RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G564370
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 141933313-141933803 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

414 bp · TkA01G564370|TK1151|cDNA

ATGGCAACGCCACCATCCAGTCCAACATCCTCACCCTCACCAACTCCACGCCGGTTCAGATTGGCCGCGCTCTTTACCCCCAGAAGATCCCTACGAAGAATTCGTCGTCGCTCCTTCCGTTCTCCACCTCCTTCATCTTCGCCATGGCTCCCACCAGACACGTTCTTCCAGGCCACGGCGGTTGACGGGAATTCAAGCAATCATGTGTTCGGTGTTGAGTTTGATGTGTTCGCGAATGAAGAGTTTGGGGATATTAATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

414 bp · TkA01G564370|TK1151|CDS

ATGGCAACGCCACCATCCAGTCCAACATCCTCACCCTCACCAACTCCACGCCGGTTCAGATTGGCCGCGCTCTTTACCCCCAGAAGATCCCTACGAAGAATTCGTCGTCGCTCCTTCCGTTCTCCACCTCCTTCATCTTCGCCATGGCTCCCACCAGACACGTTCTTCCAGGCCACGGCGGTTGACGGGAATTCAAGCAATCATGTGTTCGGTGTTGAGTTTGATGTGTTCGCGAATGAAGAGTTTGGGGATATTAATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

137 aa · TkA01G564370|TK1151|PROTEIN

MATPPSSPTSSPSPTPRRFRLAALFTPRRSLRRIRRRSFRSPPPSSSPWLPPDTFFQATAVDGNSSNHVFGVEFDVFANEEFGDINDNHVGYFRDQDEGFRRLQLNNGRINSASELELLNFVNLFLVFLIKPISECS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G564370
TK1151 IDTkA01G564370
OH-1004 IDLXL04_009625
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)82.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 56.934 / OH-1004 71.538
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G564370
位置Chr01:141933313-141933803 (-)
描述Similar to LECRK71: L-type lectin-domain containing receptor kinase VII.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g04960 含 L 型凝集素结构域的受体激酶 VII.1。 暂无已核实直接文献
At1g53080 类凝集素蛋白 At1g53080。 暂无已核实直接文献
At5g03350 在效应子触发免疫（ETI）反应中起积极作用。
A salicylic acid-induced lectin-like protein plays a positive role in the effector-triggered immunity response of Arabidopsis thaliana to Pseudomonas syringae Avr-Rpm1.2013 · DOI: 10.1094/mpmi-02-13-0044-r
Contrasting Roles of the Apoplastic Aspartyl Protease APOPLASTIC, ENHANCED DISEASE SUSCEPTIBILITY1-DEPENDENT1 and LEGUME LECTIN-LIKE PROTEIN1 in Arabidopsis Systemic Acquired Resistance.2014 · DOI: 10.1104/pp.114.239665
At2g43690 可能的含L型凝集素结构域的受体激酶 V.3。 暂无已核实直接文献
At2g43700 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009625 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G43690
ath:AT2G43700
ath:AT4G04960
ath:AT4G28350
ath:AT4G29050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.466
排名 1 · TkA01G564370 · TK1151
细胞质0.295
排名 2 · TkA01G564370 · TK1151
内质网0.127
排名 3 · TkA01G564370 · TK1151
细胞膜0.126
排名 4 · TkA01G564370 · TK1151
质体0.103
排名 5 · TkA01G564370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09224DUF196154-111 aa
PF00139Lectin_legB56-91 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G564370PF09224DUF1961541110.02914.4
TkA01G564370PF00139Lectin_legB56913e-0834.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S9U1拟南芥sp|Q9S9U1|LRK71_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase VII.149.200%Swiss-Prot低置信
Q9LNN3拟南芥sp|Q9LNN3|LECT4_ARATH Lectin-like protein At1g5308067.700%Swiss-Prot低置信
Q9LZF5拟南芥sp|Q9LZF5|LECT6_ARATH Lectin-like protein70.000%Swiss-Prot低置信
O22834拟南芥sp|O22834|LRK53_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase V.341.300%Swiss-Prot低置信
O22833拟南芥sp|O22833|LRK54_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase V.468.800%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看