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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G045220
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 11667476-11670231 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1873 bp · TkA02G045220|TK1151|cDNA

GAAAATAATAAAATGACAAAAATAGAAAATTGCTCCTTTTACAATCACTTAAATATATTTTTCTAACTGTGTCAACCAAAAACAAAATAAATTCTATAATAAATTTGAACCATAGGTACCAAATTTGCAACCACAAACACTTGAACTAAAGTTGCTATTTTCAATAAACCATAAGGACCATATATGTAGTTTTTTCTTCTTTAAATGCAAGACACCTGGGAATGAGCGGAGCACACGACACTTGTCCTCTCTTTCAGCCC...

912 bp · TkA02G045220|TK1151|CDS

ATGAGTTCCTTCATCAATTTCAAGAACTATAAGCCGATGTGTGCAAATTCGCCGACTTTTGATGAATTGCAAAACACATGCAGTGGAAATGGGAAGAATTTAGGATCAAGGAACATGGATGAGTTTTTAAAGAATATCTGGACTCCCGAAGAGACTCAATCGATGACATCAAGCTCCAATTTGGGGATAATCGGAAATTTACAAAAGCAAGGATCTTTAACGATACCAAGAACAGTTAGCCAGAAAAAAGTGGATGAAGT...

303 aa · TkA02G045220|TK1151|PROTEIN

MSSFINFKNYKPMCANSPTFDELQNTCSGNGKNLGSRNMDEFLKNIWTPEETQSMTSSSNLGIIGNLQKQGSLTIPRTVSQKKVDEVWRDLLKENGDVGLIKEPTLGEMTLEDFLHKSGAIAENDKTHVIQNQGFHQDSVFTDGKNDNLRKILPKKSDFDFRSSVNNDRISSRENGFSINGKIDHLLKTDYPSELYQNSKFDTSPSPSPSYGGGHGRKRSGTVEKVVERRQKRMIKNRESASRSRARKQAYILELEAEVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G045220
TK1151 IDTkA02G045220
OH-1004 IDLXL04_017403
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G045220
位置Chr02:11667476-11670231 (+)
描述Similar to ABF1: ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

水稻

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017403 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010255 glucose mediated signaling pathway 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0090332 stomatal closure 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G45249
ath:AT1G49720
ath:AT2G41070
dosa:Os02g0766700
dosa:Os06g0211200
osa:4340462
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · TkA02G045220 · TK1151
细胞质0.101
排名 2 · TkA02G045220 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA02G045220 · TK1151
内质网0.010
排名 4 · TkA02G045220 · TK1151
线粒体0.008
排名 5 · TkA02G045220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03131bZIP_Maf38-54 aa
PF30935ZC2HC1C_CC49-71 aa
PF03131bZIP_Maf222-274 aa
PF23824DUF7194225-276 aa
PF07716bZIP_2228-267 aa
PF00170bZIP_1229-279 aa
PF30935ZC2HC1C_CC236-270 aa
PF07716bZIP_2273-283 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G045220PF03131bZIP_Maf38540.1613.2
TkA02G045220PF30935ZC2HC1C_CC49710.00717.1
TkA02G045220PF03131bZIP_Maf2222740.1613.2
TkA02G045220PF23824DUF71942252762.28.4
TkA02G045220PF07716bZIP_22282673.3e-0524.6
TkA02G045220PF00170bZIP_12292799.8e-1142.3
TkA02G045220PF30935ZC2HC1C_CC2362700.00717.1
TkA02G045220PF07716bZIP_22732833.3e-0524.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M7Q2拟南芥sp|Q9M7Q2|AI5L7_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 734.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M7Q5拟南芥sp|Q9M7Q5|AI5L4_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 438.200%Swiss-Prot中等置信
Q9M7Q4拟南芥sp|Q9M7Q4|AI5L5_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 537.500%Swiss-Prot中等置信
Q6ZDF3水稻sp|Q6ZDF3|TRAB1_ORYSJ bZIP transcription factor TRAB137.800%Swiss-Prot中等置信
Q6Z312水稻sp|Q6Z312|BZP23_ORYSJ bZIP transcription factor 2336.400%Swiss-Prot中等置信
Q69TW5水稻sp|Q69TW5|BZP46_ORYSJ bZIP transcription factor 4642.100%Swiss-Prot中等置信

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