TkA01G321830 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G321830

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 79986992-79993098 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2646 bp · TkA01G321830|TK1151|cDNA

CAATGTACCACTCCGCCACCCGCTGTCCATGCTCCTGCCGTCTTGTGTGTGAGTCAAGAGTCAGAAATGATTGACGAACAGAACGCGACAGCTCCATTTTTGACTGATGAAGAAGAAGATTATAATACGAGGAAGAAATGGAGAACGCCTCTTCTGTATATCATGTCAATCATAGCTCTAATTTGTAAGTCATTCCTTGTGGCTTGGTTTCAGGTTTTTTTGCAACTCGAATCGTCATAAGTTTCAATTCCGTTTTGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1164 bp · TkA01G321830|TK1151|CDS

ATGATTGACGAACAGAACGCGACAGCTCCATTTTTGACTGATGAAGAAGAAGATTATAATACGAGGAAGAAATGGAGAACGCCTCTTCTGTATATCATGTCAATCATAGCTCTAATTTTTATCCTCCTTACATTAGGAGGCAGTTCGAGGTCCACCTTGTTAGATGGCGGGAAAAAGAGAATAGAAGCCGATGATACAGTTGAGTCATGGGAAGCAGTGGTCGCCGCCGATGATGCTCGTTGCTCTGAGATCGGAGCATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

387 aa · TkA01G321830|TK1151|PROTEIN

MIDEQNATAPFLTDEEEDYNTRKKWRTPLLYIMSIIALIFILLTLGGSSRSTLLDGGKKRIEADDTVESWEAVVAADDARCSEIGASVLRAGGHAVDASVAVALCVGVVNPMASGIGGGGFMVVRSAETSQTLAFDFRETAPLAASENMYQKDLNAKYFGALSMGVPGEIAGLHKAWLKYGRLPWKSLFTPAINLANNGFIVAPYLAKHISSFATTIKKDPGLQQIYAPKGKVLEAGDICYNPKLGLTLEIIANEGAKAF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G321830`
TK1151 ID	TkA01G321830
OH-1004 ID	LXL04_027914
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	65.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 94.057 / OH-1004 59.325 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G321830

位置 Chr01:79986992-79993098 (-)

描述 Similar to GGT3: Glutathione hydrolase 3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g29210`	可能通过将液泡谷胱甘肽缀合物降解为半胱氨酸缀合物来保护植物免受某些外源化学物质的侵害。	Glutathione conjugates in the vacuole are degraded by gamma-glutamyl transpeptidase GGT3 in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.03005.x
`At4g39640`	可能通过代谢胞外氧化谷胱甘肽(GSSG)在防止氧化应激中起作用。	暂无已核实直接文献
`At4g39650`	可能需要参与谷胱甘肽向发育种子运输。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027914 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002682 regulation of immune system process 生物过程

GO:0006508 proteolysis 生物过程

GO:0006520 amino acid metabolic process 生物过程

GO:0006536 glutamate metabolic process 生物过程

GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0006691 leukotriene metabolic process 生物过程

GO:0006749 glutathione metabolic process 生物过程

GO:0006750 glutathione biosynthetic process 生物过程

GO:0006751 glutathione catabolic process 生物过程

GO:0006805 xenobiotic metabolic process 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0007283 spermatogenesis 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G29210

ath:AT4G39640

ath:AT4G39650

mmu:14598

rno:116568

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.429

排名 1 · TkA01G321830 · TK1151

内质网0.226

排名 2 · TkA01G321830 · TK1151

高尔基体0.183

排名 3 · TkA01G321830 · TK1151

细胞质0.161

排名 4 · TkA01G321830 · TK1151

细胞膜0.080

排名 5 · TkA01G321830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01019G_glu_transpept81-366 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G321830	`PF01019`	G_glu_transpept	81	366	1.7e-104	351.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M0G0`	拟南芥	sp\|Q9M0G0\|GAGT3_ARATH Glutathione hydrolase 3	55.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q8VYW6`	拟南芥	sp\|Q8VYW6\|GAGT1_ARATH Glutathione hydrolase 1	53.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q680I5`	拟南芥	sp\|Q680I5\|GAGT2_ARATH Glutathione hydrolase 2	51.000%	Swiss-Prot	高置信

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