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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G532610
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 133703604-133707340 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2541 bp · TkA01G532610|TK1151|cDNA

GTAACCTAACACACAAGAAACCTAACTGATAACACCACCTCGACGCAGCCCACACACAGGCATCGGTGGAGAATTGATATTCGTGACTTTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCAAAAACCCTAAACCCTAAAAGGAGCACCCAAGACTTTATAGATCCATGGCGACCGCCGCGTTGCTCAGATCTCTTCGTCGACGAGACATCTCATCTGCTCCTCTCGCCGCCTTTAAATCCTTAAGT...

2043 bp · TkA01G532610|TK1151|CDS

ATGGCGACCGCCGCGTTGCTCAGATCTCTTCGTCGACGAGACATCTCATCTGCTCCTCTCGCCGCCTTTAAATCCTTAAGTGGAGCTAAAACAGCATCTTCTGGTACCTACTTGAGCCATAAGTTGGGTGTCATTGCCAGACCCTTCAGTTCGAGACCTCTTGGAAATGAAGTTATTGGTATCGACTTGGGTACCACAAACTCATGTGTTTCAGTCATGGAGGGCAAGACTGCCAAAGTCATTGAAAACTCTGAAGGAGC...

680 aa · TkA01G532610|TK1151|PROTEIN

MATAALLRSLRRRDISSAPLAAFKSLSGAKTASSGTYLSHKLGVIARPFSSRPLGNEVIGIDLGTTNSCVSVMEGKTAKVIENSEGARTTPSVVAFNQKGELIVGTPAKRQAVTNPTNTVFGTKRLIGRRFDDSQTQKEMAMVPYKIVKAPNGDAWVEANGQKYSPSQIGAFVLTKMKETAEAYLGKTINKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLDVQRIINEPTAAALSYGLNNKEGLIAVFDLGGGTFDVSILEIS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G532610
TK1151 IDTkA01G532610
OH-1004 IDLXL04_001476
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G532610
位置Chr01:133703604-133707340 (+)
描述Similar to Heat shock 70 kDa protein, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g09590 参与含铁硫[Fe-S]簇蛋白成熟的分子伴侣。 暂无已核实直接文献
At4g37910 参与含铁硫[Fe-S]簇蛋白成熟的分子伴侣。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_001476 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程
GO:0017004 cytochrome complex assembly 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0140964 intracellular auxin homeostasis 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G37910
ath:AT5G09590
sot:102582209
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

线粒体0.924
排名 1 · TkA01G532610 · TK1151
细胞质0.105
排名 2 · TkA01G532610 · TK1151
细胞核0.064
排名 3 · TkA01G532610 · TK1151
细胞膜0.035
排名 4 · TkA01G532610 · TK1151
质体0.032
排名 5 · TkA01G532610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012HSP7058-650 aa
PF06723MreB_Mbl58-110 aa
PF14450FtsA60-78 aa
PF06723MreB_Mbl188-424 aa
PF14450FtsA244-409 aa
PF27883PPI_C301-318 aa
PF01031Dynamin_M338-404 aa
PF02782FGGY_C374-428 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G532610PF00012HSP70586502e-272905.5
TkA01G532610PF06723MreB_Mbl581102.2e-1143.9
TkA01G532610PF14450FtsA60780.01616.3
TkA01G532610PF06723MreB_Mbl1884242.2e-1143.9
TkA01G532610PF14450FtsA2444090.01616.3
TkA01G532610PF27883PPI_C3013181.99.4
TkA01G532610PF01031Dynamin_M3384040.06513.1
TkA01G532610PF02782FGGY_C3744280.0003721.1
TkA01G532610PF14450FtsA5526280.01616.3
TkA01G532610PF10018Med45576090.1312.6
TkA01G532610PF27883PPI_C5615781.99.4
TkA01G532610PF01031Dynamin_M5776080.06513.1
TkA01G532610PF02782FGGY_C5996210.0003721.1
TkA01G532610PF06723MreB_Mbl6126462.2e-1143.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDZ0拟南芥sp|Q9LDZ0|HSP7J_ARATH Heat shock 70 kDa protein 10, mitochondrial81.700%Swiss-Prot高置信
Q8GUM2拟南芥sp|Q8GUM2|HSP7I_ARATH Heat shock 70 kDa protein 9, mitochondrial82.400%Swiss-Prot高置信

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