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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_033363
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 41690066-41692407 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1158 bp · LXL04_033363|LXL04_033363|OH1004|cDNA

ATGGAAACAATGGATGGACCCGTTCCAGAAGTTCGAACCGAAACCGAACCCCCTGTTGCGGAGGAATTAGGGAAAAATGTTGATGAAATCATCGTGAAGGTTGATGAGCTTGAGCAAAAACTGAACGAAGTTGAGCAATTCTACTCAAAACCACCCAAAAAACAATCAAACACTTCAAAAGCCAGTTCAGTCATGAAAGAGAAAGACAAAGATAAACAAATAACCAGCTTCAAAAGGCGCCAGCTGGACGCATCAAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1158 bp · LXL04_033363|LXL04_033363|OH1004|CDS

ATGGAAACAATGGATGGACCCGTTCCAGAAGTTCGAACCGAAACCGAACCCCCTGTTGCGGAGGAATTAGGGAAAAATGTTGATGAAATCATCGTGAAGGTTGATGAGCTTGAGCAAAAACTGAACGAAGTTGAGCAATTCTACTCAAAACCACCCAAAAAACAATCAAACACTTCAAAAGCCAGTTCAGTCATGAAAGAGAAAGACAAAGATAAACAAATAACCAGCTTCAAAAGGCGCCAGCTGGACGCATCAAGAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

385 aa · LXL04_033363|LXL04_033363|OH1004|PROTEIN

METMDGPVPEVRTETEPPVAEELGKNVDEIIVKVDELEQKLNEVEQFYSKPPKKQSNTSKASSVMKEKDKDKQITSFKRRQLDASRREAAAAKRMQDLMKQFSGLLRQHIIYPFFQFHISTWATPFMQPVDVVGLGLHDYYEVIERPMDFSTVKTKMEAKDGTGYNNVREICADVRLIFKNAMKYNDERNDVHVMAKTLLAKFEEKWLQLLPKVDEEDERRKKEEAEAQLDVQLAQEVSHAKMARDLSAELDKVDKNLKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_033363
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_033363
位置Chr07:41690066-41692407 (-)
描述Similar to GTE1: Transcription factor GTE1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g34900 转录激活剂，分别通过负向和正向调节脱落酸 和光敏色素 A 转导途径，在促进种子发芽中发挥作用。
IMB1, a bromodomain protein induced during seed imbibition, regulates ABA- and phyA-mediated responses of germination in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01848.x
At3g52280 通过控制幼年期和成熟期产生的原基发育差异来调节幼年叶和成熟叶之间的叶型差异。
The bromodomain protein GTE6 controls leaf development in Arabidopsis by histone acetylation at ASYMMETRIC LEAVES1.2005 · DOI: 10.1101/gad.352005
At1g06230 参与维管分生组织中细胞分裂的激活和维持，从而控制分化器官中的细胞数。
The Arabidopsis BET bromodomain factor GTE4 is involved in maintenance of the mitotic cell cycle during plant development.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.150631
The Arabidopsis BET bromodomain factor GTE4 regulates the mitotic cell cycle.2010 · DOI: 10.4161/psb.5.6.11571
At5g14270 转录因子 GTE9。 暂无已核实直接文献
At1g73150 可能的转录因子，可结合乙酰化的组蛋白 H3。
The PHD domain of plant PIAS proteins mediates sumoylation of bromodomain GTE proteins.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m708176200

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033363 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0045931 positive regulation of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06230
ath:AT1G73150
ath:AT2G34900
ath:AT3G52280
ath:AT5G14270
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.936
排名 1 · LXL04_033363 · OH-1004
细胞质0.162
排名 2 · LXL04_033363 · OH-1004
线粒体0.020
排名 3 · LXL04_033363 · OH-1004
细胞膜0.020
排名 4 · LXL04_033363 · OH-1004
内质网0.009
排名 5 · LXL04_033363 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00439.31Bromodomain123-197 aa
PF17035.11BET271-334 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_033363PF00439.31Bromodomain1231971.4e-1557.7
LXL04_033363PF17035.11BET2713341.1e-1764.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84XV2拟南芥Transcription factor GTE149.167%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FT54拟南芥Transcription factor GTE649.527%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LNC4拟南芥Transcription factor GTE433.750%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q93YS6拟南芥Transcription factor GTE932.377%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9S7T1拟南芥Transcription factor GTE3, chloroplastic29.693%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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