LXL04_030596 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_030596

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 119392565-119395898 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2181 bp · LXL04_030596|LXL04_030596|OH1004|cDNA

ATGGATGACTACAGAATAGCTGAGATTCTACCTCCTGCATGGATAAACCGCAATCCATCTCCAGAATCCCATGTCTTCATCATCTCATGCTGTATAGCTGGCATAATTGGTATCCTCACCATCATCTACACCGCTTTCCAATGGAGAAGAAACATCAGCCTAAGTCTAATGAAAGCCACCGCCAGAAAAAAGAAAGATCCAAAATCAAGATCCAGAGTTCCAGTAGCTGCTCACACATGGTACTTAGAATCAGGATCACG...

CDS

下载 CDS FASTA

2181 bp · LXL04_030596|LXL04_030596|OH1004|CDS

ATGGATGACTACAGAATAGCTGAGATTCTACCTCCTGCATGGATAAACCGCAATCCATCTCCAGAATCCCATGTCTTCATCATCTCATGCTGTATAGCTGGCATAATTGGTATCCTCACCATCATCTACACCGCTTTCCAATGGAGAAGAAACATCAGCCTAAGTCTAATGAAAGCCACCGCCAGAAAAAAGAAAGATCCAAAATCAAGATCCAGAGTTCCAGTAGCTGCTCACACATGGTACTTAGAATCAGGATCACG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

726 aa · LXL04_030596|LXL04_030596|OH1004|PROTEIN

MDDYRIAEILPPAWINRNPSPESHVFIISCCIAGIIGILTIIYTAFQWRRNISLSLMKATARKKKDPKSRSRVPVAAHTWYLESGSRNKNLNCCVCLKSVSSSQSLTPITASDSFIHRCRICGAAAHLSCSSKAHRDCKCVSMVWSTRVQHLWAIKWTEVVDQPDEISFCSHCEEPCSASFLGGSAIWSCLWCQRLVHVDCHSGLYADTGDVCDLGPFRRLIVSPLCVKEFRRSSSGGILSSITHGANEIASSVRASIRN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_030596`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_030596

位置 Chr06:119392565-119395898 (+)

描述 Similar to DGK1: Diacylglycerol kinase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g07920`	对第二信使二酰甘油（DAG）进行磷酸化生成磷脂酸（PA），另一种重要的信号分子。	暂无已核实直接文献
`At5g63770`	对第二信使二酰甘油（DAG）进行磷酸化生成磷脂酸（PA），另一种重要的信号分子。	AtDGK2, a novel diacylglycerol kinase from Arabidopsis thaliana, phosphorylates 1-stearoyl-2-arachidonoyl-sn-glycerol and 1,2-dioleoyl-sn-glycerol and exhibits cold-inducible gene expression.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m312187200 Arabidopsis AtDGK7, the smallest member of plant diacylglycerol kinases (DGKs), displays unique biochemical features and saturates at low substrate concentration: the DGK inhibitor R59022 differentially affects AtDGK2 and AtDGK7 activity in vitro and alters plant growth and development.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m506859200 DIACYLGLYCEROL ACYLTRANSFERASE and DIACYLGLYCEROL KINASE Modulate Triacylglycerol and Phosphatidic Acid Production in the Plant Response to Freezing Stress.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.00402

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030596 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006654 phosphatidic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007200 phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0046339 diacylglycerol metabolic process 生物过程

GO:0046473 phosphatidic acid metabolic process 生物过程

GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程

GO:0046834 lipid phosphorylation 生物过程

GO:0048364 root development 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G07920

ath:AT5G63770

hsa:1607

mmu:217480

rno:54248

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.295

排名 1 · LXL04_030596 · OH-1004

细胞膜0.279

排名 2 · LXL04_030596 · OH-1004

细胞质0.252

排名 3 · LXL04_030596 · OH-1004

高尔基体0.236

排名 4 · LXL04_030596 · OH-1004

细胞核0.133

排名 5 · LXL04_030596 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00130.29C1_1165-203 aa

PF00781.30DAGK_cat357-458 aa

PF00609.25DAGK_acc505-662 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_030596	`PF00130.29`	C1_1	165	203	3.7e-09	37.0
LXL04_030596	`PF00781.30`	DAGK_cat	357	458	3.4e-26	92.0
LXL04_030596	`PF00609.25`	DAGK_acc	505	662	1.4e-55	188.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39017`	拟南芥	Diacylglycerol kinase 1	69.199%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FFN7`	拟南芥	Diacylglycerol kinase 2	51.046%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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