LXL04_026610 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_026610

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 129485650-129488915 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2001 bp · LXL04_026610|LXL04_026610|OH1004|cDNA

ATGGAGGGAGTGGATTACTTGACTGATGAGAGGAAGACGGCGCAGTTCGATATAGTAGCCATGAAAGTTGCTTGGGCAGGTTCTCGTGAAACTCTTGAAGTATCTGATCGTATGGCCAAGCTGGTTGCGAATGATCCTGTCTTTGAGAAGTTTTCGAGGCCTATGCTTGGTAGGAAAGAGTTGTTCAAGAACACACTTAGAAAAGCTGCTTATGCGTGGAAGTTGATTGTCAGCCTTGGTCTATCTGAAGAAGAGGCCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2001 bp · LXL04_026610|LXL04_026610|OH1004|CDS

ATGGAGGGAGTGGATTACTTGACTGATGAGAGGAAGACGGCGCAGTTCGATATAGTAGCCATGAAAGTTGCTTGGGCAGGTTCTCGTGAAACTCTTGAAGTATCTGATCGTATGGCCAAGCTGGTTGCGAATGATCCTGTCTTTGAGAAGTTTTCGAGGCCTATGCTTGGTAGGAAAGAGTTGTTCAAGAACACACTTAGAAAAGCTGCTTATGCGTGGAAGTTGATTGTCAGCCTTGGTCTATCTGAAGAAGAGGCCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

666 aa · LXL04_026610|LXL04_026610|OH1004|PROTEIN

MEGVDYLTDERKTAQFDIVAMKVAWAGSRETLEVSDRMAKLVANDPVFEKFSRPMLGRKELFKNTLRKAAYAWKLIVSLGLSEEEAKWLRLYIDEPAFTDLHWGMFIPAIEGQGTEEQKQKWLPLAKKMQIIGCYAQTELGHGSNVQGLETTATFDPQTDEFVLHSPTLTSSKWWPGGLGKVSTHAIVYARLIVGGQFHGVHGFIVQLRSLEDHSPVDGITVGDIGLKFGNGAYNTMDNGVLRFDHVRIPRNQMLMRVSQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_026610`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_026610

位置 Chr05:129485650-129488915 (+)

描述 Similar to ACX1: Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g16760`	催化长链和中链酰基辅酶A去饱和为2-反式烯酰基辅酶A。	Long-chain acyl-CoA oxidases of Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00559.x
`At2g35690`	催化酰基辅酶A向 2-反式-烯酰辅酶A的脱氢反应。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026610 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000038 very long-chain fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0001676 long-chain fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0006091 generation of precursor metabolites and energy 生物过程

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0006633 fatty acid biosynthetic process 生物过程

GO:0006635 fatty acid beta-oxidation 生物过程

GO:0007283 spermatogenesis 生物过程

GO:0009062 fatty acid catabolic process 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009620 response to fungus 生物过程

GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0016559 peroxisome fission 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G35690

ath:AT4G16760

mmu:11430

rno:50681

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.770

排名 1 · LXL04_026610 · OH-1004

线粒体0.133

排名 2 · LXL04_026610 · OH-1004

细胞质0.109

排名 3 · LXL04_026610 · OH-1004

内质网0.057

排名 4 · LXL04_026610 · OH-1004

细胞核0.043

排名 5 · LXL04_026610 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14749.12Acyl-CoA_ox_N20-132 aa

PF02770.25Acyl-CoA_dh_M134-236 aa

PF22924.2ACOX_C_alpha1278-439 aa

PF01756.25ACOX479-656 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_026610	`PF14749.12`	Acyl-CoA_ox_N	20	132	5e-32	111.7
LXL04_026610	`PF02770.25`	Acyl-CoA_dh_M	134	236	7.9e-08	33.1
LXL04_026610	`PF22924.2`	ACOX_C_alpha1	278	439	1.8e-67	227.1
LXL04_026610	`PF01756.25`	ACOX	479	656	4.4e-53	180.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O65202`	拟南芥	Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1	76.818%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9ZQP2`	拟南芥	Putative peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1.2	74.063%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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