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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G510630
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 127941407-127944295 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2112 bp · TkA01G510630|TK1151|cDNA

ATGTTATCGATCACTGTCCTTGTTGATTCAATAAACGAAGAAGGTGCTGTCCTTTTGGAGTTCAGATTCTCTCTTTCTGACCCAAATAACAATCTCCGTACATGGAATAATCAATCCGATTCATTTCCTTGTAATTGGATTGGTATAAACTGTACCATTGATCAGAAGGTAACGTCTATAAACCTCAGTAACCTTAATCTATCCGGCTCTCTATCACCAACCAAGCTCCAGAACCTCGAGCATCTTACGAGTTTGGTCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2112 bp · TkA01G510630|TK1151|CDS

ATGTTATCGATCACTGTCCTTGTTGATTCAATAAACGAAGAAGGTGCTGTCCTTTTGGAGTTCAGATTCTCTCTTTCTGACCCAAATAACAATCTCCGTACATGGAATAATCAATCCGATTCATTTCCTTGTAATTGGATTGGTATAAACTGTACCATTGATCAGAAGGTAACGTCTATAAACCTCAGTAACCTTAATCTATCCGGCTCTCTATCACCAACCAAGCTCCAGAACCTCGAGCATCTTACGAGTTTGGTCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

703 aa · TkA01G510630|TK1151|PROTEIN

MLSITVLVDSINEEGAVLLEFRFSLSDPNNNLRTWNNQSDSFPCNWIGINCTIDQKVTSINLSNLNLSGSLSPTKLQNLEHLTSLVLWQNVLSGEIPPEIGNFSRLELLALHANSFTGSIPKEIGKLTELMRLYLYTNHLNGSIPEELGNCMKLVEIDLSENRLSGGIPKELGNIKNLRLLHLFENLLVGGIPKELSDLKELRKIDLSINNLTGAIPFEIGQLQNLKRLHLSDNYFFGHIPSEIGNLSQLVTFNVSSNRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G510630
TK1151 IDTkA01G510630
OH-1004 IDLXL04_001783
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 38.691 / OH-1004 24.440
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G510630
位置Chr01:127941407-127944295 (+)
描述Similar to At1g17230: Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g17230
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At2g33170 推测的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶At2g33170。 暂无已核实直接文献
At4g20270 富含LRR的受体样激酶（LRR-RLK），类似于BAM1和CLV1，参与CLAVATA家族肽（如CLE25、CLE26和CLE45）的检测，并通过磷酸化CIK蛋白（CIKs）以及可能的PBL34、PBL35和PBL36，调节原韧皮部分化和分生组织维持所需的触发信号传导。 暂无已核实直接文献
At3g49670 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001783 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010074 maintenance of meristem identity 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010449 root meristem growth 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0001653 peptide receptor activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0038023 signaling receptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G34110
ath:AT2G33170
ath:AT5G48940
ath:AT5G63930
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.804
排名 1 · TkA01G510630 · TK1151
内质网0.107
排名 2 · TkA01G510630 · TK1151
细胞质0.070
排名 3 · TkA01G510630 · TK1151
溶酶体／液泡0.049
排名 4 · TkA01G510630 · TK1151
细胞核0.039
排名 5 · TkA01G510630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_212-52 aa
PF13855LRR_856-115 aa
PF12799LRR_456-90 aa
PF23211LRR_LRWD156-116 aa
PF25013LRR_Zer-156-112 aa
PF24048LRR_NXF1-556-94 aa
PF00560LRR_157-73 aa
PF23598LRR_1461-183 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G510630PF08263LRRNT_212521.6e-1041.8
TkA01G510630PF13855LRR_8561151.3e-2073.6
TkA01G510630PF12799LRR_456902.4e-1247.4
TkA01G510630PF23211LRR_LRWD1561160.000321.3
TkA01G510630PF25013LRR_Zer-1561120.001719.2
TkA01G510630PF24048LRR_NXF1-556945.67.3
TkA01G510630PF00560LRR_157732e-35113.8
TkA01G510630PF23598LRR_14611836.5e-30104.8
TkA01G510630PF17795Vault_376870.1512.9
TkA01G510630PF24758LRR_At5g56370801380.2112.0
TkA01G510630PF00560LRR_1811032e-35113.8
TkA01G510630PF29252LRR_NLRC41021410.004217.1
TkA01G510630PF13855LRR_81051641.3e-2073.6
TkA01G510630PF12799LRR_41051442.4e-1247.4
TkA01G510630PF00560LRR_11061272e-35113.8
TkA01G510630PF23286LRR_131181720.01815.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SHI2拟南芥sp|Q9SHI2|Y1723_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723055.300%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393047.300%Swiss-Prot低置信
O49318拟南芥sp|O49318|Y2317_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g3317046.400%Swiss-Prot低置信
O65440拟南芥sp|O65440|BAME3_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM343.400%Swiss-Prot低置信
Q9M2Z1拟南芥sp|Q9M2Z1|BAME2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM240.900%Swiss-Prot低置信

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