基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_026499
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 127409020-127414195
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2478 bp · LXL04_026499|LXL04_026499|OH1004|cDNA
ATGGCCGACTCTCAGCAGGTCCGATCCACCACCGACACCAGTAACAACCTCCCTGTTGCAATCGTCCATTGCCTCCCCAGCTACAAGTTCTCCCTCGCGTGGACTAAAGAAATCGTCAACACAATCGAACCTTCAGATCCCTTATATCCAATCCACAGTCCATCTGCTCGGGCCGTGATCGTCATCGGTCTTACCCCGCTCAAATCGGAGCATTTGGACCAGTATCCATCCGTTGAATGCGTTTTTGGAACATCCGCCGG...
CDS
下载 CDS FASTA2478 bp · LXL04_026499|LXL04_026499|OH1004|CDS
ATGGCCGACTCTCAGCAGGTCCGATCCACCACCGACACCAGTAACAACCTCCCTGTTGCAATCGTCCATTGCCTCCCCAGCTACAAGTTCTCCCTCGCGTGGACTAAAGAAATCGTCAACACAATCGAACCTTCAGATCCCTTATATCCAATCCACAGTCCATCTGCTCGGGCCGTGATCGTCATCGGTCTTACCCCGCTCAAATCGGAGCATTTGGACCAGTATCCATCCGTTGAATGCGTTTTTGGAACATCCGCCGG...
825 aa · LXL04_026499|LXL04_026499|OH1004|PROTEIN
MADSQQVRSTTDTSNNLPVAIVHCLPSYKFSLAWTKEIVNTIEPSDPLYPIHSPSARAVIVIGLTPLKSEHLDQYPSVECVFGTSAGVDHIDLVECRRRNIRVASAGDAFSEDVADYAIGLLIDVLRQVSASDRYVRSGLWPVKGDYPLGNKVGGKRVGIVGLGRIGTLVAKRLEPFGCTIGYTSRTKKPQVPYQFHSTVLDLATNSDALILCCSFTEKTRHVIDHDVMKALGKRGIIVNIGRGALMDEKELVKLLTDGE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_026499 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_026499 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:127409020-127414195 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to EXPA7: Expansin-A7 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程 GO:0009828 plant-type cell wall loosening 生物过程 GO:0009853 photorespiration 生物过程 GO:0009854 oxidative photosynthetic carbon pathway 生物过程 GO:0048767 root hair elongation 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0016618 hydroxypyruvate reductase [NAD(P)H] activity 分子功能 GO:0030267 glyoxylate reductase (NADPH) activity 分子功能 GO:0051287 NAD binding 分子功能 GO:0120509 hydroxypyruvate reductase (NADPH) activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G12550 ath:AT1G12560 ath:AT1G62980 osa:107277540 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.484
细胞外0.182
溶酶体／液泡0.134
细胞核0.109
内质网0.082
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00389.372-Hacid_dh55-232 aaPF02826.262-Hacid_dh_C119-292 aaPF00389.372-Hacid_dh375-547 aaPF02826.262-Hacid_dh_C434-607 aaPF29515.1Expansin_N618-708 aaPF03330.25DPBB_1636-720 aaPF01357.28Expansin_C732-809 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_026499 | PF00389.37 | 2-Hacid_dh | 55 | 232 | 5.2e-27 | 94.9 |
| LXL04_026499 | PF02826.26 | 2-Hacid_dh_C | 119 | 292 | 5.9e-98 | 326.1 |
| LXL04_026499 | PF00389.37 | 2-Hacid_dh | 375 | 547 | 5.2e-27 | 94.9 |
| LXL04_026499 | PF02826.26 | 2-Hacid_dh_C | 434 | 607 | 5.9e-98 | 326.1 |
| LXL04_026499 | PF29515.1 | Expansin_N | 618 | 708 | 2.6e-09 | 38.0 |
| LXL04_026499 | PF03330.25 | DPBB_1 | 636 | 720 | 2.6e-20 | 73.2 |
| LXL04_026499 | PF01357.28 | Expansin_C | 732 | 809 | 5.1e-25 | 88.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。