基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_026112
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 121127080-121133410
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1131 bp · LXL04_026112|LXL04_026112|OH1004|cDNA
ATGGAGCTCTTTCCAGCACAACCAGACTTGTCTCTTCAAATCAGTCCACCCACCACCAAACCCACTTCAAAAACATGGAGAACATCATCAACAACAAAcgatcatcatcatcatcatcatcaagATCACCATGATTTGGATTTGGGAAATCTATGGAAAAGAGCGTTAAACTCTCAACAACTACAGCAACAGCAACAATATAACCACTCAACAAGAAGACCAGAAGTACCTTCTTTCGGGCTTTCATTAACGAACCCTAT...
CDS
下载 CDS FASTA1131 bp · LXL04_026112|LXL04_026112|OH1004|CDS
ATGGAGCTCTTTCCAGCACAACCAGACTTGTCTCTTCAAATCAGTCCACCCACCACCAAACCCACTTCAAAAACATGGAGAACATCATCAACAACAAACGATCATCATCATCATCATCATCAAGATCACCATGATTTGGATTTGGGAAATCTATGGAAAAGAGCGTTAAACTCTCAACAACTACAGCAACAGCAACAATATAACCACTCAACAAGAAGACCAGAAGTACCTTCTTTCGGGCTTTCATTAACGAACCCTAT...
376 aa · LXL04_026112|LXL04_026112|OH1004|PROTEIN
MELFPAQPDLSLQISPPTTKPTSKTWRTSSTTNDHHHHHHQDHHDLDLGNLWKRALNSQQLQQQQQYNHSTRRPEVPSFGLSLTNPIHPSSNSDFHNLLSQNTNSPSSNMSYPNFQQHHQAAGFSSELGFLRPIRGIPVYYQNPPPNFPILANPHHKNQPSLDSCANSTTTSSLIHGNNINNIVRSRFLSSRFPPKRSMRAPRMRWTTTLHARFVHAVELLGGHERATPKSVLELMDVKDLTLSHVKSHLQMYRTVKTTD...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_026112 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_026112 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:121127080-121133410 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to KAN2: Probable transcription factor KAN2 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009943 adaxial/abaxial axis specification 生物过程 GO:0009944 polarity specification of adaxial/abaxial axis 生物过程 GO:0009956 radial pattern formation 生物过程 GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程 GO:0010158 abaxial cell fate specification 生物过程 GO:0010229 inflorescence development 生物过程 GO:0048440 carpel development 生物过程 GO:0048481 plant ovule development 生物过程 GO:0080060 integument development 生物过程 GO:1905392 plant organ morphogenesis 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G32240 ath:AT4G17695 ath:AT5G16560 ath:AT5G42630 dosa:Os09g0395300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.981
细胞质0.082
细胞膜0.022
内质网0.014
质体0.010
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00249.38Myb_DNA-binding203-254 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_026112 | PF00249.38 | Myb_DNA-binding | 203 | 254 | 1.5e-06 | 28.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9C616 | 拟南芥 | Probable transcription factor KAN2 | 48.900% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q93WJ9 | 拟南芥 | Transcription repressor KAN1 | 49.038% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q941I2 | 拟南芥 | Probable transcription factor KAN3 | 42.125% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9FJV5 | 拟南芥 | Probable transcription factor KAN4 | 43.523% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q0J235 | 水稻 | Probable transcription factor RL9 | 46.222% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |