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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_036538
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 44174219-44177080 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1764 bp · LXL04_036538|LXL04_036538|OH1004|cDNA

ATGGAAACCCTAGCTATCTCCCACCGCCTTCTCCCGCCATCTCTCCACCGTTCCTCCATTAATCACCGCCTTTCCTCCCTTCCTCCCTCCCTCGCTCTCTCCAGCTCCACCTCCACTTCTCGTTCCTTCACTCTCAAATGCTCTGCTCGATCTCCATCTCCAACCGCATCAGTTGACCATTCAGTGAAATTCAAGGAAGCTGCAAAGGATGGGAATCTGATTCCATTATACAGGTCAATATTCTCTGATCATTTGACTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1764 bp · LXL04_036538|LXL04_036538|OH1004|CDS

ATGGAAACCCTAGCTATCTCCCACCGCCTTCTCCCGCCATCTCTCCACCGTTCCTCCATTAATCACCGCCTTTCCTCCCTTCCTCCCTCCCTCGCTCTCTCCAGCTCCACCTCCACTTCTCGTTCCTTCACTCTCAAATGCTCTGCTCGATCTCCATCTCCAACCGCATCAGTTGACCATTCAGTGAAATTCAAGGAAGCTGCAAAGGATGGGAATCTGATTCCATTATACAGGTCAATATTCTCTGATCATTTGACTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

587 aa · LXL04_036538|LXL04_036538|OH1004|PROTEIN

METLAISHRLLPPSLHRSSINHRLSSLPPSLALSSSTSTSRSFTLKCSARSPSPTASVDHSVKFKEAAKDGNLIPLYRSIFSDHLTPVLAYRCLVKEDDRDAPSFLFESVEPGLKASSVGRYSVIGAQPTMEIVAKENMVTVMDHHEGVKTEEFVEDPMVVPRRIMEQWKPQRIDELPDAFCGGWVGYFSYDTVRYVEKKKIPFSNAPLDDRNLPDVHLGLYDDVIVFDHIEKKAYVIHWVRLDQYSSVDEAFKDGTDRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_036538
TK1151 IDTkA04G038160
OH-1004 IDLXL04_036538
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.026 / OH-1004 51.959
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_036538
位置Chr08:44174219-44177080 (+)
描述Similar to ASA2: Anthranilate synthase alpha subunit 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g29690 异四聚体复合物的组分；该复合物催化邻氨基苯甲酸的两步生物合成，后者是L-色氨酸生物合成的中间体。 暂无已核实直接文献
At5g05730 异四聚体复合物的一部分，催化邻氨基苯甲酸的两步生物合成，邻氨基苯甲酸是 L-色氨酸生物合成的中间体。
A Link between ethylene and auxin uncovered by the characterization of two root-specific ethylene-insensitive mutants in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.033365
Arabidopsis ASA1 is important for jasmonate-mediated regulation of auxin biosynthesis and transport during lateral root formation.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.064303

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XNK3 异四聚体复合物的组分；该复合物催化邻氨基苯甲酸的两步生物合成，后者是L-色氨酸生物合成的中间体。 暂无已核实直接文献
Os03g0826500 异四聚体复合物的一部分，催化邻氨基苯甲酸的两步生物合成，邻氨基苯甲酸是 L-色氨酸生物合成的中间体。
Characterization of rice anthranilate synthase alpha-subunit genes OASA1 and OASA2. Tryptophan accumulation in transgenic rice expressing a feedback-insensitive mutant of OASA1.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.4.1493
In vitro reconstitution of rice anthranilate synthase: distinct functional properties of the alpha subunits OASA1 and OASA2.2004 · DOI: 10.1023/b:plan.0000028729.79034.07
Os03g0264400 异四聚体复合物的一部分，催化邻氨基苯甲酸的两步生物合成，邻氨基苯甲酸是 L-色氨酸生物合成的中间体。
In vitro reconstitution of rice anthranilate synthase: distinct functional properties of the alpha subunits OASA1 and OASA2.2004 · DOI: 10.1023/b:plan.0000028729.79034.07
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036538 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000162 L-tryptophan biosynthetic process 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0010600 regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005950 anthranilate synthase complex 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004049 anthranilate synthase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G29690
ath:AT5G05730
dosa:Os03g0264400
dosa:Os03g0826500
osa:4332341
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.974
排名 1 · LXL04_036538 · OH-1004
线粒体0.039
排名 2 · LXL04_036538 · OH-1004
细胞质0.029
排名 3 · LXL04_036538 · OH-1004
细胞核0.023
排名 4 · LXL04_036538 · OH-1004
过氧化物酶体0.020
排名 5 · LXL04_036538 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00425.26Chorismate_bind155-573 aa
PF30495.1Chorismate_bind_2291-577 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_036538PF00425.26Chorismate_bind1555732.1e-110370.6
LXL04_036538PF30495.1Chorismate_bind_22915772.1e-43149.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P32069拟南芥Anthranilate synthase alpha subunit 2, chloroplastic72.681%Swiss-Prot强数据库同源证据
P32068拟南芥Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic71.167%Swiss-Prot强数据库同源证据
A2XNK3水稻Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic76.046%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q94GF1水稻Anthranilate synthase alpha subunit 1, chloroplastic75.856%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9XJ29水稻Anthranilate synthase alpha subunit 2, chloroplastic72.482%Swiss-Prot强数据库同源证据

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