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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G548510
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 137767484-137768135 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

487 bp · TkA01G548510|TK1151|cDNA

GGGAAACTATGTTATATCTAATCACAATTAATCTACTAATTAATCCGTTCTTGACATTTTAAATTTTGAAGAGGGGGAAGATACAACTAAATGTTCAGCCGTATTAGATCAATATATACCTAAGAAGATGAAAAATAAGTACCATGTACTGCAACAGGGTGATGAAATTTATGATGCCACGTTGATTCAGACAAATATTGGGGGGAACAATAACAAGTTTTATATTATACAAGCACTAGAATCCAACGATGGATCTAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

360 bp · TkA01G548510|TK1151|CDS

ATGAAAAATAAGTACCATGTACTGCAACAGGGTGATGAAATTTATGATGCCACGTTGATTCAGACAAATATTGGGGGGAACAATAACAAGTTTTATATTATACAAGCACTAGAATCCAACGATGGATCTAAATTTATGGTTTACCATAGATGGGGAAGGATTTGTGTGCCGGGTATGATTTGGTTGCATGGTTTCTACACCTGCGTACAGTCAGCATTGGATGTGTTCAAGAAAAAGTTCTATGAAAAGACTAAGAACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

120 aa · TkA01G548510|TK1151|PROTEIN

MKNKYHVLQQGDEIYDATLIQTNIGGNNNKFYIIQALESNDGSKFMVYHRWGRICVPGMIWLHGFYTCVQSALDVFKKKFYEKTKNNWSDRKQCVSKPKLYKWVEKDYGVGGEIDVSCSS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G548510
TK1151 IDTkA01G548510
OH-1004 IDLXL04_001310
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)66.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.667 / OH-1004 18.650
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G548510
位置Chr01:137767484-137768135 (+)
描述Similar to PARP2: Poly [ADP-ribose] polymerase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g02390 参与碱基切除修复（BER）途径，通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0351200 参与碱基切除修复（BER）途径，通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 暂无已核实直接文献
Os01g0351100 参与碱基切除修复（BER）途径，通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006302 double-strand break repair 生物过程
GO:0006303 double-strand break repair via nonhomologous end joining 生物过程
GO:0030592 DNA ADP-ribosylation 生物过程
GO:0070212 protein poly-ADP-ribosylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003950 NAD+ poly-ADP-ribosyltransferase activity 分子功能
GO:0016779 nucleotidyltransferase activity 分子功能
GO:0140806 NAD+-protein-aspartate ADP-ribosyltransferase activity 分子功能
GO:0140807 NAD+-protein-glutamate ADP-ribosyltransferase activity 分子功能
GO:1990404 NAD+-protein mono-ADP-ribosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G02390
dosa:Os01g0351200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.627
排名 1 · TkA01G548510 · TK1151
细胞质0.397
排名 2 · TkA01G548510 · TK1151
细胞外0.108
排名 3 · TkA01G548510 · TK1151
线粒体0.041
排名 4 · TkA01G548510 · TK1151
细胞膜0.038
排名 5 · TkA01G548510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05406WGR15-93 aa
PF13585CHU_C19-53 aa
PF01794Ferric_reduct34-83 aa
PF09404C12orf66_like56-106 aa
PF13585CHU_C75-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G548510PF05406WGR15936.2e-1968.6
TkA01G548510PF13585CHU_C19530.05114.4
TkA01G548510PF01794Ferric_reduct34830.1512.8
TkA01G548510PF09404C12orf66_like561060.2310.8
TkA01G548510PF13585CHU_C75920.05114.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q11207拟南芥sp|Q11207|PARP2_ARATH Poly [ADP-ribose] polymerase 252.300%Swiss-Prot高置信
Q5Z8Q9水稻sp|Q5Z8Q9|PRP2A_ORYSJ Poly [ADP-ribose] polymerase 2-A54.400%Swiss-Prot高置信
Q0JMY1水稻sp|Q0JMY1|PRP2B_ORYSJ Poly [ADP-ribose] polymerase 2-B47.700%Swiss-Prot中等置信

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