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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G570420
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 143568544-143570528 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1308 bp · TkA01G570420|TK1151|cDNA

TGGAAATGCAACTTAACGGATTCGGATTGTAACCTAAAACCCGACCCATGATGCCAGTTCGCACAAAATCTGTTAACATCATATTCACTGCTTCAAACGCGCAGGGATCGATAACACAATCAAAATCAAACATCCATGAATCGATTCTACAATGCTACCAGCGTAAGGTTCTAGGGTTCTTCAAAGACGCTTTCTTTTAAATCTAATTTGTTAATTTTTACTTCAGTAGCTGATAATTTGTTTCTGTTATGTTTAAATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

903 bp · TkA01G570420|TK1151|CDS

ATGAATCGATTCTACAATGCTACCAGCAAAAAGCTCGGAGGTCTCAGAGGCTATGCTGTTGGTGCAGAGGGTAGGAATGTCTCTGATGCTCGAAGCCTCAAAATTGAAGGGGTTAAAGATATTATAGCTGTTGCTTCCGGCAAAGGTGGCGTAGGCAAGTCAACTACTGCCGTTAACTTAGCGGTTTCACTAGCTAATAAGTGCCAACTTAGTGTTGGATTGCTGGATGCTGATGTATATGGACCATCGATTCCTACAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

300 aa · TkA01G570420|TK1151|PROTEIN

MNRFYNATSKKLGGLRGYAVGAEGRNVSDARSLKIEGVKDIIAVASGKGGVGKSTTAVNLAVSLANKCQLSVGLLDADVYGPSIPTMMKLHGKPEVSKGNKMIPIENHGVKCISMGSLVEKDAPIVWRGPMVMKALEQMTRGVEWGQLDILVVDMPPGTGDAQISMSQRLQLSGALIVSTPQDVALMDARRGVKMFSKVSVPILGIIENMSYFKCPHCSKPSYIFGKGGARKTADEMELGFVGEIPLEEEIRSGSDEGVP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G570420
TK1151 IDTkA01G570420
OH-1004 IDLXL04_000975
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G570420
位置Chr01:143568544-143570528 (-)
描述Similar to nubpl: Iron-sulfur protein NUBPL
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g19540 对早期营养生长至关重要。
The evolutionarily conserved iron-sulfur protein INDH is required for complex I assembly and mitochondrial translation in Arabidopsis [corrected].2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.117283

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000975 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程
GO:0032543 mitochondrial translation 生物过程
GO:0032981 mitochondrial respiratory chain complex I assembly 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0051539 4 iron, 4 sulfur cluster binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G19540
ddi:DDB_G0291193
hsa:80224
mmu:76826
yli:2907193
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.936
排名 1 · TkA01G570420 · TK1151
细胞质0.061
排名 2 · TkA01G570420 · TK1151
细胞核0.058
排名 3 · TkA01G570420 · TK1151
细胞膜0.017
排名 4 · TkA01G570420 · TK1151
质体0.014
排名 5 · TkA01G570420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25199nSTAND_NTPase537-78 aa
PF10609ParA38-281 aa
PF13614AAA_3140-79 aa
PF13481AAA_2540-68 aa
PF09140MipZ41-162 aa
PF07015VirC141-79 aa
PF01656CbiA42-207 aa
PF20720nSTAND343-68 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G570420PF25199nSTAND_NTPase537780.2511.9
TkA01G570420PF10609ParA382811.3e-99333.4
TkA01G570420PF13614AAA_3140796.4e-0833.4
TkA01G570420PF13481AAA_2540680.01116.1
TkA01G570420PF09140MipZ411629.5e-0625.8
TkA01G570420PF07015VirC141790.01615.3
TkA01G570420PF01656CbiA422073.9e-1143.7
TkA01G570420PF20720nSTAND343680.3811.1
TkA01G570420PF02374ArsA_ATPase44673e-0524.1
TkA01G570420PF00142Fer4_NifH46740.0001422.2
TkA01G570420PF00448SRP5446820.2211.9
TkA01G570420PF02374ArsA_ATPase1351613e-0524.1
TkA01G570420PF02374ArsA_ATPase1752133e-0524.1
TkA01G570420PF01656CbiA2382603.9e-1143.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49472拟南芥sp|O49472|INDH_ARATH Iron-sulfur protein required for NADH dehydrogenase, mitochondrial70.300%Swiss-Prot高置信

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