LXL04_035666 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_035666

当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 26700719-26701691 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

837 bp · LXL04_035666|LXL04_035666|OH1004|cDNA

ATGTCAGAGAGCTTGCAGAACGATTACGAGCTCTGTGAAGAGCTCGGCCGAGGTCAGTTCGGGATCATATACCGTTGTTTTTCACGGATTTCTGGTGAATCTTTTGCATGCAAATCGATTGACAAACGGCTCCTCTCCGACTCCACCGATCGGGAATGTATCGTGAAAGAACCGAAAATCCTCCGCGTTCTCGGCGGAAACGCTCATGTTACTCAGATTCACCGTATCTATGAAGATGAGAATTGGATCCATATGGTTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

837 bp · LXL04_035666|LXL04_035666|OH1004|CDS

ATGTCAGAGAGCTTGCAGAACGATTACGAGCTCTGTGAAGAGCTCGGCCGAGGTCAGTTCGGGATCATATACCGTTGTTTTTCACGGATTTCTGGTGAATCTTTTGCATGCAAATCGATTGACAAACGGCTCCTCTCCGACTCCACCGATCGGGAATGTATCGTGAAAGAACCGAAAATCCTCCGCGTTCTCGGCGGAAACGCTCATGTTACTCAGATTCACCGTATCTATGAAGATGAGAATTGGATCCATATGGTTAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

278 aa · LXL04_035666|LXL04_035666|OH1004|PROTEIN

MSESLQNDYELCEELGRGQFGIIYRCFSRISGESFACKSIDKRLLSDSTDRECIVKEPKILRVLGGNAHVTQIHRIYEDENWIHMVIDLCEGPDLYERISKRGGAFSECEAVSIFSQLIESISYCHKLGIAHRDIKPDNVLFDSTGKLKLADFGSAEWFGMNERGSMTGVVGTPYYVAPEVLLGREYDEKVDVWSAGVILYILLGGVPPFYGETSVETFEAVVRGNLRFPTRIFRSVSPAAKDLLRKMLCKDASRRLSVQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_035666`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_035666

位置 Chr08:26700719-26701691 (-)

描述 Similar to PPCK2: Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g04530`	一种钙离子非依赖性激酶，参与光依赖性磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的磷酸化。	暂无已核实直接文献
`At1g08650`	一种钙离子非依赖性激酶，参与光依赖性磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的磷酸化。	暂无已核实直接文献
`At2g41860`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At1g76040`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At1g61950`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035666 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0009416 response to light stimulus 生物过程

GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0046898 response to cycloheximide 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能

GO:0005509 calcium ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G08650

ath:AT1G61950

ath:AT1G76040

ath:AT2G41860

ath:AT3G04530

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.608

排名 1 · LXL04_035666 · OH-1004

细胞质0.589

排名 2 · LXL04_035666 · OH-1004

细胞膜0.050

排名 3 · LXL04_035666 · OH-1004

线粒体0.037

排名 4 · LXL04_035666 · OH-1004

内质网0.032

排名 5 · LXL04_035666 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase9-268 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr11-263 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_035666	`PF00069.32`	Pkinase	9	268	8e-70	235.9
LXL04_035666	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	11	263	9.8e-29	101.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q93VK0`	拟南芥	Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 2	51.273%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9SPK4`	拟南芥	Phosphoenolpyruvate carboxylase kinase 1	50.373%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`P93759`	拟南芥	Calcium-dependent protein kinase 14	44.928%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q8RWL2`	拟南芥	Calcium-dependent protein kinase 29	44.487%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q1PFH8`	拟南芥	Calcium-dependent protein kinase 19	44.161%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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