TkA02G304870 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G304870

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 77625214-77626683 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

690 bp · TkA02G304870|TK1151|cDNA

ATGTTGATCAATTTAATCAAATTATGTTTGATTTTTATCCGTGCTTTTAAGGATGTTGATCCTATTGTGGCAGTGTTCTCTGCAGGACCAGTTGGTGTATCCAGCTTTAGCAATTGCTGTCTTAAGCAACTCATTAGGATCAACAACCCTTCTATTGTAATGAATGTGGCATTGATCCTATGGAGGAACAATGAAACTGTTTGCAATCAGGGGCAATTATGGAACAAAGTTGAGGATGATGTGGTTTCAAATCGGTTGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

690 bp · TkA02G304870|TK1151|CDS

ATGTTGATCAATTTAATCAAATTATGTTTGATTTTTATCCGTGCTTTTAAGGATGTTGATCCTATTGTGGCAGTGTTCTCTGCAGGACCAGTTGGTGTATCCAGCTTTAGCAATTGCTGTCTTAAGCAACTCATTAGGATCAACAACCCTTCTATTGTAATGAATGTGGCATTGATCCTATGGAGGAACAATGAAACTGTTTGCAATCAGGGGCAATTATGGAACAAAGTTGAGGATGATGTGGTTTCAAATCGGTTGGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

229 aa · TkA02G304870|TK1151|PROTEIN

MLINLIKLCLIFIRAFKDVDPIVAVFSAGPVGVSSFSNCCLKQLIRINNPSIVMNVALILWRNNETVCNQGQLWNKVEDDVVSNRLVYWRWVLKWRFHVISLWQQIAVYTLKLILRWVVDPNELLKTAIAKAGYTGKVVIGMDVAASEFYAEKGKTYDLNFKEVLIRYVGLLIQFLIRPVIHTRTSGMTSRKRSNDDDDDFVYGDKGFRAIFESMILGSKLHIFVIDLW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G304870`
TK1151 ID	TkA02G304870
OH-1004 ID	LXL04_015664
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	94.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.127 / OH-1004 82.545 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G304870

位置 Chr02:77625214-77626683 (-)

描述 Similar to ENO1: Enolase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g36530`	多功能酶，作为参与代谢的烯醇酶和冷响应基因转录的正调节因子。	LOS2, a genetic locus required for cold-responsive gene transcription encodes a bi-functional enolase.2002 · DOI: 10.1093/emboj/21.11.2692 Quantitative proteomics of the tonoplast reveals a role for glycolytic enzymes in salt tolerance.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.069211

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os10g0167300`	烯醇化酶。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015664 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006096 glycolytic process 生物过程

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程

GO:0000015 phosphopyruvate hydratase complex 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005740 mitochondrial envelope 细胞组分

GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G36530

dosa:Os10g0167300

rcu:8288376

zma:542316

zma:732811

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.272

排名 1 · TkA02G304870 · TK1151

细胞质0.268

排名 2 · TkA02G304870 · TK1151

线粒体0.193

排名 3 · TkA02G304870 · TK1151

内质网0.143

排名 4 · TkA02G304870 · TK1151

细胞膜0.138

排名 5 · TkA02G304870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30754Orange_mid17-35 aa

PF00113Enolase_C123-163 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G304870	`PF30754`	Orange_mid	17	35	0.037	14.9
TkA02G304870	`PF00113`	Enolase_C	123	163	2.8e-12	47.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P25696`	拟南芥	sp\|P25696\|ENO2_ARATH Bifunctional enolase 2/transcriptional activator	90.200%	Swiss-Prot	低置信
`Q42971`	水稻	sp\|Q42971\|ENO_ORYSJ Enolase	90.200%	Swiss-Prot	低置信

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