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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G139440
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 35994580-35997021 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2409 bp · TkA02G139440|TK1151|cDNA

ATGAGCGTTTTGATAAGGGTATCTTCTGTTCTTGTTCTTATATCTTTTTATCTTCATCAATCATCATCTGCTTCATTCATTCCTCCTGATAACTACTTAATTTCTTGTGGTTCTTCACAAAATATCACATTTCTTGGCCAAACTTATCTCCCTGATTCGATTCAATCGTCATTTTCCCTAAAAACCCAACAAGATTCGAATATTATCAAATCGAATTCAACCGTTCCATTACCAATCCACCAATCTGCTCGAGTTTTCAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2409 bp · TkA02G139440|TK1151|CDS

ATGAGCGTTTTGATAAGGGTATCTTCTGTTCTTGTTCTTATATCTTTTTATCTTCATCAATCATCATCTGCTTCATTCATTCCTCCTGATAACTACTTAATTTCTTGTGGTTCTTCACAAAATATCACATTTCTTGGCCAAACTTATCTCCCTGATTCGATTCAATCGTCATTTTCCCTAAAAACCCAACAAGATTCGAATATTATCAAATCGAATTCAACCGTTCCATTACCAATCCACCAATCTGCTCGAGTTTTCAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

802 aa · TkA02G139440|TK1151|PROTEIN

MSVLIRVSSVLVLISFYLHQSSSASFIPPDNYLISCGSSQNITFLGQTYLPDSIQSSFSLKTQQDSNIIKSNSTVPLPIHQSARVFTTISTYIFNIKKQGRHWIRLHFYPIPDHNLTSSSFTVVTENFVLLNNYSFKSFSGSKYISKEYSINVTSNTLLLNFIPSNNSIAFINAIEVVSIPDEIIPDQAIQLSQSSPISGLSELAFETVYRLNMGGPKLTPQNDTLGRIWENDEKYLHVNSSAANVSINPSLVKYQEGVT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G139440
TK1151 IDTkA02G139440
OH-1004 IDLXL04_016453
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G139440
位置Chr02:35994580-35997021 (+)
描述Similar to THE1: Receptor-like protein kinase THESEUS 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At2g21480 可能的受体样蛋白激酶At2g21480。 暂无已核实直接文献
At5g61350 可能的受体样蛋白激酶 At5g61350。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016453 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051924 regulation of calcium ion transport 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0097275 intracellular ammonium homeostasis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21480
ath:AT3G46290
ath:AT5G54380
ath:AT5G59700
ath:AT5G61350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.764
排名 1 · TkA02G139440 · TK1151
内质网0.101
排名 2 · TkA02G139440 · TK1151
细胞质0.085
排名 3 · TkA02G139440 · TK1151
溶酶体／液泡0.074
排名 4 · TkA02G139440 · TK1151
细胞核0.046
排名 5 · TkA02G139440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11721Malectin33-163 aa
PF12819Malectin_like34-382 aa
PF11721Malectin209-350 aa
PF14610Psg1298-427 aa
PF00069Pkinase475-673 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr476-667 aa
PF03109ABC1476-506 aa
PF03109ABC1580-620 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G139440PF11721Malectin331631.5e-1248.5
TkA02G139440PF12819Malectin_like343821.7e-30107.1
TkA02G139440PF11721Malectin2093501.5e-1248.5
TkA02G139440PF14610Psg12984270.004617.5
TkA02G139440PF00069Pkinase4756731.5e-40140.0
TkA02G139440PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4766678.6e-46157.0
TkA02G139440PF03109ABC14765060.002417.8
TkA02G139440PF03109ABC15806200.002417.8
TkA02G139440PF01636APH5866200.2411.8
TkA02G139440PF14531Kinase-like5876680.1112.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK35拟南芥sp|Q9LK35|THE1_ARATH Receptor-like protein kinase THESEUS 165.100%Swiss-Prot高置信
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 151.200%Swiss-Prot高置信
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970049.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SJT0拟南芥sp|Q9SJT0|Y2214_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g2148051.900%Swiss-Prot高置信
Q9FLJ8拟南芥sp|Q9FLJ8|Y5613_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g6135048.800%Swiss-Prot中等置信

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