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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_038202
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 34137350-34142257 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2796 bp · LXL04_038202|LXL04_038202|OH1004|cDNA

ATGGAGATTGACAAGCCTATCCTGAGAACAAGTATGTTTTTCTTGATGTTTATGGCGGTGGCCATGGCAGACGATGGTATAACTGTAAATACATCATCATCAAGAAGGCCTAGTGTTATAAATATCGGAGCTTTATTAACAGTAAATTCAGTTATCGGAAGGTCTGTGAAGCCTGCTATTATAGCAGCTGTTGATGATATAAACTCTAATCCATTAATTCTTGGAGAAACCCGTTTGAATCTCATCTTACATGATACAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2796 bp · LXL04_038202|LXL04_038202|OH1004|CDS

ATGGAGATTGACAAGCCTATCCTGAGAACAAGTATGTTTTTCTTGATGTTTATGGCGGTGGCCATGGCAGACGATGGTATAACTGTAAATACATCATCATCAAGAAGGCCTAGTGTTATAAATATCGGAGCTTTATTAACAGTAAATTCAGTTATCGGAAGGTCTGTGAAGCCTGCTATTATAGCAGCTGTTGATGATATAAACTCTAATCCATTAATTCTTGGAGAAACCCGTTTGAATCTCATCTTACATGATACAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

931 aa · LXL04_038202|LXL04_038202|OH1004|PROTEIN

MEIDKPILRTSMFFLMFMAVAMADDGITVNTSSSRRPSVINIGALLTVNSVIGRSVKPAIIAAVDDINSNPLILGETRLNLILHDTNCSGFLGTIEALELMEKDVVAAIGPQSSTIAHVISHVVNELHVPLISFGATDPTLAALQYPYFLRMTQSDYYQMSAIADLVEYFEYKEVIAIYVDDDYGRNGISSLGDSLAKKRAKISYKAAFTPGASESDINELLTEVNLMESRVYVVHVNPDSGLQIFSIARKLNMMTSDYV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_038202
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_038202
位置Chr09:34137350-34142257 (+)
描述Similar to GLR3.4: Glutamate receptor 3.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g05200 谷氨酸门控受体，可能至少在下胚轴中作为非选择性阳离子通道（可能）。
AtGLR3.4, a glutamate receptor channel-like gene is sensitive to touch and cold.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1551-3
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Dual localization of plant glutamate receptor AtGLR3.4 to plastids and plasmamembrane.2011 · DOI: 10.1016/j.bbabio.2010.11.008
Interacting glutamate receptor-like proteins in Phloem regulate lateral root initiation in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110668
Glutamate Receptor Homolog3.4 is Involved in Regulation of Seed Germination Under Salt Stress in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1093/pcp/pcy034
At2g32390 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g42540 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道，至少在根和下胚轴中（可能）。
Calcium entry mediated by GLR3.3, an Arabidopsis glutamate receptor with a broad agonist profile.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.088989
Glutamate receptor subtypes evidenced by differences in desensitization and dependence on the GLR3.3 and GLR3.4 genes.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.108134
Glutamate receptor-like channel3.3 is involved in mediating glutathione-triggered cytosolic calcium transients, transcriptional changes, and innate immunity responses in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.217208
Involvement of the glutamate receptor AtGLR3.3 in plant defense signaling and resistance to Hyaloperonospora arabidopsidis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12311
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478
Real-time, in vivo intracellular recordings of caterpillar-induced depolarization waves in sieve elements using aphid electrodes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12807
At3g51480 谷氨酸门控受体，可能充当非选择性阳离子通道。
GLUTAMATE RECEPTOR-LIKE genes mediate leaf-to-leaf wound signalling.2013 · DOI: 10.1038/nature12478

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0585200 谷氨酸门控受体，可能作为非选择性阳离子通道发挥作用。
A rice glutamate receptor-like gene is critical for the division and survival of individual cells in the root apical meristem.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037713
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038202 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009864 induced systemic resistance, jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05200
ath:AT1G42540
ath:AT2G32390
ath:AT3G51480
osa:124544569
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.836
排名 1 · LXL04_038202 · OH-1004
细胞质0.071
排名 2 · LXL04_038202 · OH-1004
内质网0.071
排名 3 · LXL04_038202 · OH-1004
溶酶体／液泡0.043
排名 4 · LXL04_038202 · OH-1004
细胞核0.029
排名 5 · LXL04_038202 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13458.13Peripla_BP_640-406 aa
PF01094.35ANF_receptor56-413 aa
PF10613.15Lig_chan-Glu_bd490-580 aa
PF00497.26SBP_bac_3531-817 aa
PF00060.33Lig_chan596-850 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_038202PF13458.13Peripla_BP_6404066.9e-2072.7
LXL04_038202PF01094.35ANF_receptor564131.2e-96324.6
LXL04_038202PF10613.15Lig_chan-Glu_bd4905801.9e-0938.4
LXL04_038202PF00497.26SBP_bac_35318173.1e-1247.1
LXL04_038202PF00060.33Lig_chan5968505.2e-38130.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GXJ4拟南芥Glutamate receptor 3.463.503%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SW97拟南芥Glutamate receptor 3.562.656%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9C8E7拟南芥Glutamate receptor 3.353.063%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q84W41拟南芥Glutamate receptor 3.650.715%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XP59水稻Glutamate receptor 3.155.142%Swiss-Prot强数据库同源证据

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