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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G078110
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 20342960-20343604 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

558 bp · TkA02G078110|TK1151|cDNA

ATGGCCACCCCAACTATCAAGCATAACAACTTAGATGTTGAAAGCCAACCAACCCAAGAAACCACCGAAGTCGTATTTGATTATGCCAAGAGAGCTCAATGGCTCAGAGCCGCTCTATTAGGCGCTAATGATGGCCTTCTTTCCACCGCCTCCCTAATGATGGGCGTAGGCGCAGTTCGTGAGGATGTCAAGACCATGATCCTCTCTGGAATGGCCGGTCTGGTCGCCGGAGCATGCAGCATGGCCATCGGAGAATTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

558 bp · TkA02G078110|TK1151|CDS

ATGGCCACCCCAACTATCAAGCATAACAACTTAGATGTTGAAAGCCAACCAACCCAAGAAACCACCGAAGTCGTATTTGATTATGCCAAGAGAGCTCAATGGCTCAGAGCCGCTCTATTAGGCGCTAATGATGGCCTTCTTTCCACCGCCTCCCTAATGATGGGCGTAGGCGCAGTTCGTGAGGATGTCAAGACCATGATCCTCTCTGGAATGGCCGGTCTGGTCGCCGGAGCATGCAGCATGGCCATCGGAGAATTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

185 aa · TkA02G078110|TK1151|PROTEIN

MATPTIKHNNLDVESQPTQETTEVVFDYAKRAQWLRAALLGANDGLLSTASLMMGVGAVREDVKTMILSGMAGLVAGACSMAIGEFVSVYSQYDTKAAIASASAFAVGATVPLLAAAFIDCYRLRLVVVVLAVSMALVGFGGLSAVLGRGPIVRSTLRVLVGGWVAMGVTFGLTKAVGSTGLMNT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G078110
TK1151 IDTkA02G078110
OH-1004 IDLXL04_031240
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.676 / OH-1004 95.652
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G078110
位置Chr02:20342960-20343604 (+)
描述Similar to At3g43660: Vacuolar iron transporter homolog 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g43660 可能的液泡铁转运蛋白，可能参与植物体内铁分布的调节。 暂无已核实直接文献
At3g43630 可能的液泡铁转运蛋白，可能参与整个植物中铁分布的调节。
Members of a small family of nodulin-like genes are regulated under iron deficiency in roots of Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1016/j.plaphy.2011.02.011
At1g76800 液泡铁转运蛋白参与将铁离子从细胞质转移到液泡以储存细胞内的铁。
Vacuolar-Iron-Transporter1-Like proteins mediate iron homeostasis in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0110468
At1g21140 液泡铁转运蛋白参与将铁离子从细胞质转移到液泡以储存细胞内的铁。
Vacuolar-Iron-Transporter1-Like proteins mediate iron homeostasis in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0110468
At3g25190 液泡铁转运蛋白参与将铁离子从细胞质转移到液泡以储存细胞内的铁。
Vacuolar-Iron-Transporter1-Like proteins mediate iron homeostasis in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0110468

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031240 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0010039 response to iron ion 生物过程
GO:0030026 intracellular manganese ion homeostasis 生物过程
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005381 iron ion transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0005384 manganese ion transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21140
ath:AT1G76800
ath:AT3G43630
ath:AT3G43660
gmx:100791523
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.379
排名 1 · TkA02G078110 · TK1151
溶酶体／液泡0.348
排名 2 · TkA02G078110 · TK1151
内质网0.149
排名 3 · TkA02G078110 · TK1151
细胞质0.099
排名 4 · TkA02G078110 · TK1151
高尔基体0.082
排名 5 · TkA02G078110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01988VIT135-95 aa
PF01988VIT195-174 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G078110PF01988VIT135951.6e-31110.5
TkA02G078110PF01988VIT1951741.6e-31110.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M2C0拟南芥sp|Q9M2C0|VITH4_ARATH Vacuolar iron transporter homolog 460.900%Swiss-Prot高置信
Q9M2C3拟南芥sp|Q9M2C3|VITH3_ARATH Vacuolar iron transporter homolog 360.300%Swiss-Prot高置信
Q9SRD3拟南芥sp|Q9SRD3|VITH2_ARATH Vacuolar iron transporter homolog 259.700%Swiss-Prot高置信
Q9LPU9拟南芥sp|Q9LPU9|VITH1_ARATH Vacuolar iron transporter homolog 159.200%Swiss-Prot高置信
Q9LSF6拟南芥sp|Q9LSF6|VTH21_ARATH Vacuolar iron transporter homolog 2.151.500%Swiss-Prot高置信

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