基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_036811
当前版本: OH-1004
染色体: Chr08
坐标: 48698040-48699627
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1392 bp · LXL04_036811|LXL04_036811|OH1004|cDNA
ATGGCAACCCACCTCTCCTATATATGCCCCCTCCCTCCTTTTATTCCAACAACAACCATCTCTATTTCAAGACAATCAAGAAGAATAAACCCTTCACAACTATCATTCCTTCCATCACAAACAAACCCCAAAATGTTTGTTTTATCGGAGCAAAATATCCCGAGCCGTAGATGTATCTGGGTCAACGGCCCAGTCATAGTTGGGGCGGGCCCTTCAGGGCTCGCTGTCTCTGCTTGTCTCAGGGAGCAAGGCATTCCTTT...
CDS
下载 CDS FASTA1392 bp · LXL04_036811|LXL04_036811|OH1004|CDS
ATGGCAACCCACCTCTCCTATATATGCCCCCTCCCTCCTTTTATTCCAACAACAACCATCTCTATTTCAAGACAATCAAGAAGAATAAACCCTTCACAACTATCATTCCTTCCATCACAAACAAACCCCAAAATGTTTGTTTTATCGGAGCAAAATATCCCGAGCCGTAGATGTATCTGGGTCAACGGCCCAGTCATAGTTGGGGCGGGCCCTTCAGGGCTCGCTGTCTCTGCTTGTCTCAGGGAGCAAGGCATTCCTTT...
463 aa · LXL04_036811|LXL04_036811|OH1004|PROTEIN
MATHLSYICPLPPFIPTTTISISRQSRRINPSQLSFLPSQTNPKMFVLSEQNIPSRRCIWVNGPVIVGAGPSGLAVSACLREQGIPFVIIERADCIASLWQKRTYDRLKLHLPKKFCQLPKLPFPEEYPEYPTKKQFITYLENYAKNFDIKPRFNESVQSAKYDKLCGVWRVKTISTTTGPIPFETEYICQKLVVATGENAEGVVPEIEGLQGFSGEVIHAKDYKSGEKYTGKKVLVVGCGNSGMEVSLDLSNHNAKPSM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_036811 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_036811 |
|---|---|
| 位置 | Chr08:48698040-48699627 (-) |
| 描述 | Similar to YUC8: Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA8 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009635 response to herbicide 生物过程 GO:0009684 indoleacetic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009735 response to cytokinin 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程 GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程 GO:0010600 regulation of auxin biosynthetic process 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能 GO:0004499 N,N-dimethylaniline monooxygenase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G04180 ath:AT1G04610 ath:AT2G33230 ath:AT4G28720 ath:AT5G43890 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.889
线粒体0.106
细胞质0.050
细胞核0.030
过氧化物酶体0.024
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13738.13Pyr_redox_365-265 aaPF07992.21Pyr_redox_265-264 aaPF00743.26FMO-like66-390 aaPF13434.13Lys_Orn_oxgnase130-261 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_036811 | PF13738.13 | Pyr_redox_3 | 65 | 265 | 3.7e-25 | 89.5 |
| LXL04_036811 | PF07992.21 | Pyr_redox_2 | 65 | 264 | 6.3e-13 | 49.5 |
| LXL04_036811 | PF00743.26 | FMO-like | 66 | 390 | 7.3e-31 | 107.9 |
| LXL04_036811 | PF13434.13 | Lys_Orn_oxgnase | 130 | 261 | 6.8e-15 | 55.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SVU0 | 拟南芥 | Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA8 | 68.884% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O23024 | 拟南芥 | Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA3 | 69.007% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9LKC0 | 拟南芥 | Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA5 | 70.309% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O64489 | 拟南芥 | Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA9 | 69.668% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O49312 | 拟南芥 | Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA7 | 68.182% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |