基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_039702
当前版本: OH-1004
染色体: JAJTUU010000028.1
坐标: 239545-244636
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA615 bp · LXL04_039702|LXL04_039702|OH1004|cDNA
ATGCCTCCCAAACAATTGAAATCCGAGGCACTTCAGCAGAATGTTGTACCCAAACCCGATGCGTCCAAACTCGCTGCTAAGATTAAGAAGGACGAAGAAAAAGCTAGAGAGAAGGAATTGAATGAGTTGTTTAAGATTGCTGTCGTTCAACCTAAAGTACCTCCCGGCTGGCCGGTGTGCAAGTTCTCTCATGACCTAAATGTACAGAGAAAGGGTGAAAAGATTGATATCTTCAGTGATAAACGTGATGGAGAAGACAC...
CDS
下载 CDS FASTA615 bp · LXL04_039702|LXL04_039702|OH1004|CDS
ATGCCTCCCAAACAATTGAAATCCGAGGCACTTCAGCAGAATGTTGTACCCAAACCCGATGCGTCCAAACTCGCTGCTAAGATTAAGAAGGACGAAGAAAAAGCTAGAGAGAAGGAATTGAATGAGTTGTTTAAGATTGCTGTCGTTCAACCTAAAGTACCTCCCGGCTGGCCGGTGTGCAAGTTCTCTCATGACCTAAATGTACAGAGAAAGGGTGAAAAGATTGATATCTTCAGTGATAAACGTGATGGAGAAGACAC...
204 aa · LXL04_039702|LXL04_039702|OH1004|PROTEIN
MPPKQLKSEALQQNVVPKPDASKLAAKIKKDEEKAREKELNELFKIAVVQPKVPPGWPVCKFSHDLNVQRKGEKIDIFSDKRDGEDTMEEWDQEMLEKVIESKGKEYNQNKPTDIVSWQLLWQMQLYYCHYRVYVFEWTGTEKKIKRRGHNGLFSKQQIGGQKQNGNLLKGSMLLEMHYGSVMRKSDYEEGLWIFNVKNLEIRG
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_039702 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_039702 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | JAJTUU010000028.1:239545-244636 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to At2g20280: Zinc finger CCCH domain-containing protein 21 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002181 cytoplasmic translation 生物过程 GO:0019221 cytokine-mediated signaling pathway 生物过程 GO:0043547 positive regulation of GTPase activity 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0003677 DNA binding 分子功能 GO:0008270 zinc ion binding 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G20280 bta:535102 ddi:DDB_G0292410 dosa:Os01g0834700 rno:362154 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.634
细胞质0.317
线粒体0.064
细胞膜0.043
细胞外0.030
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。