LXL04_037513 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_037513

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 12563732-12569160 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2304 bp · LXL04_037513|LXL04_037513|OH1004|cDNA

ATGGTGGGAACCGCTAATGGTAGTAGAACACCAGTTACTCCACGACAAGCTTTTTCGGTCGTCAATGGCGGTCAAGATCCGAGTATCCGTTCTGGACCCGGAAGCATTGCTGGGTCGGATTGTGGTGGGATTGAGTTTACGAGGGAAGAAGTTGAAGCATTGTTGAATATGAAGATCAGAACTAAAGATAAGTTCAATCTCAAGGAAAAATGCGAGATAATGATGGAGTACATAAAGAAGCTCAGGATGTGTGTAAGATG...

CDS

下载 CDS FASTA

2304 bp · LXL04_037513|LXL04_037513|OH1004|CDS

ATGGTGGGAACCGCTAATGGTAGTAGAACACCAGTTACTCCACGACAAGCTTTTTCGGTCGTCAATGGCGGTCAAGATCCGAGTATCCGTTCTGGACCCGGAAGCATTGCTGGGTCGGATTGTGGTGGGATTGAGTTTACGAGGGAAGAAGTTGAAGCATTGTTGAATATGAAGATCAGAACTAAAGATAAGTTCAATCTCAAGGAAAAATGCGAGATAATGATGGAGTACATAAAGAAGCTCAGGATGTGTGTAAGATG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

767 aa · LXL04_037513|LXL04_037513|OH1004|PROTEIN

MVGTANGSRTPVTPRQAFSVVNGGQDPSIRSGPGSIAGSDCGGIEFTREEVEALLNMKIRTKDKFNLKEKCEIMMEYIKKLRMCVRWFQEFEGELSIEHEKLKRMFESAEKRSNDMETLMNAKEEELNSIITELRTNYSILQDKFMKEETDKLAAIQTLMTEKDARLSAERLQASLTEDLEKSLRESSSANQKIISLNDMYKRLQEYNTSLQQYNSKLQTELNQTSETLKNVEREKAALTENLSNLRGYHDAQQDQLTNT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_037513`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_037513

位置 Chr09:12563732-12569160 (-)

描述 Similar to KIN14N: Kinesin-like protein KIN-14N

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g54670`	类驱动蛋白KIN-14N。	暂无已核实直接文献
`At4g05190`	驱动蛋白，以 ATP 依赖性方式支持微管运动，并充当负端定向马达和正端跟踪蛋白。	A minus-end-directed kinesin with plus-end tracking protein activity is involved in spindle morphogenesis.2005 · DOI: 10.1091/mbc.e04-10-0935 The kinesin ATK5 functions in early spindle assembly in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.047613
`At4g21270`	驱动蛋白，以 ATP 依赖性方式支持微管运动，并具有负端定向极性。	The Arabidopsis ATK1 gene is required for spindle morphogenesis in male meiosis.2002 · DOI: 10.1242/dev.129.10.2401 Arabidopsis thaliana protein, ATK1, is a minus-end directed kinesin that exhibits non-processive movement.2002 · DOI: 10.1002/cm.10045
`At4g27180`	类动力蛋白 KIN-14M。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os07g0105700`	类驱动蛋白KIN-14N。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037513 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0009971 anastral spindle assembly involved in male meiosis 生物过程

GO:0051225 spindle assembly 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0000776 kinetochore 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005819 spindle 细胞组分

GO:0005871 kinesin complex 细胞组分

GO:0005872 minus-end kinesin complex 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G05190

ath:AT4G21270

ath:AT4G27180

ath:AT5G54670

dosa:Os07g0105700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.758

排名 1 · LXL04_037513 · OH-1004

细胞核0.214

排名 2 · LXL04_037513 · OH-1004

高尔基体0.115

排名 3 · LXL04_037513 · OH-1004

细胞膜0.082

排名 4 · LXL04_037513 · OH-1004

溶酶体／液泡0.063

排名 5 · LXL04_037513 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796.12Microtub_bd392-557 aa

PF00225.30Kinesin416-745 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_037513	`PF16796.12`	Microtub_bd	392	557	7.6e-55	185.8
LXL04_037513	`PF00225.30`	Kinesin	416	745	2.4e-112	375.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P46875`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-14N	62.809%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`F4JGP4`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-14D	61.711%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q07970`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-14C	61.082%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`P46864`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-14M	61.224%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`A3BFT0`	水稻	Kinesin-like protein KIN-14N	57.660%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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