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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_025933
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 118673721-118676948 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1773 bp · LXL04_025933|LXL04_025933|OH1004|cDNA

ATGGCCATTCTCCTTAAATATTTTCAATGGTCATTGACATCATACATTCTATTGCTATGTTGTTTGGTGGACATATGTCAAGGTCTCACTCCAGATGGTGAAGCTTTGGTTAACTTCAGGACAAGTATAATTAGTTCGGATGAGGTTCTTGGTGAATGGAGACCAGAGGATCCTGATCCATGTGGATGGAAAGGAGTAACATGTGATCCAAAAACCATGAGAGTTGTATCTTTGAATGTTTCAAATCACAAATTAAAGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1773 bp · LXL04_025933|LXL04_025933|OH1004|CDS

ATGGCCATTCTCCTTAAATATTTTCAATGGTCATTGACATCATACATTCTATTGCTATGTTGTTTGGTGGACATATGTCAAGGTCTCACTCCAGATGGTGAAGCTTTGGTTAACTTCAGGACAAGTATAATTAGTTCGGATGAGGTTCTTGGTGAATGGAGACCAGAGGATCCTGATCCATGTGGATGGAAAGGAGTAACATGTGATCCAAAAACCATGAGAGTTGTATCTTTGAATGTTTCAAATCACAAATTAAAGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

590 aa · LXL04_025933|LXL04_025933|OH1004|PROTEIN

MAILLKYFQWSLTSYILLLCCLVDICQGLTPDGEALVNFRTSIISSDEVLGEWRPEDPDPCGWKGVTCDPKTMRVVSLNVSNHKLKGLISPYIGKLDNLKFLDLHYNNFYGEIPPELGNCTGLQGLFLQNNYLSGYIPTGLGNLSNLQTLDISSNSLDGRIPTSIGNLRNLLNLNVSSNFLAGPIPTDGVLGRFGSNSFVGNSDLCGNQINKLCKDETVNQQPTGGQNVKKNSGRLLVSASATVGALLLVALMCFWGCFL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_025933
TK1151 IDTkA06G036600
OH-1004 IDLXL04_025933
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_025933
位置Chr05:118673721-118676948 (-)
描述Similar to FEI1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31420 参与细胞壁功能和纤维素生物合成相关的信号转导；该信号可能涉及1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC，乙烯前体）。
Two leucine-rich repeat receptor kinases mediate signaling, linking cell wall biosynthesis and ACC synthase in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.063354
At2g35620 参与细胞壁功能和纤维素生物合成相关的信号转导；该信号可能涉及1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC，乙烯前体）。
Two leucine-rich repeat receptor kinases mediate signaling, linking cell wall biosynthesis and ACC synthase in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.063354

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0457800 LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。
Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4
An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
Os08g0174700 LRR 受体激酶参与防御反应。
Engineering OsBAK1 gene as a molecular tool to improve rice architecture for high yield.2009 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2009.00444.x
A subset of OsSERK genes, including OsBAK1, affects normal growth and leaf development of rice.2011 · DOI: 10.1007/s10059-011-0178-4
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025933 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010192 mucilage biosynthetic process 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0040008 regulation of growth 生物过程
GO:0045089 positive regulation of innate immune response 生物过程
GO:0048354 mucilage biosynthetic process involved in seed coat development 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31420
ath:AT2G35620
dosa:Os04g0457800
dosa:Os08g0174700
osa:4336035
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.877
排名 1 · LXL04_025933 · OH-1004
内质网0.088
排名 2 · LXL04_025933 · OH-1004
细胞质0.063
排名 3 · LXL04_025933 · OH-1004
细胞核0.038
排名 4 · LXL04_025933 · OH-1004
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · LXL04_025933 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_231-69 aa
PF13855.13LRR_8122-179 aa
PF23598.2LRR_14137-179 aa
PF00069.32Pkinase305-570 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr306-571 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_025933PF08263.18LRRNT_231696.7e-1143.0
LXL04_025933PF13855.13LRR_81221794.6e-0627.0
LXL04_025933PF23598.2LRR_141371791.1e-0938.2
LXL04_025933PF00069.32Pkinase3055706.9e-46157.5
LXL04_025933PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3065713.1e-41142.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGF4拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 172.968%Swiss-Prot强数据库同源证据
C0LGL9拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 270.812%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XV05水稻LRR receptor kinase SERK235.420%Swiss-Prot中等数据库同源证据
B8BB68水稻LRR receptor kinase BAK135.628%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q6Z4U4水稻LRR receptor kinase BAK135.628%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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