LXL04_024726 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_024726

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 97545938-97549154 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1602 bp · LXL04_024726|LXL04_024726|OH1004|cDNA

ATGGCGGGGGGTGCAAGTGAGGGTTCACGGCAACTTGATCAGACGCCGACATGGGCTGTTGCTGGTGTTTGTGCAATCATCATCGTCGTCTCCATAGCTTTAGAGAAATTTCTTCACAAACTTGGAAAGTTTTTCACAGACAAACACAAGAAATCAATGTTTGAAGCTTTAGAGAAAGTCAAAGCTGAATTGATGGTTCTGGGGTTTATCTCACTACTGTTGACTTTTAGTCAATCTTACATCGTGAAAATCTGCATCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1602 bp · LXL04_024726|LXL04_024726|OH1004|CDS

ATGGCGGGGGGTGCAAGTGAGGGTTCACGGCAACTTGATCAGACGCCGACATGGGCTGTTGCTGGTGTTTGTGCAATCATCATCGTCGTCTCCATAGCTTTAGAGAAATTTCTTCACAAACTTGGAAAGTTTTTCACAGACAAACACAAGAAATCAATGTTTGAAGCTTTAGAGAAAGTCAAAGCTGAATTGATGGTTCTGGGGTTTATCTCACTACTGTTGACTTTTAGTCAATCTTACATCGTGAAAATCTGCATCCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

533 aa · LXL04_024726|LXL04_024726|OH1004|PROTEIN

MAGGASEGSRQLDQTPTWAVAGVCAIIIVVSIALEKFLHKLGKFFTDKHKKSMFEALEKVKAELMVLGFISLLLTFSQSYIVKICIPDSLADTMLPCAVREKTSKKEKSEGIHRLLLWHEQRRYLAESSPSTCKEGKVPIITVDGLHQLHILIFFLAVFHVAYSAITMTLGRLKIRGWKHWEQETSTHNYEFHDDHSRFRLTHETSFVKAHTSFWTRFPFFFYIGCFFRQFFRSVSKSDYLTVRNGFINVHLARGSKFNF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_024726`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_024726

位置 Chr05:97545938-97549154 (+)

描述 Similar to MLO8: MLO-like protein 8

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g17480`	可能参与病原防御和叶细胞死亡的调节。	暂无已核实直接文献
`At5g65970`	可能参与病原防御和叶细胞死亡的调节。	暂无已核实直接文献
`At2g17430`	可能参与病原防御和叶细胞死亡的调节。	暂无已核实直接文献
`At2g33670`	可能参与病原防御和叶细胞死亡的调节。	暂无已核实直接文献
`At1g42560`	可能参与病原防御和叶细胞死亡的调节。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024726 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:0010483 pollen tube reception 生物过程

GO:0072659 protein localization to plasma membrane 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0012505 endomembrane system 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G42560

ath:AT2G17430

ath:AT2G17480

ath:AT2G33670

ath:AT5G65970

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.813

排名 1 · LXL04_024726 · OH-1004

内质网0.118

排名 2 · LXL04_024726 · OH-1004

细胞质0.104

排名 3 · LXL04_024726 · OH-1004

溶酶体／液泡0.056

排名 4 · LXL04_024726 · OH-1004

高尔基体0.049

排名 5 · LXL04_024726 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03094.21Mlo10-460 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_024726	`PF03094.21`	Mlo	10	460	1.9e-198	660.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22757`	拟南芥	MLO-like protein 8	57.818%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FKY5`	拟南芥	MLO-like protein 10	57.519%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O22752`	拟南芥	MLO-like protein 7	56.130%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`O22815`	拟南芥	MLO-like protein 5	56.277%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q94KB4`	拟南芥	MLO-like protein 9	58.427%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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