基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_025960
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 119069252-119081539
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3654 bp · LXL04_025960|LXL04_025960|OH1004|cDNA
ATGAAGACAACTACCATTTTTCTGGCAATAGTTCTGTTGCTTCTCTTCGATCATGTTCGATCCAACAGTCATACCTCGGAAACTCACCTTGCTTCTTCATCGGAGCAGCCTTATCGGACGGCTTTTCACTTCCAGCCTCCCAAAAACTGGATGAACGGACCAATGTACTACAATGGAGTATACCATCTCTTCTATCAACAAAACCCATATGGTCCTCTCTTCTCTAATCATATGTACTGGGGACATTCCATATCATACGA...
CDS
下载 CDS FASTA3654 bp · LXL04_025960|LXL04_025960|OH1004|CDS
ATGAAGACAACTACCATTTTTCTGGCAATAGTTCTGTTGCTTCTCTTCGATCATGTTCGATCCAACAGTCATACCTCGGAAACTCACCTTGCTTCTTCATCGGAGCAGCCTTATCGGACGGCTTTTCACTTCCAGCCTCCCAAAAACTGGATGAACGGACCAATGTACTACAATGGAGTATACCATCTCTTCTATCAACAAAACCCATATGGTCCTCTCTTCTCTAATCATATGTACTGGGGACATTCCATATCATACGA...
1217 aa · LXL04_025960|LXL04_025960|OH1004|PROTEIN
MKTTTIFLAIVLLLLFDHVRSNSHTSETHLASSSEQPYRTAFHFQPPKNWMNGPMYYNGVYHLFYQQNPYGPLFSNHMYWGHSISYDLINWIPLDLAIAPTEPFDIISCWSGSATILPGNIPAILYTGIDSENRQVQNLAFPKNLSDPNLEEWVKYTGNPVINLPDGIQPDDFRDPTTAWLADDGKWRILVGSQKEKTGIAFVYQSEDFVNWIKYDSPIYTVPGTGVWECPDFFPVWVDSTKGVDTSVMNSKVKHVLKVG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_025960 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_025960 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:119069252-119081539 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to 6-FEH: Fructan 6-exohydrolase | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分 GO:0048046 apoplast 细胞组分 GO:0004564 beta-fructofuranosidase activity 分子功能 GO:0033949 fructan beta-(2,6)-fructosidase activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ag:CAD48404 ath:AT1G55120 ath:AT3G13790 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
溶酶体／液泡0.372
细胞外0.228
细胞质0.162
内质网0.143
细胞膜0.117
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00251.27Glyco_hydro_32N43-356 aaPF08244.20Glyco_hydro_32C360-552 aaPF00251.27Glyco_hydro_32N627-940 aaPF08244.20Glyco_hydro_32C947-1137 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_025960 | PF00251.27 | Glyco_hydro_32N | 43 | 356 | 1.1e-186 | 620.3 |
| LXL04_025960 | PF08244.20 | Glyco_hydro_32C | 360 | 552 | 8.1e-50 | 169.7 |
| LXL04_025960 | PF00251.27 | Glyco_hydro_32N | 627 | 940 | 1.1e-186 | 620.3 |
| LXL04_025960 | PF08244.20 | Glyco_hydro_32C | 947 | 1137 | 8.1e-50 | 169.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q67XZ3 | 拟南芥 | Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme CWINV3 | 54.797% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q43866 | 拟南芥 | Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme CWINV1 | 52.708% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q0J360 | 水稻 | Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 7 | 50.829% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
A2YZ01 | 水稻 | Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 7 | 51.013% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |