基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_036936
当前版本: OH-1004
染色体: Chr08
坐标: 50348150-50352355
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3567 bp · LXL04_036936|LXL04_036936|OH1004|cDNA
ATGGCAGTCCGCTTCAACCCCTGCGACACTCTCCTCATTCCATCCACCAACgccgccgccgccgccaccaccaccTCCGCTTTCATCTCCTCCAAAACAAAGTATTTCCCTTTCTCCTTATTCTCATTGAAGAAATCCAAAATCGCCCACAATTTCTCGTCACCTTCAACTCGCACACAGAATGTTTCCTCCGTCGTCTGCAGCTCTGCTAAGACCACCCAACCGACTCAAAATCAGAAACCAAATGTTGGTAAGCGAAC...
CDS
下载 CDS FASTA3567 bp · LXL04_036936|LXL04_036936|OH1004|CDS
ATGGCAGTCCGCTTCAACCCCTGCGACACTCTCCTCATTCCATCCACCAACGCCGCCGCCGCCGCCACCACCACCTCCGCTTTCATCTCCTCCAAAACAAAGTATTTCCCTTTCTCCTTATTCTCATTGAAGAAATCCAAAATCGCCCACAATTTCTCGTCACCTTCAACTCGCACACAGAATGTTTCCTCCGTCGTCTGCAGCTCTGCTAAGACCACCCAACCGACTCAAAATCAGAAACCAAATGTTGGTAAGCGAAC...
1188 aa · LXL04_036936|LXL04_036936|OH1004|PROTEIN
MAVRFNPCDTLLIPSTNAAAAATTTSAFISSKTKYFPFSLFSLKKSKIAHNFSSPSTRTQNVSSVVCSSAKTTQPTQNQKPNVGKRTDIKKIMILGAGPIVIGQACEFDYSGTQACKALRENGYEVVLINSNPATIMTDPEMADRTYIEPMTPELVEQVIAKERPDAILPTMGGQTALNLAVALAESGVLDKYNVELIGAKLEAIKKAEDRELFKQAMKNIGLKTPPSGIGTTLQECLQIANTIGEFPLIIRPAFTLGGS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_036936 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_036936 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr08:50348150-50352355 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to CARB: Carbamoyl-phosphate synthase large chain, chloroplastic | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006221 pyrimidine nucleotide biosynthetic process 生物过程 GO:0006526 L-arginine biosynthetic process 生物过程 GO:0006541 glutamine metabolic process 生物过程 GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程 GO:0044205 'de novo' UMP biosynthetic process 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005951 carbamoyl-phosphate synthase complex 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分 GO:0004087 carbamoyl-phosphate synthase (ammonia) activity 分子功能 GO:0004088 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolyzing) activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | afu:AF_1274 ana:alr3809 ath:AT1G29900 dosa:Os01g0570700 syn:sll0370 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.960
细胞质0.049
线粒体0.049
过氧化物酶体0.031
细胞核0.024
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF25596.2CPSase_L_D189-206 aaPF02786.23CPSase_L_D2210-417 aaPF07478.19Dala_Dala_lig_C242-385 aaPF02787.27CPSase_L_D3465-601 aaPF25596.2CPSase_L_D1639-764 aaPF02786.23CPSase_L_D2768-972 aaPF02222.28ATP-grasp776-942 aaPF07478.19Dala_Dala_lig_C796-940 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_036936 | PF25596.2 | CPSase_L_D1 | 89 | 206 | 5.8e-100 | 330.1 |
| LXL04_036936 | PF02786.23 | CPSase_L_D2 | 210 | 417 | 7.5e-112 | 372.7 |
| LXL04_036936 | PF07478.19 | Dala_Dala_lig_C | 242 | 385 | 1.3e-15 | 58.2 |
| LXL04_036936 | PF02787.27 | CPSase_L_D3 | 465 | 601 | 1e-42 | 146.1 |
| LXL04_036936 | PF25596.2 | CPSase_L_D1 | 639 | 764 | 5.8e-100 | 330.1 |
| LXL04_036936 | PF02786.23 | CPSase_L_D2 | 768 | 972 | 7.5e-112 | 372.7 |
| LXL04_036936 | PF02222.28 | ATP-grasp | 776 | 942 | 2.3e-12 | 47.6 |
| LXL04_036936 | PF07478.19 | Dala_Dala_lig_C | 796 | 940 | 1.3e-15 | 58.2 |
| LXL04_036936 | PF02142.28 | MGS | 1055 | 1139 | 9.1e-20 | 71.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。