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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_026495
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 127368097-127371349 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2481 bp · LXL04_026495|LXL04_026495|OH1004|cDNA

ATGTCTGCTTTTAATGATGAAGGATCACGTCATCCACAGGGTGTCGAGGTTGTCCCGTTCAAAACATCCGGTGTCCCTCTAAAACTCGTGTTACTCCACGGAAACTTAGACATATGCGTGAAAGAGGCCACCAAACTCCCAAACCTAGACGCATTCAACAAAAAATTCACCCCTCTTTCCGGCACCAGTGACCCATACGTCACCGTATCTGTATCCAACACTGTAATCGGAAAAACTTTTGTCATAAACAACAGCGAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2481 bp · LXL04_026495|LXL04_026495|OH1004|CDS

ATGTCTGCTTTTAATGATGAAGGATCACGTCATCCACAGGGTGTCGAGGTTGTCCCGTTCAAAACATCCGGTGTCCCTCTAAAACTCGTGTTACTCCACGGAAACTTAGACATATGCGTGAAAGAGGCCACCAAACTCCCAAACCTAGACGCATTCAACAAAAAATTCACCCCTCTTTCCGGCACCAGTGACCCATACGTCACCGTATCTGTATCCAACACTGTAATCGGAAAAACTTTTGTCATAAACAACAGCGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

826 aa · LXL04_026495|LXL04_026495|OH1004|PROTEIN

MSAFNDEGSRHPQGVEVVPFKTSGVPLKLVLLHGNLDICVKEATKLPNLDAFNKKFTPLSGTSDPYVTVSVSNTVIGKTFVINNSENPVWMQHFHVPVAHNTTEVLFVVKDSDVVGSQLIGAVGIPAEHLIANSVVKGTFPILNASGQPCKPGAMLDLSIKYTPVDKIVIYRDGVGSDPEFKGVPGTYFPLRRGGKVTLYQDAHVDETLPNLKLDRGLRFVQGDCWRDICDAIRQARRLIYITGWSIYHKVQLVRYGAKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_026495
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_026495
位置Chr05:127368097-127371349 (-)
描述Similar to PLDBETA1: Phospholipase D beta 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g42010 在末端磷酸二酯键处水解甘油磷脂，生成磷脂酸 (PA)。 暂无已核实直接文献
At4g11850 在末端磷酸二酯键处水解甘油磷脂，生成磷脂酸。
Expression and characterization of Arabidopsis phospholipase Dgamma2.2006 · DOI: 10.1016/j.bbalip.2006.09.017
At4g11840 在末端磷酸二酯键处水解甘油磷脂，生成磷脂酸 (PA)。 暂无已核实直接文献
At4g00240 在末端磷酸二酯键处水解甘油磷脂，生成磷脂酸 (PA)。 暂无已核实直接文献
At4g11830 在末端磷酸二酯键处水解甘油磷脂，生成磷脂酸。
Expression and characterization of Arabidopsis phospholipase Dgamma2.2006 · DOI: 10.1016/j.bbalip.2006.09.017

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026495 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006643 membrane lipid metabolic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009395 phospholipid catabolic process 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010044 response to aluminum ion 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0046470 phosphatidylcholine metabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G42010
ath:AT4G00240
ath:AT4G11830
ath:AT4G11840
ath:AT4G11850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.515
排名 1 · LXL04_026495 · OH-1004
细胞膜0.275
排名 2 · LXL04_026495 · OH-1004
细胞核0.221
排名 3 · LXL04_026495 · OH-1004
溶酶体／液泡0.140
排名 4 · LXL04_026495 · OH-1004
高尔基体0.124
排名 5 · LXL04_026495 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00168.37C234-141 aa
PF00614.30PLDc232-815 aa
PF13091.13PLDc_2675-709 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_026495PF00168.37C2341414.2e-1763.0
LXL04_026495PF00614.30PLDc2328153.9e-219729.4
LXL04_026495PF13091.13PLDc_26757091.9e-0834.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P93733拟南芥Phospholipase D beta 167.561%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9T053拟南芥Phospholipase D gamma 165.591%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9T052拟南芥Phospholipase D gamma 364.090%Swiss-Prot强数据库同源证据
O23078拟南芥Phospholipase D beta 263.744%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9T051拟南芥Phospholipase D gamma 263.977%Swiss-Prot强数据库同源证据

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