基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_033119
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 36538149-36540539
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2391 bp · LXL04_033119|LXL04_033119|OH1004|cDNA
ATGGCTCTAGTCCTACTGCACCTCGTCTTTCTATCTATTTTCCTACATTTGATAACTGCACAACAGACTGGCGGCTCTGTATCTGTTGGTTCATCACTCACCGCCACACCCAACGTTAACCCATGGGTACTTTCATCTTCCGGTGAGTTTGCCTTTGGGTTCAAACAAATTGAAGGGACCGATTACTTTTTGTTGTCAATATGGTATGACAAGATACCCGACAAGACCATCATTTGGTATCCAGAAGTAGGTACGATGGT...
CDS
下载 CDS FASTA2391 bp · LXL04_033119|LXL04_033119|OH1004|CDS
ATGGCTCTAGTCCTACTGCACCTCGTCTTTCTATCTATTTTCCTACATTTGATAACTGCACAACAGACTGGCGGCTCTGTATCTGTTGGTTCATCACTCACCGCCACACCCAACGTTAACCCATGGGTACTTTCATCTTCCGGTGAGTTTGCCTTTGGGTTCAAACAAATTGAAGGGACCGATTACTTTTTGTTGTCAATATGGTATGACAAGATACCCGACAAGACCATCATTTGGTATCCAGAAGTAGGTACGATGGT...
796 aa · LXL04_033119|LXL04_033119|OH1004|PROTEIN
MALVLLHLVFLSIFLHLITAQQTGGSVSVGSSLTATPNVNPWVLSSSGEFAFGFKQIEGTDYFLLSIWYDKIPDKTIIWYPEVGTMVPTGSKVELVRTTGLVLSDPQGTEVWRSGSISGVALGFMNDTGNFVIFGSNSRKIWDTFDFPANTLLPTQVMETGEGIKSTMSKTNFSGGRFQLRLLQDGNLVLNTRDILSGSPYDAYYISGTFDPSNSTNSGEQLIFDEMGYMYILRRSGERFDLTPNGSLPSGDYYHRAALD...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_033119 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_033119 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:36538149-36540539 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to LECRK3: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0051707 response to other organism 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005516 calmodulin binding 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能 GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能 GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G60900 dosa:Os04g0202350 dosa:Os04g0202500 osa:9266608 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.824
内质网0.079
细胞质0.069
溶酶体／液泡0.039
细胞外0.034
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01453.31B_lectin91-160 aaPF00954.26S_locus_glycop253-325 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr511-776 aaPF00069.32Pkinase512-774 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_033119 | PF01453.31 | B_lectin | 91 | 160 | 2.4e-08 | 35.1 |
| LXL04_033119 | PF00954.26 | S_locus_glycop | 253 | 325 | 3.9e-06 | 28.1 |
| LXL04_033119 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 511 | 776 | 1.1e-44 | 153.4 |
| LXL04_033119 | PF00069.32 | Pkinase | 512 | 774 | 6.6e-47 | 160.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q39202 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase RLK1 | 45.324% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q25AG3 | 水稻 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3 | 44.987% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q0JEU6 | 水稻 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3 | 44.987% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
A2XQD3 | 水稻 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK2 | 43.067% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q7FAZ2 | 水稻 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK2 | 43.719% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |