本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

LXL04_034337
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 96869405-96870814 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1410 bp · LXL04_034337|LXL04_034337|OH1004|cDNA

ATGGCCGACAACGATCACGTAAATAGTGAACCCTTCCCAGCGGTGGTCGTGATGGTGCCGTTTGTGGCACAAGGTCACCTGAACCAACTCCTCCACCTCTCCCGCCTTGTCGCCGCCTACAACATTCCTGTCCACTTTGTCAGCACTGTTCATTGCATCGCCCAAGCCCGCTCCCGCCACCGTAATTTCAACCATCTTTCCGGCGTCTCCTCCCAGATCCACTTCCACGAATTCCCAATCCCTCCCTTCACTACCCCTCC...

1410 bp · LXL04_034337|LXL04_034337|OH1004|CDS

ATGGCCGACAACGATCACGTAAATAGTGAACCCTTCCCAGCGGTGGTCGTGATGGTGCCGTTTGTGGCACAAGGTCACCTGAACCAACTCCTCCACCTCTCCCGCCTTGTCGCCGCCTACAACATTCCTGTCCACTTTGTCAGCACTGTTCATTGCATCGCCCAAGCCCGCTCCCGCCACCGTAATTTCAACCATCTTTCCGGCGTCTCCTCCCAGATCCACTTCCACGAATTCCCAATCCCTCCCTTCACTACCCCTCC...

469 aa · LXL04_034337|LXL04_034337|OH1004|PROTEIN

MADNDHVNSEPFPAVVVMVPFVAQGHLNQLLHLSRLVAAYNIPVHFVSTVHCIAQARSRHRNFNHLSGVSSQIHFHEFPIPPFTTPPPDTSIPFPTHLQPSFDSTLHLRHHVADLIRSLSHKTKRVAVIHDVLMSYVVQDVKSIPNAETYVFQPPPAFYRAASHWENTGGSFPVDLELMNQLPSQDGISSPEFLKFVKLQRSHMNFHVGELYDSSRVIEGKFIEYLQREEISGKTKIWAIGPFNPVIQKVNSTIQETRQN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_034337
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_034337
位置Chr07:96869405-96870814 (-)
描述Similar to ZOG1: Zeatin O-glucosyltransferase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_034337 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程
GO:0009690 cytokinin metabolic process 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0010015 root morphogenesis 生物过程
GO:0010083 regulation of vegetative meristem growth 生物过程
GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0010817 regulation of hormone levels 生物过程
GO:0045926 negative regulation of growth 生物过程
GO:0048316 seed development 生物过程
GO:0048439 flower morphogenesis 生物过程
GO:0080036 regulation of cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AAD04166
zma:541881
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.752
排名 1 · LXL04_034337 · OH-1004
细胞核0.268
排名 2 · LXL04_034337 · OH-1004
过氧化物酶体0.076
排名 3 · LXL04_034337 · OH-1004
质体0.064
排名 4 · LXL04_034337 · OH-1004
内质网0.062
排名 5 · LXL04_034337 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168.1Glyco_transf_N15-245 aa
PF00201.25UDPGT264-427 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_034337PF26168.1Glyco_transf_N152451.1e-68232.3
LXL04_034337PF00201.25UDPGT2644271.4e-2074.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

JBrowse

在基因组浏览器中查看