TkA01G634450 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G634450

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 160503156-160505197 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1154 bp · TkA01G634450|TK1151|cDNA

TTGAGATTGATAAAAATGCCTGAACTCCCATCCCACCGCATGAAGTGACGAATAAAGTCGCGACTCAAGACTATTATCTCCATTCCATTCATTTCATTCAGGTAGATAAGGGGAAATGCAGACTTCCTCATCTTCTTCCCTATGTGCTATCGTTCCTGTAGATTGCATTCGGAACTGTTCAAATCAGCTAGCATATCCTTGCAGTCTCAGTTTGGGGTTATCAAGAGGGAGCAGAGAGCTCAAGGTTTCTCGATTGAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

474 bp · TkA01G634450|TK1151|CDS

ATGCAGACTTCCTCATCTTCTTCCCTATGTGCTATCGTTCCTGTAGATTGCATTCGGAACTGTTCAAATCAGCTAGCATATCCTTGCAGTCTCAGTTTGGGGTTATCAAGAGGGAGCAGAGAGCTCAAGGTTTCTCGATTGAAGGCTGGCTTCTGGGAATCCATTAGATCTGGGTTGACAAAGAACAACTCAACACAGGTTATAGAACCACCTTCTTCTACTTCTAAAGAAGATGAAGAAGAACCTCTACCAGAAGAATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

157 aa · TkA01G634450|TK1151|PROTEIN

MQTSSSSSLCAIVPVDCIRNCSNQLAYPCSLSLGLSRGSRELKVSRLKAGFWESIRSGLTKNNSTQVIEPPSSTSKEDEEEPLPEEFVLIEKTLPDGTIEQIIFSSGGDVDIYDLQALCDKVGWPRRPLSKLAAALRNSYMVATLHSIKKSSTGEVT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G634450`
TK1151 ID	TkA01G634450
OH-1004 ID	LXL04_000101
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.726 / OH-1004 63.265 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G634450

位置 Chr01:160503156-160505197 (-)

描述 Similar to TAP2: Probable acetyltransferase TAP2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g32070`	具有双重特异性的蛋白乙酰转移酶，可催化N端α-乙酰化（NTA），偏好丙氨酸、丝氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸，较弱利用缬氨酸，也可利用甘氨酸和亮氨酸；还可催化多种质体蛋白的赖氨酸ε-乙酰化（KA）。	Cloning of Arabidopsis serotonin N-acetyltransferase and its role with caffeic acid O-methyltransferase in the biosynthesis of melatonin in vitro despite their different subcellular localizations.2014 · DOI: 10.1111/jpi.12181 Melatonin Improved Anthocyanin Accumulation by Regulating Gene Expressions and Resulted in High Reactive Oxygen Species Scavenging Capacity in Cabbage.2016 · DOI: 10.3389/fpls.2016.00197 Melatonin induction and its role in high light stress tolerance in Arabidopsis thaliana.2018 · DOI: 10.1111/jpi.12504 Chloroplast Acetyltransferase NSI Is Required for State Transitions in Arabidopsis thaliana.2018 · DOI: 10.1105/tpc.18.00155 Daily rhythms of phytomelatonin signaling modulate diurnal stomatal closure via regulating reactive oxygen species dynamics in Arabidopsis.2020 · DOI: 10.1111/jpi.12640 Melatonin Represses Oil and Anthocyanin Accumulation in Seeds.2020 · DOI: 10.1104/pp.20.00117 Melatonin Regulates Chloroplast Protein Quality Control via a Mitogen-Activated Protein Kinase Signaling Pathway.2021 · DOI: 10.3390/antiox10040511 Melatonin inhibits seed germination by crosstalk with abscisic acid, gibberellin, and auxin in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1111/jpi.12736 CAND2/PMTR1 Is Required for Melatonin-Conferred Osmotic Stress Tolerance in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.3390/ijms22084014 Roles of Endogenous Melatonin in Resistance to Botrytis cinerea Infection in an Arabidopsis Model.2021 · DOI: 10.3389/fpls.2021.683228 H2S aids osmotic stress resistance by S-sulfhydration of melatonin production-related enzymes in Arabidopsis thaliana.2022 · DOI: 10.1007/s00299-021-02813-2

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: A2Y5T7`	催化血清素的N-乙酰化生成N-乙酰血清素，这是褪黑素合成的倒数第二步。	暂无已核实直接文献
`Os05g0481000`	催化血清素 N-乙酰化成 N-乙酰血清素，这是合成褪黑素的倒数第二步。	Molecular cloning of rice serotonin N-acetyltransferase, the penultimate gene in plant melatonin biosynthesis.2013 · DOI: 10.1111/jpi.12011 Cellular localization and kinetics of the rice melatonin biosynthetic enzymes SNAT and ASMT.2014 · DOI: 10.1111/jpi.12103 Cloning and characterization of the serotonin N-acetyltransferase-2 gene (SNAT2) in rice (Oryza sativa).2016 · DOI: 10.1111/jpi.12339 Overexpression of rice serotonin N-acetyltransferase 1 in transgenic rice plants confers resistance to cadmium and senescence and increases grain yield.2017 · DOI: 10.1111/jpi.12392

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000101 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006474 N-terminal protein amino acid acetylation 生物过程

GO:0006515 protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009644 response to high light intensity 生物过程

GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程

GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程

GO:0010344 seed oilbody biogenesis 生物过程

GO:0010555 response to mannitol 生物过程

GO:0018394 peptidyl-lysine acetylation 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G32070

dosa:Os05g0481000

osa:4339123

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.981

排名 1 · TkA01G634450 · TK1151

细胞核0.028

排名 2 · TkA01G634450 · TK1151

线粒体0.020

排名 3 · TkA01G634450 · TK1151

细胞质0.016

排名 4 · TkA01G634450 · TK1151

细胞膜0.011

排名 5 · TkA01G634450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q7X9V3`	拟南芥	sp\|Q7X9V3\|GNAT2_ARATH GCN5-related N-acetyltransferase 2, chloroplastic	67.500%	Swiss-Prot	高置信
`A2Y5T7`	水稻	sp\|A2Y5T7\|SNAT1_ORYSI Serotonin N-acetyltransferase 1, chloroplastic	69.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5KQI6`	水稻	sp\|Q5KQI6\|SNAT1_ORYSJ Serotonin N-acetyltransferase 1, chloroplastic	69.100%	Swiss-Prot	中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情