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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_039037
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 57261069-57264299 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2235 bp · LXL04_039037|LXL04_039037|OH1004|cDNA

ATGGGAACCGAAGGGGCTCCGCGTGATCCTCTTCTTGTTTCTAGCAAAGAAGATCAGAACGGCTTCGCCTACATCAACAAAACATCATCCTTACTAAAATCTACCAAATGGGTTCTAAAATCAGCAATGTGGTTAATCTTCATCGCCTGGGTTAGTTTCTTGTTCTTAGTTCCATCAGATTCGGTAAAGCAATTGTATACGAAATTGGTTCATGCTACTTCTGGAACTCTTTTTGGGAATACTGGAAGCATCTTTCTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

2235 bp · LXL04_039037|LXL04_039037|OH1004|CDS

ATGGGAACCGAAGGGGCTCCGCGTGATCCTCTTCTTGTTTCTAGCAAAGAAGATCAGAACGGCTTCGCCTACATCAACAAAACATCATCCTTACTAAAATCTACCAAATGGGTTCTAAAATCAGCAATGTGGTTAATCTTCATCGCCTGGGTTAGTTTCTTGTTCTTAGTTCCATCAGATTCGGTAAAGCAATTGTATACGAAATTGGTTCATGCTACTTCTGGAACTCTTTTTGGGAATACTGGAAGCATCTTTCTGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

744 aa · LXL04_039037|LXL04_039037|OH1004|PROTEIN

MGTEGAPRDPLLVSSKEDQNGFAYINKTSSLLKSTKWVLKSAMWLIFIAWVSFLFLVPSDSVKQLYTKLVHATSGTLFGNTGSIFLIYSGPVLIIAFLAIIYLGICGEDEIQEKKKKHASFRLWTFPIIIDGPFGVVTAAELIGIVLFAVYIIWAIIAYTFENITLLPLFGITDSGKRALFMLELTGLRLGFIGLICMAFLFLPVARGSILLRLIDIPFEHAARYHVWLGHLTMLLFTLHGLFFVIPWAIEGQLIEKLTA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_039037
TK1151 IDTkA04G497460
OH-1004 IDLXL04_039037
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_039037
位置Chr09:57261069-57264299 (-)
描述Similar to FRO7: Ferric reduction oxidase 7, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49740 三价铁螯合还原酶参与铁从细胞质动员到叶绿体中。
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
Chloroplast Fe(III) chelate reductase activity is essential for seedling viability under iron limiting conditions.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0708367105
At5g49730 铁螯合还原酶参与枝条和叶细胞的铁吸收。
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
Overexpression of AtFRO6 in transgenic tobacco enhances ferric chelate reductase activity in leaves and increases tolerance to iron-deficiency chlorosis.2011 · DOI: 10.1007/s11033-010-0472-9
At1g01590 参与根部铁还原的铁螯合物还原酶（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At1g01580 黄素细胞色素，可跨质膜转移电子，还原三价铁螯合物，在根际形成可溶性二价铁。
A ferric-chelate reductase for iron uptake from soils.1999 · DOI: 10.1038/17800
Overexpression of the FRO2 ferric chelate reductase confers tolerance to growth on low iron and uncovers posttranscriptional control.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.025122
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
The FRO2 ferric reductase is required for glycine betaine's effect on chilling tolerance in Arabidopsis roots.2008 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2008.01141.x
At5g23980 三价铁螯合物还原酶。
Molecular and biochemical characterization of the Fe(III) chelate reductase gene family in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci163
Transcriptome sequencing identifies SPL7-regulated copper acquisition genes FRO4/FRO5 and the copper dependence of iron homeostasis in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.090431

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_039037 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009767 photosynthetic electron transport chain 生物过程
GO:0033212 iron import into cell 生物过程
GO:0033214 siderophore-iron import into cell 生物过程
GO:0060586 multicellular organismal-level iron ion homeostasis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0000293 ferric-chelate reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01580
ath:AT1G01590
ath:AT5G23980
ath:AT5G49730
ath:AT5G49740
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.351
排名 1 · LXL04_039037 · OH-1004
溶酶体／液泡0.235
排名 2 · LXL04_039037 · OH-1004
内质网0.199
排名 3 · LXL04_039037 · OH-1004
高尔基体0.131
排名 4 · LXL04_039037 · OH-1004
细胞质0.103
排名 5 · LXL04_039037 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01794.26Ferric_reduct190-312 aa
PF08022.19FAD_binding_8345-455 aa
PF08030.18NAD_binding_6462-544 aa
PF08030.18NAD_binding_6654-721 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_039037PF01794.26Ferric_reduct1903126e-2381.9
LXL04_039037PF08022.19FAD_binding_83454556.3e-2072.0
LXL04_039037PF08030.18NAD_binding_64625443.5e-1866.9
LXL04_039037PF08030.18NAD_binding_66547213.5e-1866.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3KTM0拟南芥Ferric reduction oxidase 7, chloroplastic59.749%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8RWS6拟南芥Ferric reduction oxidase 658.914%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LMM2拟南芥Probable ferric reduction oxidase 132.687%Swiss-Prot中等数据库同源证据
P92949拟南芥Ferric reduction oxidase 231.514%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8W110拟南芥Ferric reduction oxidase 432.819%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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