基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_024755
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 98116357-98121183
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2016 bp · LXL04_024755|LXL04_024755|OH1004|cDNA
ATGAATTCTGCAGGTACAATGAGTTTACCATTGGCTAACAACCGGAGAGATCGCTTCGTCTCACCTAACTTGGGCAGGATTACGTATGGAACTTCTATCCCTCATTCAGCTGTCATTGCTCGCACTGCTGCCTCTCTCGCTGTATGGTATCAGCAGTGGTGGGAACCTGTTTGTGCCGTGGTGGCATTACTATCTACGTTGATAACAGCACTACAGTTTTCGTTTTTCGAGGTGTCACCTAAAACGCTGACATACTTGGA...
CDS
下载 CDS FASTA2016 bp · LXL04_024755|LXL04_024755|OH1004|CDS
ATGAATTCTGCAGGTACAATGAGTTTACCATTGGCTAACAACCGGAGAGATCGCTTCGTCTCACCTAACTTGGGCAGGATTACGTATGGAACTTCTATCCCTCATTCAGCTGTCATTGCTCGCACTGCTGCCTCTCTCGCTGTATGGTATCAGCAGTGGTGGGAACCTGTTTGTGCCGTGGTGGCATTACTATCTACGTTGATAACAGCACTACAGTTTTCGTTTTTCGAGGTGTCACCTAAAACGCTGACATACTTGGA...
671 aa · LXL04_024755|LXL04_024755|OH1004|PROTEIN
MNSAGTMSLPLANNRRDRFVSPNLGRITYGTSIPHSAVIARTAASLAVWYQQWWEPVCAVVALLSTLITALQFSFFEVSPKTLTYLEGVEGFILLHTCLHSILVYINLPREKRRRYILCYILPRCFMSLPWVFFYYITGRKIFRWILLLRMLRLEKVHRLFSVTEDSRVGFISTRYLKTLVVKLIAFHLGACIFFFSAITIPVGQEGKTWLGSLTLGEISYSNFRHVGFLRLYIICLYFSAITITTIGYGDIHPVTSFDM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_024755 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_024755 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr05:98116357-98121183 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to GORK: Potassium channel GORK | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程 GO:0006813 potassium ion transport 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0010118 stomatal movement 生物过程 GO:0051592 response to calcium ion 生物过程 GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程 GO:1902458 positive regulation of stomatal opening 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G02850 ath:AT5G37500 dosa:Os04g0445000 dosa:Os06g0250600 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.452
内质网0.216
细胞质0.186
溶酶体／液泡0.156
高尔基体0.126
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00520.38Ion_trans52-265 aaPF07885.23Ion_trans_2233-267 aaPF00027.36cNMP_binding361-448 aaPF12796.14Ank_2499-575 aaPF13857.13Ank_5503-553 aaPF00023.37Ank511-544 aaPF13606.13Ank_3511-541 aaPF13637.13Ank_4516-566 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_024755 | PF00520.38 | Ion_trans | 52 | 265 | 9.3e-10 | 38.8 |
| LXL04_024755 | PF07885.23 | Ion_trans_2 | 233 | 267 | 5.9e-09 | 36.4 |
| LXL04_024755 | PF00027.36 | cNMP_binding | 361 | 448 | 1.1e-12 | 48.4 |
| LXL04_024755 | PF12796.14 | Ank_2 | 499 | 575 | 6.9e-25 | 88.2 |
| LXL04_024755 | PF13857.13 | Ank_5 | 503 | 553 | 1.5e-17 | 64.2 |
| LXL04_024755 | PF00023.37 | Ank | 511 | 544 | 1.6e-24 | 85.3 |
| LXL04_024755 | PF13606.13 | Ank_3 | 511 | 541 | 1e-17 | 62.9 |
| LXL04_024755 | PF13637.13 | Ank_4 | 516 | 566 | 8.7e-20 | 71.1 |
| LXL04_024755 | PF00023.37 | Ank | 545 | 576 | 1.6e-24 | 85.3 |
| LXL04_024755 | PF13637.13 | Ank_4 | 585 | 634 | 8.7e-20 | 71.1 |
| LXL04_024755 | PF12796.14 | Ank_2 | 586 | 638 | 6.9e-25 | 88.2 |
| LXL04_024755 | PF13857.13 | Ank_5 | 600 | 638 | 1.5e-17 | 64.2 |
| LXL04_024755 | PF00023.37 | Ank | 613 | 638 | 1.6e-24 | 85.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。