LXL04_030651 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030651

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 120312068-120312877 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

579 bp · LXL04_030651|LXL04_030651|OH1004|cDNA

ATGATCTTGATTACGGGACTGAAGAAGAATGCGACCGATGATCTTGTTGATAATTACACAATTCCTTACGCTTACGTAACTCTCACTGCTACATTAACACCCAAACTTCTTGTGGTTGGGGTTGATATCGGGAACGAAACTTGTGTTATTGCTGCTGCAAAGAACCGTGGGATTGCTACAAAGAAACTTGGCGAGAAGCAAAGGTTCTTAGGATCTGCTGTCCAGATTCTAGGAATGCTGTTTGCACATCTAAAACAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

579 bp · LXL04_030651|LXL04_030651|OH1004|CDS

ATGATCTTGATTACGGGACTGAAGAAGAATGCGACCGATGATCTTGTTGATAATTACACAATTCCTTACGCTTACGTAACTCTCACTGCTACATTAACACCCAAACTTCTTGTGGTTGGGGTTGATATCGGGAACGAAACTTGTGTTATTGCTGCTGCAAAGAACCGTGGGATTGCTACAAAGAAACTTGGCGAGAAGCAAAGGTTCTTAGGATCTGCTGTCCAGATTCTAGGAATGCTGTTTGCACATCTAAAACAAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

192 aa · LXL04_030651|LXL04_030651|OH1004|PROTEIN

MILITGLKKNATDDLVDNYTIPYAYVTLTATLTPKLLVVGVDIGNETCVIAAAKNRGIATKKLGEKQRFLGSAVQILGMLFAHLKQMAEKNLESPVSNCVIGIPSYFTDSQRRAYLDAAHIAGLKPLRLMHDCTAITLGYGIYKTDLSNSSPTNVVFVDIGHCDTQVTVAASFEETGNQILWLLNQFYRKEQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030651`
TK1151 ID	TkA07G421550
OH-1004 ID	LXL04_030651
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 55.208 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030651

位置 Chr06:120312068-120312877 (-)

描述 Similar to HSP70-16: Heat shock 70 kDa protein 16

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g11660`	热休克 70 kDa 蛋白 16。	暂无已核实直接文献
`At1g79930`	在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。	暂无已核实直接文献
`At1g79920`	在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030651 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0045345 positive regulation of MHC class I biosynthetic process 生物过程

GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程

GO:0061098 positive regulation of protein tyrosine kinase activity 生物过程

GO:0070507 regulation of microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:1903748 negative regulation of establishment of protein localization to mitochondrion 生物过程

GO:1903753 negative regulation of p38MAPK cascade 生物过程

GO:1904276 regulation of wax biosynthetic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G11660

ath:AT1G79920

ath:AT1G79930

mmu:15505

rno:288444

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.326

排名 1 · LXL04_030651 · OH-1004

细胞核0.167

排名 2 · LXL04_030651 · OH-1004

内质网0.166

排名 3 · LXL04_030651 · OH-1004

线粒体0.152

排名 4 · LXL04_030651 · OH-1004

细胞外0.106

排名 5 · LXL04_030651 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012.27HSP7072-170 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030651	`PF00012.27`	HSP70	72	170	4.6e-32	111.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SAB1`	拟南芥	Heat shock 70 kDa protein 16	73.729%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9S7C0`	拟南芥	Heat shock 70 kDa protein 14	59.259%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`F4HQD4`	拟南芥	Heat shock 70 kDa protein 15	56.481%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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