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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_033652
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 51660320-51663649 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3330 bp · LXL04_033652|LXL04_033652|OH1004|cDNA

ATGGTGGTCAACGTACTACATCTCTACCTCTATACATGCATAGTCCTCACCTCTATCATATCCGTGTTGGGTTCCACTTTGCGTCCACCTTCCACGGCTAAACCAGACCCCTACAGATCATCATCCGCCATTAAAACGGATTCTGAAGCTCTGATTGAGTTCAAGAACATGATAGATGACCCTGATGACGTCCTCTCCAGCTGGAAGCTCACCAAGACGCCATGCAATTGGCATGGTGTGACATGCAGCGAGGGCCGAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

3330 bp · LXL04_033652|LXL04_033652|OH1004|CDS

ATGGTGGTCAACGTACTACATCTCTACCTCTATACATGCATAGTCCTCACCTCTATCATATCCGTGTTGGGTTCCACTTTGCGTCCACCTTCCACGGCTAAACCAGACCCCTACAGATCATCATCCGCCATTAAAACGGATTCTGAAGCTCTGATTGAGTTCAAGAACATGATAGATGACCCTGATGACGTCCTCTCCAGCTGGAAGCTCACCAAGACGCCATGCAATTGGCATGGTGTGACATGCAGCGAGGGCCGAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1109 aa · LXL04_033652|LXL04_033652|OH1004|PROTEIN

MVVNVLHLYLYTCIVLTSIISVLGSTLRPPSTAKPDPYRSSSAIKTDSEALIEFKNMIDDPDDVLSSWKLTKTPCNWHGVTCSEGRVTQLDLNDSDLEGSVSFSSFSSLDMLTLLNLSENKRLFINSTSLCQLPFGLEQIILSNSGVTGSIPDKFLVNFKNLAVINLSRNSLTGFFPETLVSNPDLVQVLDLSSNSIYGSIPVTISSYTNLKNLNLSYNMITGKIPKSVGKLKNLQVLGFSHNLLTGWIPPELGNLCESL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_033652
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_033652
位置Chr07:51660320-51663649 (-)
描述Similar to BRL2: Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g01950 受体具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性，可能将细胞外空间和时间信号转导为前血管和原形成层细胞的下游细胞分化反应。
VH1/BRL2 receptor-like kinase interacts with vascular-specific adaptor proteins VIT and VIK to influence leaf venation.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03742.x
At3g13380 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0114400 可能参与油菜素内酯（BR）的感受。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010233 phloem transport 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55610
ath:AT2G01950
ath:AT3G13380
dosa:Os10g0114400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.870
排名 1 · LXL04_033652 · OH-1004
内质网0.084
排名 2 · LXL04_033652 · OH-1004
细胞质0.067
排名 3 · LXL04_033652 · OH-1004
细胞核0.047
排名 4 · LXL04_033652 · OH-1004
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · LXL04_033652 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_245-83 aa
PF13855.13LRR_8137-197 aa
PF13855.13LRR_8187-245 aa
PF12799.14LRR_4209-245 aa
PF13855.13LRR_8259-296 aa
PF12799.14LRR_4259-295 aa
PF13855.13LRR_8299-343 aa
PF13855.13LRR_8474-512 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_033652PF08263.18LRRNT_245831.2e-1248.6
LXL04_033652PF13855.13LRR_81371978.6e-51170.3
LXL04_033652PF13855.13LRR_81872458.6e-51170.3
LXL04_033652PF12799.14LRR_42092451.9e-37127.1
LXL04_033652PF13855.13LRR_82592968.6e-51170.3
LXL04_033652PF12799.14LRR_42592951.9e-37127.1
LXL04_033652PF13855.13LRR_82993438.6e-51170.3
LXL04_033652PF13855.13LRR_84745128.6e-51170.3
LXL04_033652PF20141.5Island5305899.9e-1967.2
LXL04_033652PF23598.2LRR_145666731.6e-1970.6
LXL04_033652PF13855.13LRR_85876288.6e-51170.3
LXL04_033652PF00069.32Pkinase82210946.6e-43147.7
LXL04_033652PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr82410963e-41142.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZPS9拟南芥Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 266.094%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LJF3拟南芥Receptor-like protein kinase BRI1-like 347.500%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZWC8拟南芥Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 146.277%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7G768水稻Brassinosteroid LRR receptor kinase BRL260.757%Swiss-Prot强数据库同源证据

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