G469630|TK1151|CDS

ATGAACACCAAAACCAGCTTAGAATCAGAGGTCGTCACCATTGATGTTCTAAAAGCAAACGATCTTCTCCACAATAGCGGCTACCGTTACCTTGACGTCAGGACCGAGGAAGAATTCAAGAAAGGGCATGTTGATTTTGATGACGCTCTAAACATTCCTTACATGTTTAACACACCTGAAGGTAGGGTGAAGAATCCCAAATTCATGGAACAAGTGCTACCAGTGTGTACAAAGGATGATCATCTTGTGGTGGGTTGCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

137 aa · TkA02G469630|TK1151|PROTEIN

MNTKTSLESEVVTIDVLKANDLLHNSGYRYLDVRTEEEFKKGHVDFDDALNIPYMFNTPEGRVKNPKFMEQVLPVCTKDDHLVVGCQSGVRSVYATTDLLNTGYKHVYNMGGGYLAWVENGLPVVSDPVALKPKVGL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G469630`
TK1151 ID	TkA02G469630
OH-1004 ID	LXL04_013825
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	70.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 94.891 / OH-1004 76.829 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G469630

位置 Chr02:119797598-119800169 (-)

描述 Similar to STR18: Thiosulfate sulfurtransferase 18

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g21045`	对砷耐受性至关重要的砷酸还原酶。	暂无已核实直接文献
`At5g66170`	催化硫离子从供体转移到氰化物或其他硫醇化合物。	暂无已核实直接文献
`At2g17850`	含硫醇铁杂蛋白样结构域的蛋白质 17。	暂无已核实直接文献
`At5g66040`	认为在叶片衰老的早期阶段发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At4g35770`	含有硫氰酸酶样结构域的蛋白15，叶绿体型。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013825 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程

GO:0046685 response to arsenic-containing substance 生物过程

GO:0071722 detoxification of arsenic-containing substance 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009579 thylakoid 细胞组分

GO:0003824 catalytic activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G17850

ath:AT2G21045

ath:AT4G35770

ath:AT5G66170

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.719

排名 1 · TkA02G469630 · TK1151

细胞核0.395

排名 2 · TkA02G469630 · TK1151

线粒体0.109

排名 3 · TkA02G469630 · TK1151

过氧化物酶体0.051

排名 4 · TkA02G469630 · TK1151

细胞膜0.042

排名 5 · TkA02G469630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00581Rhodanese19-119 aa

PF07920DUF168427-57 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G469630	`PF00581`	Rhodanese	19	119	6.7e-15	56.1
TkA02G469630	`PF07920`	DUF1684	27	57	0.21	12.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8RUD6`	拟南芥	sp\|Q8RUD6\|HARC1_ARATH Protein HIGH ARSENIC CONTENT 1, mitochondrial	55.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FKW8`	拟南芥	sp\|Q9FKW8\|STR18_ARATH Thiosulfate sulfurtransferase 18	54.200%	Swiss-Prot	高置信
`F4IPI4`	拟南芥	sp\|F4IPI4\|STR17_ARATH Rhodanese-like domain-containing protein 17	51.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q39129`	拟南芥	sp\|Q39129\|STR16_ARATH Thiosulfate sulfurtransferase 16, chloroplastic	51.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q38853`	拟南芥	sp\|Q38853\|STR15_ARATH Rhodanese-like domain-containing protein 15, chloroplastic	49.000%	Swiss-Prot	中等置信

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