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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G118190
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 29954750-29959116 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2235 bp · TkA01G118190|TK1151|cDNA

AGTTTGTGCATTTTGTCCTAATTACGTAAAGGCTTCCGTGCCTTTGCTGGTGTTAGACTTAAAATACTCCATAGTTAACACGCCCAAAATACTGCTCGACCAAATCTCGGATCGGGAGAAACCTTTCCAGAAACACGACGGCATTGTTGTTCTCCGATCAATCTTTGAATTCACGTGGTTGTAAATTCGATTTGCTATCATTTCCTGCTGTTTCTACAACTTCGTTGCGTGAATCGTTCGATCTGAGATTCGATCGATTG...

1431 bp · TkA01G118190|TK1151|CDS

ATGCTGAAACGCAATCGTCAACCACAGTACAATGAGTCCCTCTCCGACAAAGTTCATCGCTACCGCGGGGCCATTCTGGTCATTTCGATACCTCTCCTCCTCATCTCCTTCGTTTTGTTTCTGATGCCTTCTGCGCGGTCTCCCAGCAATGCTGGTTTGCCTGCTAACCGTAAGTTTTCGCCAAATTACGTGCTACAAAAGGATCCGTCATCGACTAGGTATGCTGTGATCTTTGATGCTGGCAGTTCGGGGAGTAGAGT...

476 aa · TkA01G118190|TK1151|PROTEIN

MLKRNRQPQYNESLSDKVHRYRGAILVISIPLLLISFVLFLMPSARSPSNAGLPANRKFSPNYVLQKDPSSTRYAVIFDAGSSGSRVHVFCFDQNLDLVHIGKELELFEQLTPGLSAFASDPKAAADSLLPLLQKSEAAVPRDLRQNTPVKVGATAGLRQLGVDASERILQSVKDFLKVKSNLKSNDDWVTVLDGTQEGAYQWVTINYLLKRLGQKYSETVGVVDLGGGSVQMAYALSEEDAAKAPRVLNGEDTYVKEMF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G118190
TK1151 IDTkA01G118190
OH-1004 IDLXL04_011468
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)35.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 45.168 / OH-1004 35.445
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G118190
位置Chr01:29954750-29959116 (-)
描述Similar to APY6: Probable apyrase 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_011468 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007186 G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程
GO:0009134 nucleoside diphosphate catabolic process 生物过程
GO:0009181 purine ribonucleoside diphosphate catabolic process 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0033602 negative regulation of dopamine secretion 生物过程
GO:0046032 ADP catabolic process 生物过程
GO:2001170 negative regulation of ATP biosynthetic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005604 basement membrane 细胞组分
GO:0005615 extracellular space 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14230
ath:AT1G14240
ath:AT1G14250
ath:AT2G02970
mmu:12495
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

高尔基体0.767
排名 1 · TkA01G118190 · TK1151
内质网0.118
排名 2 · TkA01G118190 · TK1151
细胞质0.081
排名 3 · TkA01G118190 · TK1151
细胞膜0.056
排名 4 · TkA01G118190 · TK1151
细胞外0.043
排名 5 · TkA01G118190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01150GDA1_CD3968-473 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G118190PF01150GDA1_CD39684732.2e-104350.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SPM5拟南芥sp|Q9SPM5|APY2_ARATH Apyrase 265.700%Swiss-Prot高置信
Q9SQG2拟南芥sp|Q9SQG2|APY1_ARATH Apyrase 159.500%Swiss-Prot高置信
Q8H7L6水稻sp|Q8H7L6|APY1_ORYSJ Probable apyrase 163.000%Swiss-Prot高置信
Q6Z4P2水稻sp|Q6Z4P2|APY2_ORYSJ Probable apyrase 261.200%Swiss-Prot高置信

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