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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G169420
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 43451009-43453404 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2081 bp · TkA01G169420|TK1151|cDNA

GCCAACTACAATAAGCCAAGCCTAGCCAAAGAAAAATAATGATAAAGCCAACTAAAATTCACATAGCACACTGAAAATAATATATAGTATAATTAATTGATATCTCTTTCATAAACAAAAGCAAGTTGCATAAAAAATTTAACGGAGACAAGTCAACCTTTTTTCTCATTGGCTTTCTTCCCGAAAAGTTCTCGCAAAGCCATCTCCGTTCACACCACCACCTGTTTGATATAATTCCGCAGTGAGTTCTCTCCAGTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1146 bp · TkA01G169420|TK1151|CDS

ATGACTTCGTGTTTTTGTGTTTGGTCGAAAATAGAAAGCTCCGAACTTGATGGCGAGGTTATACCTGCAACAGTACCATCGCTGCCACATAGCCCTCGGACCCAAGCTGAGATATTACAGTCGGCGAATTTGAAGTCGTTTAGCTTCAATGTGCTTAAAACAGCGACTAGGAACTTCCGTCCTGATAGTGTGTTGGGAGAAGGTGGTTTCGGTTTAGTTTTCAAGGGTTGGATTGATGAACATTCACTCGCAGCTGCTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

381 aa · TkA01G169420|TK1151|PROTEIN

MTSCFCVWSKIESSELDGEVIPATVPSLPHSPRTQAEILQSANLKSFSFNVLKTATRNFRPDSVLGEGGFGLVFKGWIDEHSLAAAKPGTGTVIAVKRLNQEGVQGHQEWLAEINYLGQLHHPNLVELIGYCLEDDQRLLVYEFMSKGSLENHLFRRSSYFQPLSWNLRLKVAVGAARGLAYLHSPDAKVIYRDFKCSNILIDSNYNAKLSDFGLAKDGPIDGRSHVSTRVMGTYGYAAPEYMATGHLTERSDIYSFGVV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G169420
TK1151 IDTkA01G169420
OH-1004 IDLXL04_012363
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G169420
位置Chr01:43451009-43453404 (-)
描述Similar to RLCK176: Receptor-like cytoplasmic kinase 176
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07570 可能的双功能激酶。
Novel protein kinase of Arabidopsis thaliana (APK1) that phosphorylates tyrosine, serine and threonine.1992 · DOI: 10.1007/bf00046450
At5g02290 可能在植物生长和发育的调节中发挥作用（可能）。 暂无已核实直接文献
At2g28930 可能的双功能激酶。
Light-induced stomatal opening is affected by the guard cell protein kinase APK1b.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0097161
At2g39660 在免疫反应中起核心作用。
The membrane-anchored BOTRYTIS-INDUCED KINASE1 plays distinct roles in Arabidopsis resistance to necrotrophic and biotrophic pathogens.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.035576
Phosphorylation of receptor-like cytoplasmic kinases by bacterial flagellin.2010 · DOI: 10.4161/psb.11500
Receptor-like cytoplasmic kinases integrate signaling from multiple plant immune receptors and are targeted by a Pseudomonas syringae effector.2010 · DOI: 10.1016/j.chom.2010.03.007
A Xanthomonas uridine 5'-monophosphate transferase inhibits plant immune kinases.2012 · DOI: 10.1038/nature10962
BIK1 interacts with PEPRs to mediate ethylene-induced immunity.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1215543110
Inverse modulation of plant immune and brassinosteroid signaling pathways by the receptor-like cytoplasmic kinase BIK1.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1302154110
Identification and functional analysis of phosphorylation residues of the Arabidopsis BOTRYTIS-INDUCED KINASE1.2013 · DOI: 10.1007/s13238-013-3053-6
The FLS2-associated kinase BIK1 directly phosphorylates the NADPH oxidase RbohD to control plant immunity.2014 · DOI: 10.1016/j.chom.2014.02.009
Microbe-associated molecular pattern-induced calcium signaling requires the receptor-like cytoplasmic kinases, PBL1 and BIK1.2014 · DOI: 10.1186/s12870-014-0374-4
Regulatory role of BOTRYTIS INDUCED KINASE1 in ETHYLENE INSENSITIVE3-dependent gene expression in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1007/s00299-015-1812-y
The Decoy Substrate of a Pathogen Effector and a Pseudokinase Specify Pathogen-Induced Modified-Self Recognition and Immunity in Plants.2015 · DOI: 10.1016/j.chom.2015.08.004
The MAP4 Kinase SIK1 Ensures Robust Extracellular ROS Burst and Antibacterial Immunity in Plants.2018 · DOI: 10.1016/j.chom.2018.08.007
Ligand-induced monoubiquitination of BIK1 regulates plant immunity.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2210-3
The calcium-permeable channel OSCA1.3 regulates plant stomatal immunity.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2702-1
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0110900 在介导先天免疫的微生物肽聚糖 和真菌几丁质信号通路中的 CERK1 下游发挥作用。
OsCERK1 and OsRLCK176 play important roles in peptidoglycan and chitin signaling in rice innate immunity.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12710
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012363 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0080141 regulation of jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0080142 regulation of salicylic acid biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07570
ath:AT2G28930
ath:AT2G39660
ath:AT5G02290
dosa:Os05g0110900
osa:4337593
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.658
排名 1 · TkA01G169420 · TK1151
细胞质0.264
排名 2 · TkA01G169420 · TK1151
细胞核0.249
排名 3 · TkA01G169420 · TK1151
内质网0.039
排名 4 · TkA01G169420 · TK1151
高尔基体0.029
排名 5 · TkA01G169420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase62-339 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr63-340 aa
PF24192DUF7417232-263 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G169420PF00069Pkinase623395.5e-44151.2
TkA01G169420PF07714PK_Tyr_Ser-Thr633403.4e-45155.1
TkA01G169420PF24192DUF74172322630.212.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q06548拟南芥sp|Q06548|PBL9_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL968.400%Swiss-Prot高置信
P43293拟南芥sp|P43293|PBL11_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL1168.100%Swiss-Prot高置信
P46573拟南芥sp|P46573|PBL10_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL1070.400%Swiss-Prot高置信
O48814拟南芥sp|O48814|BIK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase BIK167.200%Swiss-Prot高置信
Q65XV8水稻sp|Q65XV8|RK176_ORYSJ Receptor-like cytoplasmic kinase 17667.600%Swiss-Prot高置信

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