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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G062970
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 16403869-16407497 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3310 bp · TkA02G062970|TK1151|cDNA

GAAGAGATAAGTTAGAAGCTTCGTGTTACATATTGCTTCCATCATGTGAACAGCGAAACTTCCCCCCAATCACAACAAATGCCTCCAAGATTGCATTCCTATTTCCACCCCATCAAACGGATTAACTCAAAAGCATCCTAAACTCCGGCCGGTATGTCGTCGGAACCCATCTCCGGTAACCACCGTATCATCCTCTTTCTTCTACCATTTCTCTGCTTGATAGTCCACTCTTACTCCCAAGCTGACCAACTTCAAATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1167 bp · TkA02G062970|TK1151|CDS

ATGTGCAAAATGGGAAAGATGCAGAAACTTTTGATGCTTGAAAACAACTTCACCGGCGGCTTGCCGGAGACTTATGCCAGTTGCTCGTCCTTGCTTCGACTGAGAGTGAGCAATAATTCACTTTCCGGGAGAGTTCCAGACGGGATTTGGAGTTTGCCGAATTTAGGTATGATTGATCTTGCAATTAATCAATTTGAGGGTCAAGTGGCACCAACTATCGGTCAAGCAAAGTCGCTGTCACAGCTTTTTCTAGCTAACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

388 aa · TkA02G062970|TK1151|PROTEIN

MCKMGKMQKLLMLENNFTGGLPETYASCSSLLRLRVSNNSLSGRVPDGIWSLPNLGMIDLAINQFEGQVAPTIGQAKSLSQLFLANNRFSGEVPAEISNVSSLVEIELISNQFSGEIPSGIGNLKKLSKLHLQDNIFSGAIPESLGSCVSLNEINLAGNSFSGQIPATLGSLPTLNSLNLSGNKLSGLIPASLSKLKLSLIDVSNNMLIGPVPQGLLIVAYNGSFAGNPGLCADGNKDLRQCSPVPKKSDQLKVAVYCFI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G062970
TK1151 IDTkA02G062970
OH-1004 IDLXL04_017256
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 49.742 / OH-1004 19.734
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G062970
位置Chr02:16403869-16407497 (+)
描述Similar to RLK7: Receptor-like protein kinase 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g19700 通过负调控合胞体胚乳的细胞化来调节种子大小。
MINISEED3 (MINI3), a WRKY family gene, and HAIKU2 (IKU2), a leucine-rich repeat (LRR) KINASE gene, are regulators of seed size in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0508418102
At1g09970 在病原体相关分子模式 诱导的模式触发免疫 信号传导中发挥作用。
RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4
The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献
At5g65710 参与控制花器官脱落的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017256 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009960 endosperm development 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0010555 response to mannitol 生物过程
GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09970
ath:AT1G28440
ath:AT1G72180
ath:AT3G19700
ath:AT5G49660
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.887
排名 1 · TkA02G062970 · TK1151
内质网0.086
排名 2 · TkA02G062970 · TK1151
细胞质0.057
排名 3 · TkA02G062970 · TK1151
细胞核0.036
排名 4 · TkA02G062970 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA02G062970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598LRR_142-88 aa
PF23211LRR_LRWD15-65 aa
PF24141LRR_ComC5-41 aa
PF00560LRR_18-26 aa
PF13855LRR_811-64 aa
PF24758LRR_At5g5637019-60 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL2121-60 aa
PF13516LRR_628-42 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G062970PF23598LRR_142885.7e-1142.5
TkA02G062970PF23211LRR_LRWD15650.001419.0
TkA02G062970PF24141LRR_ComC5410.002618.2
TkA02G062970PF00560LRR_18262.9e-2171.7
TkA02G062970PF13855LRR_811642e-1557.0
TkA02G062970PF24758LRR_At5g5637019606.9e-0523.3
TkA02G062970PF25019LRR_R13L1-DRL2121607.8e-0523.3
TkA02G062970PF13516LRR_628420.8910.5
TkA02G062970PF00560LRR_130522.9e-2171.7
TkA02G062970PF12799LRR_430643.7e-0937.3
TkA02G062970PF00560LRR_155742.9e-2171.7
TkA02G062970PF25019LRR_R13L1-DRL21561037.8e-0523.3
TkA02G062970PF29594LRR_SKP2721080.04313.8
TkA02G062970PF18462DUF5612751190.08413.4
TkA02G062970PF24758LRR_At5g56370761386.9e-0523.3
TkA02G062970PF13855LRR_8771132e-1557.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJM4拟南芥sp|Q9LJM4|IKU2_ARATH Receptor-like protein kinase HAIKU243.000%Swiss-Prot低置信
F4I2N7拟南芥sp|F4I2N7|RLK7_ARATH Receptor-like protein kinase 739.800%Swiss-Prot低置信
Q9SGP2拟南芥sp|Q9SGP2|HSL1_ARATH Receptor-like protein kinase HSL137.300%Swiss-Prot低置信
C0LGX3拟南芥sp|C0LGX3|HSL2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL227.600%Swiss-Prot低置信

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