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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_027778
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 23857926-23862303 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2811 bp · LXL04_027778|LXL04_027778|OH1004|cDNA

ATGGTTCACAAGATGAGCGTCAGTGCGCCTGTGACACCAGCAACCAAGATCCGAAGGACCCCTTCTTCAACTCCAAGTCATCCAAGAATCGCGGAGGAGAAAATCCTGGTCACCGTTAGGATCCGGCCATTAACGCATAGAGAGCTCGCTGCCTATGATCTTATTGCTTGGGATTGCACCGATGAGAACACTGTTGTTTCTAGAAACCTCAATCACGAGCGCCATAACGGAACTTACACTTTCGGTACTATAAAGTCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2811 bp · LXL04_027778|LXL04_027778|OH1004|CDS

ATGGTTCACAAGATGAGCGTCAGTGCGCCTGTGACACCAGCAACCAAGATCCGAAGGACCCCTTCTTCAACTCCAAGTCATCCAAGAATCGCGGAGGAGAAAATCCTGGTCACCGTTAGGATCCGGCCATTAACGCATAGAGAGCTCGCTGCCTATGATCTTATTGCTTGGGATTGCACCGATGAGAACACTGTTGTTTCTAGAAACCTCAATCACGAGCGCCATAACGGAACTTACACTTTCGGTACTATAAAGTCTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

936 aa · LXL04_027778|LXL04_027778|OH1004|PROTEIN

MVHKMSVSAPVTPATKIRRTPSSTPSHPRIAEEKILVTVRIRPLTHRELAAYDLIAWDCTDENTVVSRNLNHERHNGTYTFGTIKSSIRLVQLGRSMNKAPETSPSLLSKELTVYDFKFNIQSITFTSLDSIAATIFAYGQTSSGKTYTMRGIAENVIEDIYDHIKNAVESKFVLKLSALEIYNETVIDLLNRDSGALRLLDDPEKGTVVEKLTEEVIKDSQHLRCLIATCEAQRQVGETSLNDRSSRSHQIIRLTIESS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_027778
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_027778
位置Chr06:23857926-23862303 (-)
描述Similar to NACK2: Kinesin-like protein NACK2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g43210 可能是朝微管正端运动的马达蛋白，作用于NACK-PQR（ANP3-MKK6-MPK4）MAP激酶信号通路；该通路对体细胞胞质分裂，尤其是细胞板的形成和扩展必不可少。
The AtNACK1/HINKEL and STUD/TETRASPORE/AtNACK2 genes, which encode functionally redundant kinesins, are essential for cytokinesis in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-2443.2004.00798.x
Arabidopsis kinesins HINKEL and TETRASPORE act redundantly to control cell plate expansion during cytokinesis in the male gametophyte.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssn042
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
AtMPK4 is required for male-specific meiotic cytokinesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04642.x
At1g18370 可能的端向动力蛋白，在 NACK-PQR (ANP1-MKK6-MPK4) MAP 激酶信号通路中发挥作用，该通路对体细胞细胞质分裂至关重要，特别是对细胞板的形成及其扩展。
Expansion of the cell plate in plant cytokinesis requires a kinesin-like protein/MAPKKK complex.2002 · DOI: 10.1016/s0092-8674(02)00691-8
The AtNACK1/HINKEL and STUD/TETRASPORE/AtNACK2 genes, which encode functionally redundant kinesins, are essential for cytokinesis in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-2443.2004.00798.x
Arabidopsis kinesins HINKEL and TETRASPORE act redundantly to control cell plate expansion during cytokinesis in the male gametophyte.2008 · DOI: 10.1093/mp/ssn042
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
Phosphorylation of a mitotic kinesin-like protein and a MAPKKK by cyclin-dependent kinases (CDKs) is involved in the transition to cytokinesis in plants.2011 · DOI: 10.1073/pnas.1110174108

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0513900 可能对于促进节间分化过程中胞质分裂的进展至关重要。
The rice mutant dwarf bamboo shoot 1: a leaky mutant of the NACK-type kinesin-like gene can initiate organ primordia but not organ development.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci206
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027778 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0000919 cell plate assembly 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007112 male meiosis cytokinesis 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009558 embryo sac cellularization 生物过程
GO:0010245 radial microtubular system formation 生物过程
GO:0048229 gametophyte development 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18370
ath:AT3G43210
dosa:Os01g0513900
nta:107775653
nta:107780313
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.634
排名 1 · LXL04_027778 · OH-1004
细胞核0.314
排名 2 · LXL04_027778 · OH-1004
细胞膜0.081
排名 3 · LXL04_027778 · OH-1004
线粒体0.063
排名 4 · LXL04_027778 · OH-1004
高尔基体0.058
排名 5 · LXL04_027778 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00225.30Kinesin40-375 aa
PF16796.12Microtub_bd114-191 aa
PF11995.14DUF3490753-916 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_027778PF00225.30Kinesin403751.3e-86291.3
LXL04_027778PF16796.12Microtub_bd1141912.7e-1247.6
LXL04_027778PF11995.14DUF34907539165.2e-66222.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LNZ2拟南芥Kinesin-like protein KIN-7B58.221%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8S905拟南芥Kinesin-like protein KIN-7A54.617%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9AWM8水稻Kinesin-like protein KIN-7A53.651%Swiss-Prot强数据库同源证据

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