基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G044900
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 11601500-11602079
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA507 bp · TkA01G044900|TK1151|cDNA
ACAGTTGGTCTTCATCTTGCTAACAGTCTTTTATTGATTGCCATAGTTACGAGTTGCGAGATATCAACTAATCCTAATCCTAACCCTAACAATAATGTTAACTCATATCCCACTAAAGCCAATATGAATCCTTACTCTAAGCCAAATCTTAACGGCAACTACAACCCCAACCCCAACCCAAATTCCGTCCCCACCCCCACCCCAGATTCCAATGCAAACCCATCAATATACATAAACCCAACATCAGCAACCTGCCCTAG...
CDS
下载 CDS FASTA507 bp · TkA01G044900|TK1151|CDS
ACAGTTGGTCTTCATCTTGCTAACAGTCTTTTATTGATTGCCATAGTTACGAGTTGCGAGATATCAACTAATCCTAATCCTAACCCTAACAATAATGTTAACTCATATCCCACTAAAGCCAATATGAATCCTTACTCTAAGCCAAATCTTAACGGCAACTACAACCCCAACCCCAACCCAAATTCCGTCCCCACCCCCACCCCAGATTCCAATGCAAACCCATCAATATACATAAACCCAACATCAGCAACCTGCCCTAG...
168 aa · TkA01G044900|TK1151|PROTEIN
TVGLHLANSLLLIAIVTSCEISTNPNPNPNNNVNSYPTKANMNPYSKPNLNGNYNPNPNPNSVPTPTPDSNANPSIYINPTSATCPRDTLRLGVCASLLGGLVSLEVGSPPVKPCCSLIQGLVDLEAAVCLCTAIKANLLGINLNVPLSLSLLLNACGNHVPSGYQCA
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G044900 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G044900 |
| OH-1004 ID | LXL04_005472 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 79.100 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 96.891覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G044900 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:11601500-11602079 (+) |
| 描述 | Similar to EARLI1: Lipid transfer protein EARLI 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程 GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程 GO:0009631 cold acclimation 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0009682 induced systemic resistance 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0070417 cellular response to cold 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G12470 ath:AT4G12480 ath:AT4G12490 ath:AT4G12500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.514
内质网0.184
细胞质0.131
溶酶体／液泡0.103
细胞膜0.072
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF27998ArabinogalactanP10-76 aaPF14368LTP_213-25 aaPF00234Tryp_alpha_amyl15-25 aaPF05887Trypan_PARP23-94 aaPF14368LTP_281-167 aaPF14547Hydrophob_seed84-168 aaPF00234Tryp_alpha_amyl85-167 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G044900 | PF27998 | ArabinogalactanP | 10 | 76 | 0.028 | 15.4 |
| TkA01G044900 | PF14368 | LTP_2 | 13 | 25 | 2.1e-06 | 28.5 |
| TkA01G044900 | PF00234 | Tryp_alpha_amyl | 15 | 25 | 1.1e-15 | 58.3 |
| TkA01G044900 | PF05887 | Trypan_PARP | 23 | 94 | 0.0057 | 17.4 |
| TkA01G044900 | PF14368 | LTP_2 | 81 | 167 | 2.1e-06 | 28.5 |
| TkA01G044900 | PF14547 | Hydrophob_seed | 84 | 168 | 7.5e-26 | 91.0 |
| TkA01G044900 | PF00234 | Tryp_alpha_amyl | 85 | 167 | 1.1e-15 | 58.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q39176 | 拟南芥 | sp|Q39176|ERLI1_ARATH Lipid transfer protein EARLI 1 | 65.900% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SU34 | 拟南芥 | sp|Q9SU34|ERLL2_ARATH pEARLI1-like lipid transfer protein 2 | 62.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SU33 | 拟南芥 | sp|Q9SU33|ERLL3_ARATH pEARLI1-like lipid transfer protein 3 | 64.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9SU35 | 拟南芥 | sp|Q9SU35|ERLL1_ARATH pEARLI1-like lipid transfer protein 1 | 62.400% | Swiss-Prot | 中等置信 |